我为啥用miRWalk2.0的时候老是出错？

我叫林平之，是莫愁师姐的师弟。我最近在分析我的miRNA。我发现miRWalk是一款比较实用的，预测miRNA靶点的数据库，但是有一个问题，miRWalk有两个：

miRWalk和miRWalk2.0，我试过用miRWalk2.0，但是用完的结果都是：

虽然我知道miRWalk2.0要好用很多，miRWalk里，只能预测基因的一些靶点：

但是miRWalk2.0里，可以预测类似ncRNA靶基因，和类似Pathway的分析。要怎么用呢？

莫愁：其实两个数据库都可以使用，但是，但从界面来说，大家可能都更熟悉miRWalk：

由于miRWalk所涉及的数据库不多，而且对于基因也没有特别的注释，所以，输入基因的时候，都是采用Gene Symbol，没别的选项，所以更没有多少类似于LncRNA之类的数据。

而miRWalk2.0不一样，由于添加的一些注释，以及数据库的整合，所以界面相对来说更为复杂。miRWalk2.0中，除了整合了更多的预测靶点的数据库，还对基因进一步进行了注释。

要注意的是，miRWalk2.0的界面中，对于基因的注释增多，就必须把所有的基因名字以及命名原则都选对，有些非常相近的命名不能选错，比如：

在这里，你看Synonym和Official Symbol命名是一样的，但是这里必须选择Official Symbol：

这里的Synonym是别名，选了Synonym，或者这项漏选，结果就会变成：

所获得的结果有两类，一类是预测获得的靶基因结果：

另一类是已经验证过的结果，会有对应的文献编号在里面：

由于收集了大量数据库以及基因注释，所以还能搜索类似信号通路相关miRNA，细胞系表达的miRNA等等结果：

结果点进去，也能找到对应的文献：

李莫愁博士：miRNA靶基因检测，用miRWalk其实还是比较省力的，特别是由于miRWalk对靶基因的预测，不仅仅限制在3'UTR上，在CDS或者Promoter上都能进行预测。miRWalk2.0其实是升级版，但这个主要需要注意的是，先要记住每一步的设置不能少哦！好了，今天就先策到这里吧。网址在下面哈：

http://zmf.umm.uni-heidelberg.de/apps/zmf/mirwalk/index.html

http://zmf.umm.uni-heidelberg.de/apps/zmf/mirwalk2/index.html