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8分“网络毒理学”纯生信,2个月拿下!就凭10年前的分子对接套路,网络毒理学还是得投环境对口期刊,发文超省力!

生信图书馆  · 公众号  ·  · 2025-02-11 19:00

正文

馆长最近分享的 网络毒理学 文章也比较多了,也总结了一些网络毒理学友好期刊,这次一并分享给大家,期刊选的好,短平快的套路发高分也毫不费力,文章分数翻倍也有可能哦,快来抄作业吧!

5分档 Toxicology ,中科院3区,IF=4.8,可接受纯生信;

6分档 Ecotoxicology and Environmental Safety ,中科院2区,IF=6.2分,一般要加点简单实验;

8分档 Chemosphere ,已被剔除SCI,之前是中科院2区,IF=8.1分,不要再投;

Science of The Total Environment ,中科院1区,IF=8.2分,on hold状态,暂时不建议投稿;

Journal of Environmental Management ,中科院2区,IF=8分,可接受纯生信;

10分档 Journal of Hazardous Materials ,中科院1区,IF=12.2分,可接受纯生信;

大家有没有发现,馆长列出来的这些期刊都是环境方向期刊,跟网络毒理学很对口,并且相较于去生信友好刊中去跟其他生信竞争,选这种环境对口期刊发文竞争更小,不用去卷思路和实验,哪怕就用10年前的分子对接套路都能纯生信发文,这是大多数生信热点想都不敢想的事情,所以说,馆长 强烈建议大家,网络毒理学发文优先去尝试投稿环境对口期刊,不行了再考虑其他生信友好刊!

下面看个Journal of Environmental Management杂志上刚发表的网络毒理学文章,依然是网络毒理学+分子对接套路,仅用2个月就拿下了8分Top刊,就是这么神奇啊~

这篇文章研究的是PET微塑料(PET-MPs)暴露对椎间盘退变(IVDD)的毒理学影响, 研究目标是PET-MPs,目前微塑料的问题社会和科研关注度都比较高,有一定的研究意义和价值,是个不错的选题 ;思路设计为网络毒理学+分子对接, 仍然是老套路,超级超级简单,换个疾病,或者换个毒性物质就能复制一篇,复现容易程度max!就这点分析难度和工作量,看的馆长都想自己下场来一篇了·· ·

网络毒理学思路已就位,现在正是最好发文的时候,一点都不卷,工作量不大,分析又简单,纯生信都能发文,性价比这么高,你还在等什么呢? 想不卷就发文的朋友抓紧尝试复现它哦!什么?你说不知道如何设计网络毒理学课题也没时间学生信分析?那还等什么,找馆长来帮你啊,咱有专业团队,思路设计、定制分析、生信服务器等个性化服务应有尽有,随时等待你的召唤

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题目:评估PET-MPs暴露对IVDD的毒理学影响:来自网络毒理学和分子对接的见解

杂志:Journal of Environmental Management(IF=8)

发表日期:2024年12月

研究背景

聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料(PET-MPs)由于其持久性和潜在的健康危害,已经成为一个重大的环境问题。它们在退行性疾病,特别是椎间盘退变(IVDD)中的作用仍然知之甚少,这突出了对它们的分子毒性进行系统评估的需要。

研究思路

该研究整合了来自GEO、 ChEMBL 、STITCH、GeneCards 和 OMIM 数据库的数据,确定了与 PET-MPs 暴露和 IVDD 相关的潜在靶点。然后构建PPI网络识别核心靶点,并进行GO和KEGG富集分析。利用 Autodock 进行分子对接分析PET-MPs和核心靶点之间的结合。 (ps:生信想做的又快又好?那可离不了生信服务器!有需要直接找馆长,共享/独享都可以,附带一对一技术指导,咨询就享优惠!)

主要结果

1. 从ChEMBL和SwissTargetPrediction数据库筛选了74个与PET相关的潜在靶点,从GEO数据集获得IVDD相关DEGs,两者取交集,确定了与PET-MPs暴露和IVDD相关的46个潜在靶点

图1:从GEO数据集获得IVDD相关DEGs

图2:与PET-MPs暴露和IVDD相关靶点的鉴定

2. PPI网络分析识别7个核心靶标,包括AKT1、CASP3和SRC

图3:PPI网络识别核心靶点

3. 对46个潜在靶点的GO和KEGG综合分析显示,PET-MPs影响免疫相关途径,如Ras信号传导、凋亡、VEGF受体信号传导和中性粒细胞胞外陷阱(NET)形成

图4:GO分析

图5:KEGG分析

4. 基于 KEGG 途径筛选的结果,选择四种关键的膜受体(GPCR、RTK、VEGFR 和 VEGFR2)进行分子对接分析,结果证实了PET-MPs与这些核心靶的强结合亲和力,表明其有可能破坏关键的细胞过程

图6:分子对接

小结

就这工作量都能发8分纯生信,还只用了2个月就就接受了,也太超值了吧!这么简单的网络毒理学发文套路实在是没有对手,属于“短平快”套路中的天花板了,正值发文红利期,早上车早发高分,上车太晚很可能像网药一样被卷! 这点工作量如果是生信熟手或者是搞生信的团队去做,估计几天就能完成分析,如果用上服务器估计会更快 (生信服务器有需要可以联系馆长) ,加上写作投稿时间,2个多月就能完成1篇文章,一年来个几篇也很有可能!之前是搞实验的团队也不要被生信吓退,复现其实也不难, 实在没时间学生信实操也可以找馆长团队帮忙,可评估设计思路,可定制生信分析,专业团队经验丰富,有需要随时call馆长!

馆长有话说

馆长会持续为大家带来最新生信思路,也可以提供特色数据库构建、免费思路评估、付费生信分析等服务,对数据库构建和生信分析感兴趣的朋友可以咨询馆长哦!







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