GO、KEGG富集分析的结果如何看？

基迪奥生物 · 公众号 · · 2024-08-20 18:00

主要观点总结

文章介绍了OmicShare中的GO、KEGG富集分析在线工具的使用及结果解读。工具链接为https://www.omicshare.com/tools/home/report/koenrich.html，并提到了该工具的SCI引用文章已达4500篇，影响因子为23.7。文章主要介绍了如何解读KEGG富集分析的结果图表，包括分析结果统计表、数目统计图、显著性柱状图、显著性气泡图、显著性通路图、网络图和富集圈图等。

关键观点总结

关键观点1: OmicShare中的GO、KEGG富集分析在线工具介绍

文章首先介绍了OmicShare这个交互式、用户友好的在线数据分析可视化工具，特别是其中的GO、KEGG富集分析在线工具，这个工具非常受欢迎，经常被用于基因表达数据分析。

关键观点2: KEGG富集分析结果解读

文章详细解读了KEGG富集分析的结果图表，包括如何理解分析结果统计表、数目统计图、显著性柱状图、显著性气泡图、显著性通路图等。

关键观点3: 网络图和富集圈图的介绍

文章还介绍了网络图和富集圈图，这些图表可以帮助研究人员更深入地理解富集分析的结果。

关键观点4: 基迪奥生物的定制化组学测序服务

最后，文章提到了基迪奥生物是定制化组学测序与生物信息分析服务领域的领先者，涉及多种组学服务，并提供了联系方式。

正文

之前，在《如何进行GO、KEGG富集分析？》、《GO、KEGG富集分析如何显示上下调基因？》等文章为大家介绍过OmicShare中较为受欢迎的GO、KEGG富集分析在线工具（界面如下图）。

工具链接：

https://www.omicshare.com/tools/home/report/koenrich.html

OmicShare是一个交互式、用户友好的在线数据分析可视化工具，目前这个工具的SCI引用文章已达4500篇。而且，关于OmicShare tools的SCI文章也在最近发表了！影响因子23.7！

原文链接DOI：

https://doi.org/10.1002/imt2.228

由于OmicShare的GO、KEGG富集分析工具非常受欢迎，因此，经常有小伙伴在基迪奥生信交流群（群号：492506813）提问如何解读富集分析的结果图表。下面就以KEGG富集分析的结果为例，看下如何理解这些富集分析结果图表吧！

1.分析结果统计表

KEGG富集分析结果的主要统计表如下，表格的第1列为当前通路富集分析到的目的基因数目，第2、3列为KEGG A class 、KEGG B class，第4列为Pathway名称，点击表格中“Pathway”列的pathway名称，可连查看KEGG官网对应的pathway map；其中，Genes列（第10列）为当前通路富集到的基因；此外，我们可以根据Pvalue和FDR（第7列、第8列）的数值筛选感兴趣的条目，并将表格下载到本地。