专栏名称: 实验万事屋
文献总是乏味,科研一向无聊,“实验万事屋”旨在拯救医界同仁于寂寞无聊,每天坚持抖落科研内幕,分享实验心得,搜集科研资讯,激发您的科研兴趣,传授实用的科研方法和思路。做不做科研,从医之路大不同,在这条布满荆棘的科研道路上,我们与您一路同行。
目录
相关文章推荐
社会学研究杂志  ·  JCS Focus ... ·  2 天前  
北京石墨烯研究院  ·  “墨园学堂”第四十四讲开讲!浙江大学薛建龙老 ... ·  2 天前  
北京石墨烯研究院  ·  “墨园学堂”第四十四讲开讲!浙江大学薛建龙老 ... ·  2 天前  
募格学术  ·  如何选择靠谱的英文论文润色机构 ·  2 天前  
51好读  ›  专栏  ›  实验万事屋

肠道微生物还会导致糖尿病血管钙化?看完这南华大学14.3分的巨噬细胞和细菌Crosstalk的SCI文章,我又不淡定了.....

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2025-01-24 08:20

正文

今天这篇文章还挺有意思,讲的是细菌和巨噬细胞之间的Crosstalk,细菌产生EV(外泌体)激活了巨噬细胞的M2极化,促进了血管的钙化。这篇文章是南华大学附属第一医院刘江教授团队的博士,发表在14.3分的Advanced Science上的文章。这篇文章关键是在推理和推进的过程,通过假设和假设的迭代(假设和假设的迭代,是一篇文章或者一个课题推进过程中必不可少的过程,通过假设的迭代可以逐步推演出文献的思路和整个通路产生的过程,不清楚假设和假设迭代的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列),推导出了细菌-巨噬细胞-血管钙化之间的关联性,以及其中的通路,我们就一起来看看他们的假设是如何产生的吧:

首先他们研究的是T2D(二型糖尿病)患者所产生的一种病变,也就是VC(血管钙化),他们首先提出的假设,就是肠道微生物对于血管钙化之间的可能存在着某种联系。于是他们将T2D分成两组,一组是存在有VC的,另一组是不存在VC病变的,他们分析了两组患者的肠道微生物差异(这个过程,其实就是归纳法中米勒五法的求同求异法,通过不同表型的分组,求取同一组中共有的变化,来找出可能的关键因素,不清楚米勒五法或者归纳法的话,可以去看看《列文虎克读文献》和《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》)。在差异的微生物中,他们找到了BF(脆弱拟杆菌),这种微生物在T2D-VC的患者肠道内得到了富集:

他们发现BF除了与VC相关,同时也与T2D患者的巨噬细胞M2极化有着明显的相关性。那么BF是如何导致T2D患者产生VC病变的呢?EV(外泌体,或者细胞外囊泡)是细胞之间相互通讯的一种潜在的机制,他们发现BF可以分泌出EV。而BF-EV可以刺激巨噬细胞的M2极化,同时BF-EV处理后的巨噬细胞与血管平滑肌细胞共培养后,会导致血管平滑肌细胞中钙化和成骨相关的基因表达产生变化,也就是说BF-EV可能也是诱导EV的关键:

为了确定巨噬细胞对于血管钙化的作用,他们使用软骨酸盐脂质体清除了小鼠外周血、骨髓和脾脏中的巨噬细胞后,再使用BF-EV进行刺激(这个部分的实验就是柯霍氏法则的验证,通过清除BF-EV→血管钙化过程中的关键因素巨噬细胞,来查看是否存在BF-EV→巨噬细胞→血管钙化这个潜在的途径,不清楚柯霍氏法则的话,可以看看《轻松的文献导读》和《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》)。结果他们发现清除二型糖尿病小鼠中的巨噬细胞后,使得外周血中M2极化的巨噬细胞减少,骨髓中M2极化巨噬细胞增多,减轻了BF外泌体诱导的血管钙化因子Serpine1的表达水平:

那么BF-EV是如何影响巨噬细胞M2极化以及Serpine1表达的呢?微生物对于巨噬细胞的影响,基本上都会通过cGAS-STING信号通路(这个是常见的微生物影响细胞免疫反应的信号通路,不清楚的话,可以去看看《信号通路是什么鬼?》系列复习下),于是他们查看了BF-EV对于巨噬细胞STING的激活情况,结果发现BF-EV处理后,的确激活了STING以及STING下游的Mef2d磷酸化。通过抑制剂抑制STING信号通路,则能缓解BF-EV对于巨噬细胞M2极化的促进作用:

而通过进一步的筛选,他们发现BF-EV→STING→Mef2d磷酸化,可以通过激活Trib1的转录,促进巨噬细胞的M2极化。这里他们是通过过表达Mef2d来进行下游分析,得到的这个结论(但实际上,如果Mef2d作为转录因子激活下游靶基因Trib1,更严谨的论证不应该是通过过表达或者敲除,而是需要通过Trib1启动子的突变,来分析下游巨噬细胞产生的M2极化表型,这样才能避免肯定后件的逻辑谬误,不清楚肯定后件的逻辑谬误,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列)。他们得到的结论就是,BF-EV→STING→Mef2d信号轴,通过Trib1,促进M2巨细胞极化,而M2巨噬细胞分泌Serpine1从而加剧二型糖尿病的血管钙化:

M2巨噬细胞分泌Serpine1,则是T2D小鼠产生血管钙化的关键因素:

通过临床数据的分析,他们也发现了血清中的Serpine1与T2D患者的血管钙化之间的关系,外周血血清中的Serpine1是T2D血管钙化的危险因素:

最后画出来示意图差不多就是这样的,BF分泌的EV通过激活巨噬细胞的STING→Mef2d,分别激活Trib1和Serpine1的表达。通过激活Trib1,促进了巨噬细胞的M2极化,而通过产生并分泌Serpine1,则能刺激VSMC(血管平滑肌细胞)产生成骨分化,也就是钙化:

这篇文章在逻辑的推进中,是有条不紊的,通过筛选到BF,逐步推演出巨噬细胞受到的影响,以及M2极化和Serpine1的分泌,促进了血管钙化。这篇文章的思路其实是比较清晰的,但是在个别细节上,如果能更精益求精,可能会做得更好。好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话可以看看原文,祝你们心明眼亮。

喜欢夏老师讲文献的话,可以点点星标,点点赞,点点“在看”,多分享多转发。

公众号回复“公克”,没事可以翻翻精华帖,里面有不少宝藏工具,当作是科研过程中的一种调剂也是不错的选择哦科研并不一定要这么无聊又尴尬



目前夏老师已正式出版11本书,想要的可直接点以下微店小程序直接购买:
《“一本正经”的基础实验手册》适合刚入门的科研小白;
《实验万事屋》适合刚要入门的科研菜鸟;
《夏老师带你读文献》是教你们如何读文献(含科研解迷彩蛋);
《列文虎克读文献》通过文献精读讲解简单的分子生物学实验及原理;
《轻松的文献导读》通过几篇不同风格、不同领域的文章解读,简单讲解了文章的思路和逻辑性;
《信号通路是什么“鬼”?》系列(1-5)(含科研解迷彩蛋),介绍各种信号通路,每条信号通路配有对应SCI文章的解读,由表及里;
《科研的推理和逻辑——从实验台到咖啡桌》给你讲讲科研中的推理和逻辑