正文
2024年11月21日Clinical Chemistry最新文章比较了虚拟panel和固定panel。
背景
基于外显子组或基因组的基因panel检测，也称为虚拟panel，是一种流行的基因组测序方法。
这种方法涉及全面的基因组测序，但将分析限制在根据患者表型选择的特定基因列表上。
这种灵活的策略允许根据新的疾病关联频繁更新基因列表，并可扩展到分析其他基因，甚至整个外显子组或基因组。
随着近期优化解决了虚拟panel相关的局限性，与静态定制panel相比，这种方法的优势有待系统性表征。
方法
文章对1014名患者（50.5%为女性，平均年龄17岁）进行了虚拟panel检测，这些患者来自中东地区一个中心的多家儿科诊所，其中83%是阿拉伯人口。
结果
初步分析发现235名患者得到分子诊断，诊断率为23%（235/1014）。
对大多数阴性病例（779例）进行“即时”聚焦分析，发现35例患者在原始panel 分析列表之外的基因中存在与临床表现相关的临床意义重大的变异（3.5%或35/1024），将总体诊断率提高至27%。
这些新发现病例（占所有阳性病例的13%）的致病变异被排除在原始“panel”基因列表之外，主要原因是：
①panel选择问题
②新的基因-疾病关联
③表型谱扩展
④基因列表的差异
这些新发现导致大多数患者（94%）的临床管理发生了改变。
结论
文章的研究结果支持虚拟panel检测是一种高效灵活的策略，可通过更新分析基因列表实现高临床敏感性和实用性。
参考文献：
Sheikh Hassani, Massomeh et al. “Virtual Gene Panels Have a Superior Diagnostic Yield for Inherited Rare Diseases Relative to Static Panels.” Clinical chemistry, hvae183. 21 Nov. 2024, doi:10.1093/clinchem/hvae183
