党的二十大报告指出：“科技是第一生产力、人才是第一资源、创新是第一动力。”习近平总书记先后多次对中交集团科技创新工作作出重要指示批示，为新时代中交集团实施创新驱动发展战略，打造科技型、管理型、质量型世界一流企业提供了前行的指路明灯、奋斗的信心力量。中交三航院始终坚持 “开拓创新、技术为本、品质至上”，全面理解、精准把握习近平总书记对本单位重要指示批示精神内涵及外延，自觉从中明思路、找差距、定措施、促提升，五年来，科技创新实现了新的突破，共计荣获创优项目奖193项、省部级BIM应用项目奖33项、科技进步奖22项、著作权27项、实用新型专利130项、发明专利77项。
公司始终聚焦关键核心技术，打造公司技术创新特色，聚焦业务发展方向，突出主业，专注专业，形成体系。
五年来，公司科技创新体系不断健全，员工创新意识不断增强，科技创新逐年增加，获奖含金量不断提高。
公司坚持技术创新驱动企业发展，在巩固传统市场的技术领先地位的同时，逐步在数字化、智慧化、绿色低碳发展等新领域进行拓展。
2019年，公司牵头制定了一批传统行业自动化的技术标准，引领了集装箱、煤炭矿石码头的自动化发展，建成世界最大的集装箱港区——洋山四期工程，提升了公司自动化码头核心技术和影响力，占据了自动化码头设计的技术领先地位，为开展技术经营创造条件。2020年，公司加快创新平台建设，组织申报了“三航院企业技术中心”，并通过市级部门认定，填补公司“高端科研平台”空白。此后公司以“三航院企业技术中心”为抓手，积极推动科技创新和数字化转型，开拓新业务。2021年首次参与申报“沿海交通水工建筑物韧性提升关键技术”和“淤积和清淤过程对桩基码头结构破损作用”国家重点专项课题，并成功获准立项，使公司技术创新再上新台阶，引领水工建筑物建设技术新发展。2023年关键核心技术再添佳绩，研发了超大型集装箱、干散货港区数字智慧港航、绿色低碳等核心技术。其中以自主研发的超大型集装箱码头智慧港口技术为主的小洋山北作业区集装箱码头工程成功入选交通强国试点项目；基于北斗的远海智能勘测系统研发及应用已列入交通运输部“交通强国”项目；超大型干散货码头数字设计施工关键技术成功入选中交绿色低碳试点项目，装配式高桩码头设计建造技术入选中交集团2023年度十大绿色低碳技术。
公司及时推进成果转化形成发展新动能。公司践行科技支撑公司高质量发展，分别制定了《三航院专利提升专项行动方案》、《三航院科技研发投入专项治理行动方案》，有效促进了科技创新成果和知识产权成果转化，提高了公司在业务领域的地位和影响力。
2020年公司加快数字化建设步伐，通过管理数字化建设，极大提升公司运行效率，基本实现业财一体化建设雏形。2021年利用自主开发三航院“泰迪”品牌自主知识产权的成果，公司承接特大储运项目的管理系统。2022年以来公司积极推动数智化业务拓展，以数字化管理、BIM技术应用、数字孪生等一批数智技术，承接传统行业中数字化转型的新业务。基础设施重点项目建设、小洋山北侧集装箱港区建设、连云港连云港区改造建设等一批重大工程项目，都通过数智技术赋能加快建设速度和提高生产效率。通过数智赋能传统业务，突出了公司技术特色，大大提高了公司市场竞争力。
公司持续学习贯彻习近平生态文明思想，推进绿色发展理念、“3060”双碳目标等与企业战略规划、商业模式、治理体系深度融合，全面加强“双碳”领域基础研究、应用基础研究和前沿技术研究，加快构建形成公司的绿色技术创新体系和绿色标准体系。
五年来，持续研究绿色低碳技术，在土壤修复、生态修复、水环境治理等设计领域形成技术体系。以宁波舟山港基础设施重点项目、上海国际航运中心小洋山北作业区集装箱码头项目、澳门生态岛项目等国家重大特色工程为依托，打造无人智慧低碳港口、全自动绿色低碳码头、全装配式绿色高效码头等一批绿色示范工程。公司《科技创新引领港口建设绿色低碳发展》案例获评集团2023年“中交助梦”责任品牌优秀案例。
