分享一个人类蛋白图册数据库

基迪奥生物 · 公众号 · · 2022-07-09 10:00

正文

在上周《分享一个可能对你写综述有帮助的数据库》一文中为大家分享了一个人类疾病信息数据库，MalaCards，非常受欢迎，我这里再为大家分享一个人类蛋白图册数据库（THE HUMAN PROTEIN ATLAS）。

数据库的首页如下：

数据库链接：

https://www.proteinatlas.org/

数据库的使用方法很简单，只需输入基因（蛋白）的名称、id、相关描述信息等关键词（这里以ACE2基因为例）后，点 Search 按钮就可以查看感兴趣基因或蛋白的信息，如果点击 Fileds 可添加更精确的限定范围。

得到的结果如下，图形表格中的第一条记录（Angiotensin I converting enzyme 2，血管紧张素转换酶）就是我们所需的信息。

点击查询记录（表格中第一行，也可点击 Evidence 对应的格子），可进入基因（蛋白）信息汇总（SUMMARY）页面，如下。

点击导航栏中的 TISSUE 版块，就可以查看目标基因（蛋白）在不同组织的特异表达情况，如下。

而基因（蛋白）在不同组织中（不同性别）的表达情况都是以图形的的方式进行展示，非常直观。

当然，我们也可以查看一下其他的信息分区版块，比如在 BRAIN版块可以查看目标基因在不同脑组织区域的表达情况。

而在 SINGLE CELL版块，可以单细胞的视角查看目标基因在不同细胞亚群的表达情况，如下。

当然，还可以在 PATHOLOGY版块查看目标基因相关的病理信息，如这里肾癌和肝癌相关的预后标记信息。

好啦，本次的分享就到这里啦，大家可以试试呀！

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