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博士开题和基金申请的制胜宝典:衰老相关分泌表型热点全揭秘

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2025-01-03 11:00

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衰老是临床研究的重要主题,也是很多疾病的风险因素,从个体的衰老,到组织器官衰老,再到细胞衰老,从宏观到微观,都是博士开题和基金申请的热点领域,其中 衰老相关分泌表型(SASP)是研究衰老最常见的切入角度和主题 ,所以本期就围绕衰老相关分泌表型(SASP)进行科普总结。


一、什么是SASP?


1. SASP的概念


衰老相关分泌表型(Senescence-Associated Secretory Phenotype,SASP)是指衰老细胞在进入衰老状态后分泌的一系列生物活性分子,这些分子不仅改变了衰老细胞自身的行为,还对周围组织和细胞产生了广泛的影响。

图1. 衰老相关分泌表型(Senescence-Associated Secretory Phenotype,SASP,PMID: 38543098)


2.SASP涉及到的分子


SASP作为细胞衰老的标志之一,包括


(1)细胞因子 SASP中常见的细胞因子包括IL-6、IL-1α、IL-8和TNF-α等。这些因子能够促进炎症反应,影响免疫系统的功能,进而加速衰老相关疾病的发生。


(2)趋化因子: 如CXCL1和CXCL8等,这些因子能够吸引免疫细胞到达衰老细胞的部位,进一步加剧局部的炎症反应。


(3)基质金属蛋白酶(MMPs): 这些酶在细胞外基质的重塑中起重要作用,能够影响细胞的迁移和增殖。


(4)其他生物活性分子: SASP还包括一些促凋亡因子,如Noxa等,这些因子在衰老细胞的清除和组织修复中发挥作用。


可以影响邻近细胞的增殖与分化,对器官衰老和肿瘤的发生发展产生双向性的调控。SASP的分泌可以导致机体慢性低度炎症和疾病,并可以反作用于衰老细胞及其邻近细胞加速它们的衰老进程。SASP的产生与细胞衰老过程中的多种因素有关,包括DNA损伤、致癌信号转导、端粒缩短等。


二、如何研究SASP?


1. 如何确定病理过程中发生了SASP表型?


(1)组学和生信分析

通过组学技术并结合生信分析,研究SASP发生的细胞类型、SASP相关通路的活化情况,SASP相关指标表达,以及调控SASP过程的关键基因。


(2)形态学


1)细胞形态变化 衰老细胞通常表现出较大的细胞体积和不规则的形状。

图2.正常胶质母细胞瘤细胞(左);衰老的胶质母细胞瘤细胞(右)(PMID: 32744147)


2)细胞核特征 细胞核增大,且染色质结构变得更为松散,出现核内斑点。

图3.正常细胞核的形态(左);衰老的细胞核(右)(PMID: 12809602)


(3)分子指标和通路


1)β-半乳糖苷酶活性 衰老细胞中常检测到β-半乳糖苷酶活性增加,通常通过组织切片或细胞染色来评估。

图4 正常细胞的SA-β-gal染色为阴性(左);衰老的胶质母细胞瘤细胞为阳性(右)(PMID: 32744147)


2)SASP 衰老细胞中常检测到SASP相关指标显著提高。

图5 免疫荧光检测衰老前期(PRE)和衰老期(SEN)细胞中SASP的相关指标(PMID: 20078217)


3)细胞衰老途径: p53和p16途径对SASP的调控

图6 检测细胞衰老途径中p53、p21、p16和pRb及SASP效应因子的表达(PMID: 35426375)


2 如何筛选和验证发生SASP表型的细胞是什么?


(1)生信分析


1)通过单细胞测序识别和表征不同细胞类型及其SASP特征。 通过对细胞群体进行聚类分析,可以发现特定的SASP相关基因表达模式,从而筛选出具有SASP表型的细胞。

图7 通过单细胞转录组测序识别和表征Cdkn2a+细胞的不同类型及其SASP特征(PMID: 37524694)


2)使用细胞间通讯分析(如CellChat)揭示SASP因子在细胞间的相互作用 ,进一步验证细胞的SASP表型。

图8 CellChat分析寻找Cdkn2a+群体中分泌活动最显著的细胞(PMID: 37524694)


3)利用生物信息学工具进行基因富集分析,识别与SASP相关的基因集。 例如,SenMayo基因集在多个人类mRNA测序队列中显示出显著富集。

图9 SenMayo基因集在小鼠不同组织中的衰老相关富集分析(PMID: 35974106)


(2)湿实验验证


1)通过体外培养细胞并诱导其衰老来筛选SASP细胞 ,常用的方法有:


氧化应激:

过氧化氢(H2O2):处理细胞以增加活性氧(ROS)水平,导致细胞内氧化损伤。

其他氧化剂:如对苯二酚等。


DNA损伤:

紫外线(UV)照射:引起DNA损伤,尤其是引起DNA双链断裂(DSBs)。

化学药物:如顺铂、博来霉素等,这些药物可以引起DNA损伤和细胞周期阻滞。


营养限制:

葡萄糖限制:通过减少培养基中的葡萄糖含量,诱导细胞代谢应激。

氨基酸限制:减少培养基中特定氨基酸的浓度,模拟营养缺乏状态。


细胞周期阻滞:

细胞周期抑制剂:如阿霉素、紫杉醇等,使细胞停滞在特定的细胞周期阶段,从而诱导衰老。


基因操作:

基因编辑:使用CRISPR/Cas9技术敲除或过表达与衰老相关的基因,如p16、p21等。


细胞接触抑制:

高密度培养:通过增加细胞培养密度,促使细胞达到接触抑制状态,诱导衰老。


应用特定因子:

细胞因子:如TGF-β、IL-6等,可以诱导衰老相关表型。


化学诱导剂:

白藜芦醇、烟酰胺等:这些化合物可以通过不同机制诱导细胞衰老。


机械应力:

物理应力:如拉伸、压缩等,也可以诱导细胞衰老。


2)诱导后,通过ELISA、Western blot等技术进行检测SASP相关指标的表达水平。


3)使用特定的抗衰老药物(如Senolytics,包括Dasatinib、Quercetin)清除衰老细胞,验证SASP的功能,观察其对细胞生长和炎症反应的影响。


3 如何验证发生SASP的细胞在病理特征中的作用?——细胞表型


(1)研究方案


1)选择合适的细胞模型,通过诱导剂诱导其进入衰老状态。


2)检测SASP相关指标表达水平,确认SASP的发生。


3)进行病理特征的评估:可使用共培养系统,分析SASP对邻近细胞增殖、迁移和凋亡的影响;也可以在动物模型中注射SASP诱导剂,观察其对组织病理变化的影响,如炎症反应、纤维化等。


4 如何研究细胞发生SASP的具体机制?——分子思路


(1)研究方案


1)确定主角基因:可通过公共数据库或者组学筛选差异基因并进行验证。


2)主角基因对SASP的影响:敲减/过表达或者药物干预基因表达,比较处理前后SASP相关指标的差异。


3)初步探索主角基因调控SASP的机制:通过转录组学或蛋白质组学,分析并筛选SASP因子对下游信号通路的调控作用。


4)深入验证主角基因调控SASP的方式:寻找主角基因调控SASP的途径,例如通过Co-IP寻找其互作蛋白。


三、如果研究SASP,有哪些可参考范文和基金案例?


1 大子刊、领域顶刊和主刊文章:


(1) SASP相关指标与疾病进展的关系,作为标志物


案例:

Association of Dipeptidylpeptidase 4 (CD26) With Chondrocyte Senescence and Radiographic Progression in Knee Osteoarthritis. Arthritis Rheumatol. 2023 Jul;75(7):1120-1131.


本文通过检测膝骨关节炎(OA)患者关节液中多种SASP成分,如IL-6、IL-8、TNF-α和MMPs,研究它们的水平与OA疾病进展之间的关系,并对比不同阶段OA患者的SASP成分水平,评估这些成分作为OA严重程度标志物的潜力。


(2)SASP在疾病某个病理过程中的作用和机


案例:

EZH2 inhibition remodels the inflammatory senescence-associated secretory phenotype to potentiate pancreatic cancer immune surveillance. Nat Cancer. 2023 Jun;4(6):872-892.


本文讨论了SASP在胰腺导管腺癌(PDAC)中的作用和机制。研究发现,EZH2通过H3K27me3来抑制促炎症SASP基因的表达,从而减少NK细胞和T细胞的浸润和活化,促进了肿瘤细胞的免疫逃逸。


(3)药物通过SASP改善疾病的作用机理


案例1

Senolytic therapy alleviates Aβ-associated oligodendrocyte progenitor cell senescence and cognitive deficits in an Alzheimer's disease model. Nat Neurosci. 2019 May;22(5):719-728.



本文讨论了Senolytics疗法在阿尔茨海默病中的作用和机制。研究发现,达沙替尼和槲皮素通过选择性清除Aβ斑块环境中的衰老少突胶质前体细胞,减少神经炎症和Aβ负荷,从而改善认知功能,减轻阿尔茨海默病的进展


案例2:

Senescence-Induced Vascular Remodeling Creates Therapeutic Vulnerabilities in Pancreas Cancer. Cell. 2020 Apr 16;181(2):424-441.e21.


本文探讨了MEK和CDK4/6抑制剂在胰腺癌中的治疗潜力和作用机制。研究发现,这两种抑制剂通过诱导肿瘤细胞衰老,促进血管重塑和CD8+ T细胞浸润,从而增强化疗和免疫疗法的效果,显著抑制肿瘤生长。


2 基金案例


案例1:化疗介导SASP因子VCAN参与肿瘤与微环境对话促进胰腺癌进展及化疗耐受的机制研究


案例2:衰老相关分泌表型(SASP)介导GLUT1/ACTIN轴调控双硫死亡促进胃癌转移及益气温阳解毒方干预机制研究


案例3:靶向软骨下骨衰老细胞及其衰老相关IL-6分泌表型治疗骨性关节炎的相关机制研究


案例4:WTAP介导转录因子ELF3 m6A修饰调控衰老相关分泌表型促进皮肤成纤维细胞衰老的机制研究


案例5:ZAK-STING正反馈环路促进肾小管上皮细胞衰老相关分泌表型介导AKI向CKD转归的机制研究


案例6:TIFA介导DNA损伤诱发的NF-kappaB激活和衰老相关分泌表型的分子生物学机制



附录一、SASP在哪些疾病中常见?与哪些病理过程有关?

衰老相关分泌表型SASP(衰老相关分泌表型)在多种与衰老相关的疾病中常见,并且与多种病理过程有关。如:


1. 动脉粥样硬化 SASP因子如炎症细胞因子、基质金属蛋白酶和生长因子参与了动脉粥样硬化的发生和发展。


2. 心力衰竭: 内皮细胞衰老在心力衰竭中发挥作用,特别是在射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)中,衰老内皮细胞可能导致病理性重构。


3. 肺动脉高压: 内皮细胞衰老是肺动脉高压的重要因素,通过分泌SASP因子如IL-6、TNF和PAI1推动疾病发展。


4. 代谢性疾病: 内皮细胞衰老可能导致全身代谢功能障碍,如高血糖和血脂异常,这可能与内皮细胞功能障碍和SASP有关。


5. 肿瘤发展: SASP对肿瘤细胞具有双向调节作用,可以促进肿瘤恶性表型的发生和发展,同时激活相关调控通路促进免疫系统清除衰老细胞。


6. 炎症性肠病: SASP在炎症性肠病(IBD)中可能发挥作用,尽管具体机制尚不完全清楚,但SASP因子可能影响肠道菌群和免疫反应。


7. 免疫相关疾病: SASP因子如IL-6、TNF-α等在多种免疫相关疾病中发挥作用,可能导致系统性免疫抑制和组织损伤。


8. 组织修复和再生障碍: SASP通过影响细胞增殖、分化和凋亡,可能在组织修复和再生过程中起阻碍作用。


SASP的分泌可以是衰老细胞对损伤和应激的反应,其结果可能既有积极的一面,如促进组织修复和免疫监视,也有消极的一面,如促进慢性炎症和加速衰老过程。

图10. 衰老相关分泌表型与疾病病理过程关系(PMID: 34663974)


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