讨论 | 一款优秀的临床遗传病诊断捕获产品需要具备的素质

临床诊断捕获产品不同于科研，它讲究的是用最少的钱获得最大的临床诊断价值，而科研讲究的是更全更完整，虽然说现在全外显子测序具有很高的性价比，有些公司的报价比 Panel 还要低，但是个人觉得从临床角度来看它仍不是理想的临床诊断产品，下面游侠简单说说自己认为的一款优秀的临床遗传病诊断捕获产品需要具备的素质。

第一、 捕获的区域要覆盖已知致病基因但不用覆盖太多，目前 OMIM 和 HGMD 收录的明确的致病基因也就 3800 多个，覆盖更多的基因不能带来更高的诊断率，虽然覆盖更多的基因对于科研上很有帮助，但是临床的目的就是诊断，它是病人付费的，而科研可以使用科研经费。至于说有些公司全外显子的成本比 Panel 更低的现实，我认为这些捕获公司推出医学外显子的话，市场价将会更低，测序数据量也会更少，而且相对来说，医学外显子分析 CNV 和嵌合变异会更加准确，随着价格下降， trio 医学外显子将会流行，从而提高诊断率。

第二、 捕获的区域要覆盖一些已知的不外编码区的致病变异，比如β地中海贫血 654 突变就在内含子深度区域，如果只覆盖编码区就会遗漏，另外一些热点的易位与倒位变异也应包括在里面，比如血友病，其他的还包括启动子区的已知致病变异。这一点 Agilent CREV2 做的比较好（ 详情 ）。

第三、 除了捕获基因的编码区还应该能够覆盖一些临床上常见的 CNV 致病区域，比如 DiGeorge syndrome ，这样就不用再做一遍基因芯片了。这一点国内的艾吉泰康做的比较好，他们新推产的全外显子产品包括 CNV（ 详情 ） 。

第四、 要是能够将线粒体 DNA 一起捕获下来就更好了，虽然我不知道这中间有多大的难度；