今天这篇文章还挺有意思,讲的是细菌和巨噬细胞之间的Crosstalk,细菌产生EV(外泌体)激活了巨噬细胞的M2极化,促进了血管的钙化。这篇文章是南华大学附属第一医院刘江教授团队的博士,发表在14.3分的Advanced Science上的文章。这篇文章关键是在推理和推进的过程,通过假设和假设的迭代(假设和假设的迭代,是一篇文章或者一个课题推进过程中必不可少的过程,通过假设的迭代可以逐步推演出文献的思路和整个通路产生的过程,不清楚假设和假设迭代的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列),推导出了细菌-巨噬细胞-血管钙化之间的关联性,以及其中的通路,我们就一起来看看他们的假设是如何产生的吧:
首先他们研究的是T2D(二型糖尿病)患者所产生的一种病变,也就是VC(血管钙化),他们首先提出的假设,就是肠道微生物对于血管钙化之间的可能存在着某种联系。于是他们将T2D分成两组,一组是存在有VC的,另一组是不存在VC病变的,他们分析了两组患者的肠道微生物差异(这个过程,其实就是归纳法中米勒五法的求同求异法,通过不同表型的分组,求取同一组中共有的变化,来找出可能的关键因素,不清楚米勒五法或者归纳法的话,可以去看看《列文虎克读文献》和《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》)。在差异的微生物中,他们找到了BF(脆弱拟杆菌),这种微生物在T2D-VC的患者肠道内得到了富集:
他们发现BF除了与VC相关,同时也与T2D患者的巨噬细胞M2极化有着明显的相关性。那么BF是如何导致T2D患者产生VC病变的呢?EV(外泌体,或者细胞外囊泡)是细胞之间相互通讯的一种潜在的机制,他们发现BF可以分泌出EV。而BF-EV可以刺激巨噬细胞的M2极化,同时BF-EV处理后的巨噬细胞与血管平滑肌细胞共培养后,会导致血管平滑肌细胞中钙化和成骨相关的基因表达产生变化,也就是说BF-EV可能也是诱导EV的关键:
为了确定巨噬细胞对于血管钙化的作用,他们使用软骨酸盐脂质体清除了小鼠外周血、骨髓和脾脏中的巨噬细胞后,再使用BF-EV进行刺激(这个部分的实验就是柯霍氏法则的验证,通过清除BF-EV→血管钙化过程中的关键因素巨噬细胞,来查看是否存在BF-EV→巨噬细胞→血管钙化这个潜在的途径,不清楚柯霍氏法则的话,可以看看《轻松的文献导读》和《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》)。结果他们发现清除二型糖尿病小鼠中的巨噬细胞后,使得外周血中M2极化的巨噬细胞减少,骨髓中M2极化巨噬细胞增多,减轻了BF外泌体诱导的血管钙化因子Serpine1的表达水平:
那么BF-EV是如何影响巨噬细胞M2极化以及Serpine1表达的呢?微生物对于巨噬细胞的影响,基本上都会通过cGAS-STING信号通路(这个是常见的微生物影响细胞免疫反应的信号通路,不清楚的话,可以去看看《信号通路是什么鬼?》系列复习下),于是他们查看了BF-EV对于巨噬细胞STING的激活情况,结果发现BF-EV处理后,的确激活了STING以及STING下游的Mef2d磷酸化。通过抑制剂抑制STING信号通路,则能缓解BF-EV对于巨噬细胞M2极化的促进作用:
而通过进一步的筛选,他们发现BF-EV→STING→Mef2d磷酸化,可以通过激活Trib1的转录,促进巨噬细胞的M2极化。这里他们是通过过表达Mef2d来进行下游分析,得到的这个结论(但实际上,如果Mef2d作为转录因子激活下游靶基因Trib1,更严谨的论证不应该是通过过表达或者敲除,而是需要通过Trib1启动子的突变,来分析下游巨噬细胞产生的M2极化表型,这样才能避免肯定后件的逻辑谬误,不清楚肯定后件的逻辑谬误,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列)。他们得到的结论就是,BF-EV→STING→Mef2d信号轴,通过Trib1,促进M2巨细胞极化,而M2巨噬细胞分泌Serpine1从而加剧二型糖尿病的血管钙化:
M2巨噬细胞分泌Serpine1,则是T2D小鼠产生血管钙化的关键因素:
通过临床数据的分析,他们也发现了血清中的Serpine1与T2D患者的血管钙化之间的关系,外周血血清中的Serpine1是T2D血管钙化的危险因素:
最后画出来示意图差不多就是这样的,BF分泌的EV通过激活巨噬细胞的STING→Mef2d,分别激活Trib1和Serpine1的表达。通过激活Trib1,促进了巨噬细胞的M2极化,而通过产生并分泌Serpine1,则能刺激VSMC(血管平滑肌细胞)产生成骨分化,也就是钙化:
这篇文章在逻辑的推进中,是有条不紊的,通过筛选到BF,逐步推演出巨噬细胞受到的影响,以及M2极化和Serpine1的分泌,促进了血管钙化。这篇文章的思路其实是比较清晰的,但是在个别细节上,如果能更精益求精,可能会做得更好。好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话可以看看原文,祝你们心明眼亮。
喜欢夏老师讲文献的话,可以点点星标,点点赞,点点“在看”,多分享多转发。
公众号回复“公克”,没事可以翻翻精华帖,里面有不少宝藏工具,当作是科研过程中的一种调剂也是不错的选择哦,科研并不一定要这么无聊又尴尬:
目前夏老师已正式出版11本书,想要的可直接点以下微店小程序直接购买: