说一个大家经常遇到的问题：在基金选题的过程中，好不容易挑选到分子A，结果发现这个分子A已经被报导了，那还能用分子A报基金吗？评审专家会不会认为创新性不好？首先，我们看A分子通常在疾病中报导的三种情况：
比如A分子作为一个预后或者诊断模型的标签基因之一，在生信分析的文章中被提及，但是没有开展任何湿实验验证，这一类的文章蛮多的，分数一般也不高，2、3分的比较多，或者分数高一些的“水刊”“预警期刊”；
比如临床样本层面发现A分子表达有差异，与疾病进展的相关性，有的还做了A分子在细胞与动物水平的功能，但是机制探索不深入系统，比如只是确定了A分子调控某条信号通路，即指标检测还是以细胞表型的指标和通路的指标为主，技术手段也是Western 这种。文章的分数也不会很高，一般在3-4分左右，或者分数高一些的“水刊”“预警期刊”；
这种文章研究的相对比较完善，临床、细胞、动物和分子实验都有，分子机制上既有相对浅的WB检测指标，也有相对深入的Co-IP实验，甚至有一些科研热点和新技术，验证逻辑也很完善。从信号轴上来说，一般围绕A分子的上下游都有，比如转录因子激活A表达，通过与B蛋白结合激活信号通路等，所以内容上比较完善。这样的研究分数一般在5分-7分左右，或者分数高一些的“水刊”“预警期刊”。
先回答题目的问题：不管是哪种情况，都可以继续申报项目，不过在最后一种情况下，需要把重点讲清楚，即：项目中研究A分子与已经发表的这些研究的区别是什么？即本质还是创新性的问题。
下面我们举一个例子说明：
“转录因子A促进去泛素化酶B基因转录表达，高表达的B介导底物蛋白C的多泛素化水平下降，提高其蛋白稳定性，而C蛋白通过激活D促癌通路和E细胞表型发挥作用。”
假定我们说的分子是去泛素化酶B，下面我们通过不同的策略说明。
策略1：去泛素化酶B的新底物、通路和表型
泛素化修饰与底物的关系是多对多的关系，即去泛素化酶B可以有多个不同底物蛋白，底物蛋白C也可以有多个去泛素化酶。所以，去泛素化酶B即可以调控底物蛋白C1，也可以调控底物蛋白C2，不同的是：C1蛋白调控的是细胞焦亡，而C2蛋白调控的是细胞干性，所以当“去泛素化酶B——C1底物蛋白——细胞焦亡”被报道后，并不影响“去泛素化酶B——C2底物蛋白——细胞干性”的创新。新的项目完全可以围绕去泛素化酶B对细胞干性调控角度开展，并重点探索细胞干性相关的临床问题（比如肿瘤的耐药、组织修复等）。当然在写本子中，一定要提到去泛素化酶B——C1底物蛋白——细胞焦亡的研究，这本身就是去泛素化酶B和疾病关系的国内外研究进展，但是也要把去泛素化酶B对细胞干性的调控作用作为研究的创新点和特色来体现。
这类分子还有很多，像转录因子、激酶等我们常说的工具分子，大家如果还是理解不了，可以对应miRNA调控多个靶点来思考，靶向mRNA1的时候参与细胞周期调控，靶向mRNA2的时候参与细胞死亡调控，靶向mRNA3的时候参与细胞糖酵解……。
策略2：去泛素化酶B就以泛素化依赖方式发挥作用吗？
这个问题似乎就挑战大家的套路思维了：去泛素化酶B在发挥功能的时候，一定要调控某个蛋白的泛素化水平么？我们用“老药新用”的角度来类比理解，二甲双胍发挥抗肿瘤的作用，一定是依赖于其降糖作用么？对应到分子的说法就是：“老基因新机制”。比如我们说到PDL1，一般会想到作为免疫检查点的经典作用，但是细胞核PDL1（nPDL1）又能发挥转录调控作用（类似于转录调控因子），比如通过nPDL1促进p-STAT3与EGR1的启动子结合，激活EGR1介导的血管生成：也可以增加Gasdermin
C（GSDMC）基因转录，将细胞凋亡转变为细胞焦亡并促进肿瘤坏死：我们再回到去泛素化酶B，就不能直接通过蛋白间互作发挥作用么？比如：
“E3泛素连接酶HERC3可以在其酶活性之外促进YAP/TAZ的激活：HERC3直接与β-TrCP结合，阻断其与YAP/TAZ的相互作用，从而防止YAP/TAZ的泛素化和降解。”如果按照一般的套路观点：如果HERC3与β-TrCP结合，是不是要介导β-TrCP的泛素化修饰，然后走蛋白酶体降解途径？或者，HERC3通过β-TrCP与YAP/TAZ结合，介导YAP/TAZ的高泛素化，从而降低蛋白稳定性，下调蛋白表达？但是研究发现是：HERC3抑制了YAP/TAZ的泛素化，而非促进作用吧？经典套路认为：HERC3作为泛素E3连接酶，对β-TrCP甚至是YAP/TAZ的泛素化修饰是促进作用？是不是似乎矛盾？实际上这才是跳出套路的创新。
策略3：能不能换个细胞继续做去泛素化酶B？
最后这个策略应该是最简单的吧，我们以肿瘤免疫为例，前期文章报道了去泛素化酶B在肿瘤细胞中高表达，通过激活经典Wnt信号通路维持肿瘤细胞干性从而介导放化疗耐药，但是我们单细胞测序数据发现去泛素化酶B在肿瘤组织的T细胞中也高表达，作用机制通过代谢酶A介导脂代谢重编程，进而诱导Treg活化和CD8+T细胞耗竭，这样是不是也可以？
当然，三个策略并不矛盾，也有很多其它的策略，我们抛砖引玉到这里，欢迎留言探讨。
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