allele
|
相关的个体或菌株含有相同基因的稳定的其它形式,该形式区别于这一位置的现有的序列
(
和或许其它序列
)
|
attenuator
|
存在调节转录的终止的
DNA
区域,它控制了一些细菌操纵子的表达;位于启动子和第一个结构基因之间,引起转录的部分终止的序列区段
|
C_region
|
免疫球蛋白轻和重链的恒定区,和
T-
细胞受体
α
,
β
,和
γ
链;根据特定的链可包括一个或多个外显子
|
CAAT_signal
|
CAAT
盒;位于可能参与
RNA
聚合酶结合的真核生物转录单位的起始点的
75bp
上游的保守序列的一部分;共有序列
=GG(C
或
T)CAATCT
|
CDS
|
编码序列;对应于蛋白质中的氨基酸序列的核苷酸的序列
(
位置包括终止密码子
)
;特征包括氨基酸概念上的翻译
|
conflict
|
在这一位点或区域,单独确定的
“
相同
”
序列有所不同
|
D-loop
|
置换环;线粒体
DNA
内的一个区域,其中
RNA
的短的序列与
DNA
的一条链配对,代替了这一区域的原始配对
DNA
链;也用于说明在
RecA
蛋白质催化的反应中,侵入的单链替代双链
DNA
的一条链的区域
|
D-segment
|
免疫球蛋白重链的多变区,和
T-
细胞受体的
β
链
|
enhancer
|
顺式
-
作用序列,它增强了
(
一些
)
真核生物启动子的作用,并能在任一方向和与启动子相关的任何位置处
(
上游或下游
)
起作用
|
exon
|
编码剪接
mRNA
部分的基因组区域;可以含有
5'UTR
,所有
CDS
,和
3'UTR
|
GC_signal
|
GC
盒;位于真核生物转录单位起始点上游的保守的富含
GC
区域,可以以多重拷贝
或任一方向存在;共有序列
=GGGCGG
|
gene
|
鉴定为基因的生物学意义的区域,并已经指定名称
|
iDNA
|
间插
DNA
;通过几种重组中的任何一种能被消除的
DNA
|
intron
|
被转录的
DNA
区段,但通过同时剪接位于其两侧的序列
(
外显子
)
即可从转录本内部将其除去
|
J_segment
|
免疫球蛋白轻链和重链的连接区段,和
T-
细胞受体
α
,
β
和
γ
链
|
LTR
|
长的末端重复,在确定序列的两端直接重复的序列,类型典型地见于逆转录病毒中
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mat_peptide
|
成熟的肽或蛋白质的编码序列;翻译后修饰之后成熟的或最终的肽或蛋白质产物的编码序列;位置不包括终止密码子
(
与相应的
CDS
不同
)
|
misc_binding
|
不能用任何其它
Binding
关键词
(primer_bind
或
protein_bind)
表述的与另一个组成成分共价或非
-
共价结合的核酸中的位点
|
misc_difference
|
特征序列与记载中存在的有所不同,并且不能用任何其它不同关键词
(conflict
,
unsure
,
old_sequence
,
mutation
,
variation
,
allele
或
modified_base)
表述
|
misc_feature
|
不能用任何其它的特征关键词表述的具有生物学意义的区域;新的或少见的特征
|
misc_recomb
|
任何一般性的,位点特异性的或复制的重组事件的位点,该位点中有不能用其它重组关键词
(iDNA
和
virion)
或来源关键词的修饰词
(/insertion_seq
,
/transposon
,
/proviral)
表述的双螺旋
DNA
的断裂和愈合
|
misc_RNA
|
不能用其他
RNA
关键词
(prim_transcript
,
precursor_RNA
,
mRNA
,
5'clip
,
3'clip
,
5'UTR
,
3'UTR
,
exon
,
CDS
,
sig_peptide
,
transit_peptide
,
mat_peptide
,
intron
,
polyA_site
,
rRNA
,
tRNA
,
scRNA
和
snRNA)
限定的任何转录本或
RNA
产物
|
misc_signal
|
含有控制或改变基因功能或表达之信号的任何区域,所述信号不能用其他
Signal
关键词
(promoter
,
CAAT_signal
,
TATA_signal
,
-35_signal
,
-10_signal
,
GC_signal
,
RBS
,
polyA_signal
,
enhancer
,
attenuator
,
terminator
,和
rep_origin)
表述
|
misc_structure
|
不能用其他
Structure
关键词
(stem_loop
和
D-loop)
表述的任何二级或三级结构或构象
|
modified_base
|
被指示的核苷酸是经修饰的核苷酸,并应由被指示的分子
(
在
mod_base
修饰词意义中给出
)
所取代
|
mRNA
|
信使
RNA
;包括
5'
非翻译区
(5'UTR)
,编码序列
(CDS
,外显子
)
和
3'
非翻译区
(3'UTR)
|
mutation
|
在此位置处,相关品系的序列中具有突发的,可遗传的变化
|
N_region
|
在重排的免疫球蛋白区段之间插入的额外的核苷酸
|
old_sequence
|
在此位置处,所表述的序列修改了此序列以前的版本
|
polyA_signal
|
聚腺苷酸化之后内切核酸酶裂解
RNA
转录本所必需的识别区域;共有序列
=AATAAA
|
polyA_site
|
RNA
转录本上的位点,通过转录后聚腺苷酸化该位点将被加上腺嘌呤残基
|
precursor_RNA
|
仍不是成熟的
RNA
产物的任何
RNA
种类;可包括
5'
剪切区
(5'clip)
,
5'
非翻译区
(5'UTR)
,编码序列
(CDS
,外显子
)
,间插序列
(
内含子
)
,
3'
非翻译区
(3'UTR)
,和
3'
剪切区
(3'clip)
|
prim_transcript
|