Nature Cell Biol (IF 19.06):南方医科大学等揭示m6A在人类胎儿组织中的构成

在这里， 研究人员系统地研究了21个人类胎儿组织样本的全转录组m6A谱，揭示了人体组织中动态的m6A甲基化分布情况。 展示了m6A与基因表达稳态之间的联系，通过全基因组关联研究（GWAS）鉴定揭示了人类表达数量性状基因座（eQTL）和单核苷酸多态性（SNP）的组织m6As的富集，并鉴定了调节的启动子特征。在人类中，最近的研究表明m6A在发育和癌症中的重要性。例如，已显示m6A是人类神经体外分化试验中发生所必需的，并且发现m6A甲基化障碍与人类急性髓性白血病有关。 虽然已报道了许多培养的人类细胞系的m6A甲基化组，但对人体组织中m6A的全球分布及其与人类发育和常见疾病的广泛联系的信息仍然有限。

研究人员收集了八个主要人体组织类型（脑，肝，肺，肾，心脏，胃，胎盘和骨骼肌）的样本。使用优化的甲基化RNA免疫沉淀（MeRIP）程序，使用总RNA对组织样品中每个样品进行m6A测序（m6A-seq）（21个MeRIP样品，8-39百万读数）。为了评估数据的一致性，将m6A峰（以下称为m6As）聚集在人体组织样本中，并将这些结果显示为矩阵。正如所料，相同组织类型的样品根据其对应的m6As或输入RNA聚集良好。 与先前的研究一致，在人组织样品中发现m6As的共有基序GG（m6A）CH。总之，这些结果表明研究人员的m6A-seq分析获得了真正的修改。

总之，该研究数据为定义m6A在人类发育和疾病中的作用提供了证据，并揭示了m6A的基因调控。 使用更多的定量测序方法来分析更多的人类样本，包括疾病组织，并将这些数据与其他分子表型（如DNA甲基化和组蛋白修饰）整合在一起， 这将极大地促进人们对m6A功能和m6A功能的理解。

参考信息：

https://www.nature.com/articles/s41556-019-0315-4

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