（一）
分子模拟与蛋白互作研习班通知
蛋白质组学是研究生命科学现象与科学规律的重要途径，在各个研究领域都有广泛应用。有许多蛋白质相关的数据库资源及生物信息学分析工具，在研究蛋白质的鉴定、结构分析与模拟、蛋白与核酸相互作用、与蛋白-蛋白相互作用、分子对接，乃至分子相互作用网络等各个层面为科学研究提供助力。为进一步推进相关研究发展，助力广大科研工作者提高蛋白质组学相关数据分析及生物信息学技能，北京市计算中心生物计算事业部推出“蛋白质组学及分子模拟”研习班。欢迎您参加！
培训时间： 2017.9.1-9.3 上午：9：30-12：00 下午：13：30–17：00
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 蛋白数据库 介绍 | 1、蛋白质结构分析与PDB数据库应用 2、PDB文件格式详解 |
蛋白结构分析软件 | 1、蛋白结构可视化软件Pymol的应用 2、Pymol的APBS插件使用 |
第二天 | 同源建模 | 1、同源建模原理介绍 2、swiss-model在线同源建模 |
分子对接 | 1、 分子对接理论及autodock介绍 2、 Autodock软件与小分子对接 |
第三天 | 虚拟筛选 | 1、autodock vina介绍 2、分子库筛选实例操作 |
蛋白质相互作用与分子网络构建 | 1、大分子相互作用研究 2、蛋白质相互作用数据库概述 3、Cytoskape软件应用与网络构建 |
(课程内容以实际授课为准)
【注】参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【特色】真正实战经验丰富的一线专业团队，与您一起交流、学习、探讨您工作中实际遇到和将要面对的问题。
【报名费用】
培训费3800元/人，（含听课费、资料费、上机费，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）；教材：《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社；附近最近酒店为：如家酒店（永丰店），可自行网上预定，食宿自理。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元；
2、4+1团报，可免费赠送一个名额
3、以上优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
（二）
重测序分析与转录组分析在动植物研究中的应用专题班通知
动植物生物信息学数据分析在科研发展中起着至关重要的意义和作用。然而，对于一直从事动植物科研工作的您，生物信息数据分析阻碍了您的科研进展，为更好的助力科研，推动农业行业发展，我们本着注重实践、充分交流讨论、细心解答的原则。从学员的实际问题出发，真正的解决您的科研苦恼与困扰。赶快来参加我们的培训班吧。真诚的欢迎您的到来！
培训时间：2017年9月4日-6日 上午：9:30-12:00 下午：13:30-17:00
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天上午 | 生物信息学在农业领域中的应用 | 1、生物信息学的前沿动态 2、在农业领域的应用与研究热点分析 |
第一天下午 | 1、生物信息数据库介绍及在农业上的应用 2、生物学软件及使用介绍 |
第二天上午 | 动植物基因组重测序分析 | 1、基因组重测序全套分析原理及流程 2、经典案例分享与方案设计，经典文章分析，包括实验设计思路、实验过程中遇到的困难与解决方案 |
第二天下午 | 1
、数据上机 2、讨论与答疑 |
第三天上午 | 动植物转录组测序分析 | 1、转录组测序全套分析的原理及流程 2、经典案例分享与方案设计，经典文章分析，包括实验设计思路、实验过程中遇到的困难与解决方案 |
第三天下午 | 1、数据上机 2、讨论与答疑 |
(课程内容以实际授课为准)
【注】参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【报名费用】培训费：3800元/人（含听课费、材料费、上机费，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）。 材料：《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。附近最近酒店为：如家酒店（永丰店），可自行网上预定，食宿自理。
(三)
生物信息学与精准医学研习班通知
组学和大数据是精准医学发展的基础，而二者的结合依赖于生物信息学的持续发展。生物信息学已经在生物领域获得广泛应用。医学的发展紧跟科研潮流，生物信息学已经在精准医学中成为焦点，成为精准医学前进的助跑器。北京市计算中心生物计算事业部联合国内精准医学研究一线科学技术人员希望能成为您的科研助力，特推出“生物信息学与精准医学”研习班。授课团队由具有多年遗传学、人类医学及计算科学研究经验的老师领衔，曾成功申请、主持或参与国内外多项重大课题，具有丰富的论文写作、发表经验，授课成员曾参与ENCODE计划，具有多年的NGS数据分析和TCGA使用经验。欢迎您参加！
课程时间： 2017.9.7-9.9 上午：9：30 - 12：00 下午：1：30 – 5：00
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 精准基因组医学研究基础 | 1、基因组信息学概论 2、精准基因组医学的机遇和挑战 |
转录组学测序技术I | 1、二代测序数据介绍 2、转录组测序原理介绍 3、转录组数据分析上机实践 |
第二天 | 转录组学测序技术II | 1、从转录组数据预测lncRNAs |
TCGA项目及数据应用 | 1、TCGA项目及数据介绍 2、TCGA数据在医学应用中的案例分析 |
第三天 | ENCODE计划及应用 | 1、ENCODE计划介绍 2、利用ENCODE和GWAS数据进行疾病全基因组关联分析 |
ENCODE数据应用案例分析 | 1、ENCODE数据在医学应用中的案例分析 |
(课程内容以实际授课为准)
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【特色】真正实战经验丰富的一线专业团队，与您一起交流、学习、探讨您工作中实际遇到和将要面对的问题。
【报名费用】
培训费：3800元/人，含听课费、材料费、上机费。请自带笔记本电脑用以上机实习；材料：《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社；食宿自理，酒店自行预定。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元；
2、4+1团报，可免费赠送一个名额
3、上面优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
（四）
基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班通知
随着深度测序技术的发展与成熟，产生了海量的基因组的数据，通过全基因组重测序的序列比对，研究者可以找到大量的单核苷酸多态性位点（SNP）、拷贝数变异（CNV）、插入缺失（InDel）、结构变异（SV）等变异位点。并通过对已知全基因组序列的物种进行测序，来研究个体或群体间的相关变异信息，从而找出与疾病、性状、以及功能有关的基因，进行个体或群体分子水平的差异分析。随着测序成本的大幅度降低以及测序效率的数量级提升，再加上已知基因组序列的物种增多，全基因组重测序已成为动植物物种遗传差异研究、功能基因挖掘等最可靠的方法。北京市计算中心举办《基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班》，目的就是为统计遗传学领域的专家学者、计算系统生物学家、从事复杂疾病遗传易感性研究的专业人员、生物信息科学工作者、研究生提供一个互相交流的平台，并为今后的项目交流和相互合作创造条件。
本次课程时间： 2017.9.19-9.21 上午：9：30 - 12：00 下午：1：30 – 5：00
日期 | 时间 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 上午 | 生物信息学概述及NGS原理与应用 | 1. 生物信息学知识背景概述； 2. 二代测序（NGS）的基本概况和技术发展简介； 3. NGS建库原理与技术； |
下午 | Linux上机操作及生物信息学软件安装及使用 （上机操作） | 1. linux基础与基本操作； 2. 生物信息学软件应用及常用软件介绍； 3. 重测序相关分析软件介绍及安装； |
第二天 | 上午 | 基因组重测序技术应用理论与策略 | 1.
基因组重测序的理论与研究方法及意义； 2. 全基因组数据分析策略； 3. 全外显子数据分析方法与应用； 4. 目标区域测序的策略应用与技术前沿应用； |
下午 | 基因组变异分析 （上机操作） | 1. 重测序的分析流程； 2. 原始测序数据的质控及过滤； 3. 学习BWA，samtools等工具的使用，进行calling SNP,INDEL； 4. sam/bam文件处理、VCF文件与基因组变异位点分析 |
第三天 | 上午 | 基因组变异分析 （上机操作） | 1. 利用重测序数据检测拷贝数变异（CNV）； 2. 利用重测序数据检测易位、转置等结构变异（SV） |
下午 | 基因组变异注释与功能分析 （上机操作） | 1. 基因组注释工具Annovar的应用； 2. 功能分析工具David的使用； 3. 基因组变异数据库Genecard、HGMD等以及功能分析的应用； 4. 药物基因组学与靶向药突变位点查询； 5. 基因组变异位点筛选与过滤分析 |
(课程内容以实际授课为准)
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【报名费用】
培训费：3800元，含听课费、材料费、上机费。请自带笔记本电脑用以上机实习。 材料：《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。食宿自理，酒店自行预定。
【报名优惠政策】
1、8.10日报名缴费可优惠300元。
2、3人以上团体报名每人可减少300元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额
上面优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
（五）
生物信息学软件与工具使用培训班通知
“工欲善其事，必先利其器”，对于从事生物信息学研究，软件和工具绝对是必不可少的。您对生物信息学常用的软件和工具可能进行过简单的了解和使用，但您可能在使用的过程中会遇到各种各样的疑问，如面对众多的生物信息学分析软件却不知该如何选择应用？对于软件繁杂的使用方法和众多参数不知如何取舍？为了解决您遇到的困扰，打开您的思绪，北京市计算中心生物计算事业部举办《生物信息学软件与工具使用培训班》。介绍生物信息学研究及数据分析中所用的各种数据库使用，通过实际项目演练，学习常用分析软件的使用方法，将课程各项知识点融会贯通，从而使学员深刻理解并掌握生物信息学数据库和工具使用的要点。大家赶快一起来交流探讨吧！一流的学员和经验丰富的老师在这里等着你的到来！
授课对象： 全国生命科学、基础医学、农林科学等领域大专院校、科研机构、公司企业从事分子生物学、生物化学、遗传学、基因组学等研究、开发和教学的第一线研发人员和青年教师、博士后和研究生。
本次课程时间： 2017.9.26-9.29 上午：9：30 - 12：00 下午：1：30 – 5：00
日期 | 时间 | 课程名称 | 课程内容 |
第一天 上午 | 09:30-10:30 | 生物信息学概述与前沿 | 1. 基因组学与生物信息学背景知识介绍； 2. 生物信息进展与前沿技术介绍； |
10:30-12:00 | NCBI数据库 | 1. NCBI数据库介绍：PubMed、Nucleotide（GenBank）、Genome、Structures（MMDB）、Taxonomy、UniGene、Entrez等，数据查询检索； |
第一天 下午 | 13:30-15:00 | NCBI数据库 | 2. NCBI数据库数据上传提交与批量下载； 3. NCBI数据库实例讲解与练习； |
15:00-17:00 | Blast与序列比对 | 1. Blast与序列检索比对及参数； 2. Blast建库与Blast本地化； 3. 实例讲解与练习； |
第二天 上午 | 09:30-12:00 | MEGA软件与分子进化 | 1. 分子进化理论基础； 2. MEGA与系统发育树构建； 3. 实例讲解与练习； |
第二天 下午 | 13:30-17:00 | 基因组注释 | 1. 基因本体数据库GO及GO注释； 2. 生物学通路KEGG注释方法与实现； 3. David与基因注释； 4. IPA简介，查询搜索，通路分析与网络构建； |
第三天 上午 | 09:30-12:00 | 分子网络与生物学通路分析 | 1. 分子相互作用数据库与通路概述（Uniprot，String，DIP数据库）； 2. 分子网络分析工具Cytoscape及插件使用； 3. 实例讲解与练习； |
第三天
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