专栏名称: BioArt

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上海交通大学医学院附属第一人民医院临床研究院近期招聘PI、科研助理、博士后 30名

BioArt · 公众号 · 生物 · 2024-12-31 08:29

正文

为支撑上海交通大学医学院附属第一人民医院（上海市第一人民医院）优势重点学科的健康快速发展，聚焦学科重点病种诊治研究方向，拟吸引、凝聚、培养一批高层次、高水平的生命科学与医学研究领域的优秀人才，打造一支高水平的专职科学研究队伍。

我院特色学科众多、影响力大，包括眼部疾病国家临床医学研究中心、泌尿外科、骨科、消化科、心内科、普外科、血液科、急诊危重病科、内分泌代谢科、放射科、临床药学科、麻醉科等，尤其是在眼部神经和血管性疾病、泌尿系统肿瘤、消化系统肿瘤、血液肿瘤、脓毒血症、代谢性疾病以及影像诊断、免疫和细胞治疗技术等领域，亟需高端优秀青年科研人才加盟，聚焦临床疾病诊疗需求和技术创新，与临床团队合作开展具有学术和临床价值的研究。

一、

人才待遇

1.薪酬：国家级人才Ａ档，年薪135万 + 20万年度奖励；国家级人才Ｂ档，年薪90万 + 12万年度奖励；课题组长年薪60-80万 + 年终绩效；青年课题组长年薪40-65万 + 年终绩效。

2.安家费：国家级人才Ａ档，安家费400-500万；国家级人才Ｂ档，安家费300万；课题组长（海外引进）安家费100万。

3.启动经费：国家级人才Ａ档，院内启动经费400-600万；国家级人才Ｂ档，院内启动经费250-400万，青年课题组长院内启动经费150万。

4.团队配置：国家级人才Ａ档，配置1-2个团队，每团队4人；国家级人才Ｂ档，配置2-4名工作人员；青年课题组长配置1名工作人员。各级各类人才招收博士后名额不限，薪酬待遇主要由医院支付。

5.其他支持：

5.1提供事业单位编制，按照上海市相关政策办理落户；

5.2为申请人子女解决本地区最优质入托或就学，全力协助解决配偶工作；

5.3依托医院优质医疗资源，提供免费医疗体检与员工就医福利。

6.科研奖励：按照《上海市第一人民医院科技奖励管理条例》规定实施。

二、

配套条件

标配办公场所、实验场所和公共实验设施设备平台。

三、

遴选标准

国家级人才Ａ档、Ｂ档走绿色通道面试、面谈；
课题组长近五年以首要第一作者（排名第一）或首要通讯作者（排名最后）在国际顶级学术期刊上发表论著1篇或者其重要子刊上发表2-3篇，并以首要通讯作者（排名最后）发表的SCI收录论著不少于5-8篇；且承担过国家级课题不少于2-3项（海外引进人才无课题硬性要求）；
青年课题组长年龄小于40周岁，近五年以首要第一作者（排名第一）或首要通讯作者（排名最后）在国际顶级学术期刊上发表论著1篇或者其重要子刊上发表1-2篇；且承担国家级课题不少于1项（海外引进人才无课题硬性要求）；
具备团队合作精神和积极主动对接临床团队、开展临床疾病为导向的转化医学研究的意愿

四、

应聘材料

个人简历（包括高中起的学习工作经历、科研经历及取得的学术成果）；
代表性论文全文，毕业证、学位证复印件；
拟开展的研究计划。

我院长期招聘优秀青年人才，符合上述条件的应聘者，将应聘材料发送至邮箱[email protected]和[email protected]，邮件主题注明“应聘高端人才-姓名”。本招聘广告常年有效，所有材料将严格保密，不予退还，敬请理解。

科研助理及博士后（长期有效、随时面试）

一、

助理研究员招聘要求

1.1 岗位职责：

在课题组长领导下独立开展科学研究，承担实验室的日常管理以及学生的带教工作，独立申请包括国自然青年课题在内的各级各类科研基金并撰写发表学术论文。

1.2 岗位要求：

（1）获得免疫学、分子生物学、细胞生物学、生物化学、化学生物学、生物信息学、生物医学工程、材料学、药学、医学等相关专业博士学位；

（2）在国内外获得博士学位不超过三年，品学兼优，身体健康，原则上年龄在35周岁以下的非在职人员，应届生、博士后出站优先；

（3）以第一作者（排名第一）发表中科院分区2区及以上SCI论著不少于一篇。

（4）具有较强的英文听说读写能力，熟练阅读英文文献；

（5）热爱生物医学研究，工作认真严谨，有责任心，具备独立承担课题的能力，良好的沟通、协调能力，独立工作能力以及团队协作精神；

（6）遵守国家有关法律法规及上海市第一人民医院的各项规章制度。

1.3 岗位待遇：

（1）提供有竞争力的薪酬待遇，一事一议；

（2）科研奖励按照《上海市第一人民医院科技奖励管理条例》规定实施；

（3）第一聘期内科研成绩突出者可晋升为青年PI。

二、

博士后招聘要求

2.1 岗位要求：

（1）获得博士学位不超过3年，品学兼优，身体健康，年龄一般不超过35周岁；

（2）近3年以第一作者发表≥1篇本专业领域中科院SCI分区2区及以上的论著，或获得国家自然科学基金项目1项。

2.2 岗位待遇：

（1）享受五险一金；

（2）表现优秀可优先留院工作；

（3）出站留院后可申报交大医学院副研究员职称；

（4）提供有竞争力的薪酬待遇，出站评估优秀给予额外优厚奖励。

2.3 在站期间可申请项目：

在站期间可申请各级各类博士后项目。

各招聘课题组概况如下：

应聘材料请发送至[email protected] 及感兴趣课题组课题组长邮箱。

附各课题组详细介绍：

一、

王宏林课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

王宏林 PhD 二级教授

上海交通大学医学院研究员、博士生导师

国家杰出青年基金获得者（2017）

科技部重点研发项目首席科学家（2020）

创新免疫治疗全国重点实验室副主任

上海交通大学医学院附属第一人民医院临床研究院执行副院长

上海交通大学医学院附属第一人民医院疑难疾病精准研究中心主任

德国乌尔姆大学医学院博士、博士后

上海交通大学特聘教授

上海交通大学致远荣誉计划导师

上海市特聘教授（东方学者）

上海市浦江人才计划

上海市优秀学术带头人

中国免疫学会皮肤免疫学分会副主任委员

中华中医药学会免疫学分会副主任委员

2.研究方向：

皮肤免疫学、神经免疫学、药物靶点发现与新药研发

3.原创性科研成果：

3.1 发现RNA病毒感染而非链球菌感染诱发银屑病的发生发展，这是银屑病病因学研究的重要突破，为银屑病的积极预防和治疗提供了全新思路；

3.2 主持研发出选择性抑制Th17细胞分化的天然候选药物小分子，该小分子获得全球自主知识产权（中国、美国、欧盟、日本授权发明专利），现已完成I期临床试验与治疗银屑病的IIa期临床试验，即将开展治疗白癜风的II期临床试验。该小分子有望成为我国自主研发、自主知识产权、First-in-Class治疗银屑病、白癜风的国家I类新药；

3.3研发一款检测人体免疫状态的流式细胞学试剂盒，可简易、快捷、准确地应用于人体外周血样本。最终的产品在只取1毫升样本、耗时1小时、针对1个主要指标的条件下，准确评估人体“免疫年龄与功能”。成果转让总金额6亿元人民币，首期付款3000万元，创上海市医疗机构专利转让首批到账金额最高记录。

4.近5年代表性文章：

1)Xiangxiao Li, Fengjiao Zhang, Libo Sun, Xiaojie Cai, Fangzhou Lou, Yang Sun, Min Gao, Zhikai Wang, Sibei Tang, Li Fan, Yue Wu, Xinping Jin, Siyu Deng, Zhenyao Xu, Xuxu Sun, Qun Li, Honglin Wang*. scRNA-seq identifies WARS1+ mesenchymal stem cells with enhanced immunomodulatory capacity and improved therapeutic efficacy. Journal of Immunology. 2024 Aug 1;213(3):257-267. doi: 10.4049/jimmunol.2300752.

2)Tang S, Zhang J, Lou F, Zhou H, Wang Z, Sun L, Sun Y, Cai X, Li X, Fan L, Jin X, Deng S, Yin Q, Wang H, Wang H*. LncRNA Dleu2-Encoding Peptide Relieves Autoimmunity by Facilitating Smad3-mediated Regulatory T Cell Induction. EMBO Rep. 2024 Mar;25(3):1208-1232. doi: 10.1038/s44319-024-00070-4. Epub 2024 Jan 30.

3)Lou F, Xu Z, Bai J, Zhao X, Cui L, Li Q, Wang H*. Identification and pre-clinical investigation of CKBA as a drug for external use to treat psoriasis. Br J Pharmacol. 2024;1-18. doi: 10.1111/bph.16253. PMID:37749894.

4)Tong J, Li Y, Cai X, Lou F, Sun Y, Wang Z, Zheng X, Zhou H, Zhang Z, Fang Z,Ding W, Deng S, Xu Z, Niu X, Wang H*. CKBA suppresses mast cell activation viaERK signaling pathway in murine atopic dermatitis. Eur J Immunol. 2023 Sep;53(9):e2350374. doi: 10.1002/eji.202350374. Epub 2023 Jul 7. PMID: 37417726.

5)Cai X, Han M, Lou F, Sun Y, Yin Q, Sun L, Wang Z, Li X, Zhou H, Xu Z, Wang H,Deng S, Zheng X, Zhang T, Li Q, Zhou B, Wang H*. Tenascin C⁺ papillaryfibroblasts facilitate neuro-immune interaction in a mouse model of psoriasis. Nat Commun. 2023 Apr 10;14(1):2004. doi: 10.1038/s41467-023-37798-x. PMID:37037861; PMCID: PMC10086024.

6)Wang Z, Sun Y, Lou F, Bai J, Zhou H, Cai X, Sun L, Yin Q, Tang S, Wu Y, FanL, Xu Z, Wang H, Hu X, Wang H*. Targeting the transcription factor HES1 byL-menthol restores protein phosphatase 6 in keratinocytes in models ofpsoriasis. Nat Commun. 2022 Dec 19;13(1):7815. doi: 10.1038/s41467-022-35565-y.PMID: 36535970; PMCID: PMC9763329.

7)Zhou H, Lou F, Bai J, Sun Y, Cai W, Sun L, Xu Z, Liu Z, Zhang L, Yin Q, ZhangJ, Gao Y, Wang Z, Niu L, Cai X, Deng S, Wang H, Xia L, Ginhoux F, Li Q, Wang H*. A peptide encoded by pri-miRNA-31 represses autoimmunity by promoting T_reg differentiation. EMBO Rep. 2022 May 4;23(5): e53475. doi:10.15252/embr.202153475. Epub 2022 Mar 28. PMID: 35343645; PMCID: PMC9066071.

8)Yin Q, Sun L, Cai X, Lou F, Sun Y, Wang B, Jiang B, Bao L, Li X, Song N, TangS, Bai J, Wang Z, Wu Y, Zhou H, Wang H, Yu B, Li Q, Wang H*. Lidocaine Ameliorates Psoriasis by Obstructing Pathogenic CGRP Signaling‒Mediated Sensory Neuron‒Dendritic Cell Communication. J Invest Dermatol. 2022Aug;142(8):2173-2183.e6. doi: 10.1016/j.jid.2022.01.002. Epub 2022 Jan 12. PMID:35032503.

9)Chen L, Bai J, Peng D, Gao Y, Cai X, Zhang J, Tang S, Niu L, Sun Y, Lou F, Zhou H, Yin Q, Wang Z, Sun L, Du X, Xu Z, Wang H, Li Q, Wang H*. SZB120 Exhibits Immunomodulatory Effects by Targeting eIF2α to Suppress Th17 Cell Differentiation. J Immunol. 2021 Mar 1;206(5):953-962. doi:10.4049/jimmunol.2000036. Epub 2021 Jan 22. PMID: 33483349; PMCID: PMC7887737.

10)Wei Cai, Junxun Zhang, Hong Zhou, Xiangxiao Li, Fangzhou Lou, Yang Sun, Zhenyao Xu, Jing Bai, Qianqian Yin, Zhikai Wang, Libo Sun, Xiaojie Cai, Sibei Tang, Yue Wu, Li Fan, Hong Wang, Honglin Wang*, Qun Li. Protein phosphatase 6 (Pp6) is crucial for regulatory T cell function and stability in autoimmunity. Genes and diseases. 2021 Aug 17;9(2):562-575. doi: 10.1016/j.gendis.2021.07.005. eCollection 2022 Mar.

11)Niu L, Lou F, Sun Y, Sun L, Cai X, Liu Z, Zhou H, Wang H, Wang Z, Bai J, YinQ, Zhang J, Chen L, Peng D, Xu Z, Gao Y, Tang S, Fan L, Wang H*. A micropeptide encoded by lncRNA MIR155HG suppresses autoimmune inflammation via modulatingantigen presentation. Sci Adv. 2020 May 20;6(21): eaaz2059. doi:10.1126/sciadv. aaz2059. PMID: 32671205; PMCID: PMC7314557.

12)Lou F, Sun Y, Xu Z, Niu L, Wang Z, Deng S, Liu Z, Zhou H, Bai J, Yin Q, CaiX, Sun L, Wang H, Li Q, Wu Z, Chen X, Gu J, Shi YL, Tao W, Ginhoux F, Wang H*. Excessive Polyamine Generation in Keratinocytes Promotes Self-RNA Sensing by Dendritic Cells in Psoriasis. Immunity. 2020 Jul 14;53(1):204-216.e10. doi: 10.1016/j.immuni.2020.06.004. Epub 2020 Jun 17. PMID: 32553276.

13)Danhong Peng, Linjiao Chen, Yang Sun, Libo Sun, Qianqian Yin, Siyu Deng, Liman Niu, Fangzhou Lou, Zhikai Wang, Zhenyao Xu, Conghui Wang, Li Fan, Hong Wang, Honglin Wang*. Melanoma suppression by quercein is correlated with RIG-I and type I interferon signaling. Biomedicine & Pharmacotherapy. 2020 May:125: 109984. doi: 10.1016/j.biopha.2020.109984. Epub 2020 Feb 25.

5.承担的课题：

团队自2009年组建以来，获得国家自然科学基金杰出青年基金、科技部重点研发计划计划、国家自然科学基金重点项目、国家自然科学基金重大研究计划、国家自然科学基金面上项目等多项资助，总经费逾4500万。

6.授权专利：

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二、

颜标课题组（诚招青年PI、科研助理、博士后、技术员）

联系方式：[email protected]

1.简介:

颜标 PhD

上海交通大学医学院教授、博士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院科研处处长、眼科课题组长、PI

国家杰出青年基金获得者

教育部长江学者（青年）

2.研究方向：

血管性疾病的发生机制和干预策略研究

3.原创性科研成果：

揭示了血管内皮病变调控新机制，找到了治疗血管病变的新细胞靶标，发现了抑制神经血管单元病变的新基因，并研发了微血管性疾病的诊断试剂盒。

以通讯作者发表学术论文60余篇，标志性成果发表在JCI、PNAS、Circulation、Circulation Research和Cell Rep Med等期刊。

入选爱思唯尔（Elsevier）“中国高被引学者”（临床医学，2022，2023）。

入选2013-2022年眼科领域学术影响力排行榜Top 10学者。

一项成果入选2017年中华医学会眼科分会眼底学组十大科研亮点之首；一项成果入选2021年的眼科学十大诊疗新进展。

作为负责人主持了国家自然科学科学基金6项。

作为主要完成人获得中华医学科技奖二等奖、上海市医学科技一等奖、江苏省医学科技一等奖等10项奖励。

4.近5年代表性文章：

1）Feng S, Zhang Q, Liu Q, Huang C, Zhang H, Wang F, Zhu Y, Jian Q, Chen X, Jiang Q, Yan B*. N⁶-methyladenosine demethylase FTO controls macrophage homeostasis in diabetic vasculopathy. Diabetes 2025, 74(1): 82-95.

2）Yao J, Yao W, Zhu JY, Liu Y, Liu JH, Ji YK, Ni XS, Mu W, Yan B*. Targeting tRNA-derived non-coding RNA alleviates diabetes-induced visual impairment through protecting retinal neurovascular unit. Adv Sci 2024: e2411042.

3）Zhang QY, Zhang HY, Feng SG, Yao MD, Ding JJ, Li XM, Ye R, Liu Q, Yao J, Yan B*. Macrophage metabolic reprogramming ameliorates diabetes-induced microvascular dysfunction. Redox Biol 2024, 79: 103449.

4）Tong M, Bai Y, Lyu J, Ren L, Zhang L, Yao M, Han X, Li X, Li D, Zhao PQ, Jiang Q, Yan B*. Single-cell RNA sequencing unveils an Odc1-marked endothelial subpopulation critical for pathological angiogenesis. Clin Transl Med 2024, 14(3): e1640.

5）Shi L, Lu S, Han X, Ye F, Li X, Zhang Z, Jiang Q, Yan B*. Lymphatic-specific methyltransferase-like 3-mediated m(6)A modification drives vascular patterning through prostaglandin metabolism reprogramming. MedComm 2024, 5(10): e728.

6）Zhu JY, Yao W, Ni XS, Yao MD, Bai W, Yang TJ, Zhang ZR, Li XM, Jiang Q, Yan B*. Hyperglycemia-regulated tRNA-derived fragment tRF-3001a propels neurovascular dysfunction in diabetic mice. Cell Rep Med 2023, 4(10): 101209.

7）Xia M, Jiao L, Wang XH, Tong M, Yao MD, Li XM, Yao J, Li D, Zhao PQ, Yan B*. Single-cell RNA sequencing reveals a unique pericyte type associated with capillary dysfunction. Theranostics 2023, 13(8): 2515-2530.

8）Yao MD, Jiang Q, Ma Y, Zhu Y, Zhang QY, Shi ZH, Zhao C, Yan B*. Targeting circular RNA-MET for anti-angiogenesis treatment via inhibiting endothelial tip cell specialization. Mol Ther 2022, 30(3): 1252-1264.

9）Suo L, Liu C, Zhang QY, Yao MD, Ma Y, Yao J, Jiang Q, Yan B*. METTL3-mediated N(6)-methyladenosine modification governs pericyte dysfunction during diabetes-induced retinal vascular complication. Theranostics 2022, 12(1): 277-289.

10）Jiang Q, Liu C, Li CP, Xu SS, Yao MD, Ge HM, Sun YN, Li XM, Zhang SJ, Shan K, Liu BH, Yao J, Zhao C, Yan B*. Circular RNA-ZNF532 regulates diabetes-induced retinal pericyte degeneration and vascular dysfunction. J Clin Invest 2020, 130(7): 3833-3847.

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三、

董淑娴课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

董淑娴 PhD

上海交通大学医学院研究员、博士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、PI

国家海外优秀青年科学基金获得者（2021）

科技部重点研发计划青年项目首席科学家（2021）

上海市浦江人才

美国爱因斯坦医学院副研究员，博士后

美国斯隆凯特琳癌症中心博士后

2.研究方向：

干细胞调控生物学、衰老

3.原创性科研成果：

3.1 发现了分子伴侣介导的自噬（CMA）在造血干细胞激活及衰老中的关键调控作用；

3.2 创新性的构建了展示分子伴侣介导的自噬(CMA)的荧光报告小鼠,并成功分析了CMA活性在体内的时空变化；

3.3 揭示了蛋白酶体降解系统和溶酶体降解系统的相互作用，发现蛋白酶体激活因子REGγ可以通过调控去乙酰化酶SirT1 而调节巨自噬 (Macro-autophagy) 的开关，从而达到调控肝脏脂肪代谢的目的。

4.近5年代表性文章：

1)Dong S, Wang Q, Kao YR, Diaz A, Tasset I, Kaushik S, Zintiridou A, Nieves E, D’Angelo A, Will B, Cuervo AM. Chaperone-mediated autophagy sustains hematopoietic stem cell function. Nature, 2021, 591(7848): 117-123.

2)Dong S, Aguirre-Hernandez C, Scrivo A, Eliscovich C, Arias E, Bravo-Cordero JJ, Cuervo AM. Monitoring spatiotemporal changes in chaperone-mediated autophagy in vivo. Nature Communication, 2020.

3)Wei, Q., Pinho, S., Dong, S. et al. MAEA is an E3 ubiquitin ligase promoting autophagy and maintenance of haematopoietic stem cells. Nat Commun 12, 2522 (2021).

4)Gomez-Sintes R, Xin Q, Jimenez-Loygorri JI, McCabe M, Diaz A, Garner TP, Cotto-Rios XM, Wu Y, Dong S, Reynolds CA, Patel B, de la Villa P, Macian F, Boya P, Gavathiotis E, Cuervo AM. Targeting NCoR-RARainteraction activates chaperone-mediated autophagy and protects against retinal degeneration. Nat Commun. 2022 Jul 21;13(1):4220.

5)Kaushik S, Juste YR, Lindenau K, Dong S, Macho-González A, Santiago-Fernández O, McCabe M, Singh R, Gavathiotis E, Cuervo AM. Chaperone-mediated autophagy regulates adipocyte differentiation. Sci Adv. 2022 Nov 18;8(46):eabq2733.

6)Shuxian Dong, Britta Will, Ana Maria. Cuervo. Chaperone-mediated autophagy sustains hematopoietic stem cell function. Blood. Volume 134, Issue Supplement_1. November 13 2019

7)Lianlui S, Guangjian F, Peipei S, Xiaoying Q, Shuxian D., et al., Regulation of energy homeostasis by the ubiquitin-independent REGgamma proteasome. Nat Commun, 2016. 7: p. 12497

8)Yarui An, Ying Fu, Danqin Lu, Ya Wang, Wenji Bi, Zhiai Xu, Dong S., Zhang S. , et al., A TiO2-Au-polymer hybrid system for photoelectrochemical immunoassay of SirT1. J. Mater. Chem. B, 2014,2, 1644-1652

9)Dong S., Jia C., Zhang S., Fan G., Li Y., Shan P., Sun L., Xiao W., Li L., Zheng Y., et al., The REGgamma Proteasome Regulates Hepatic Lipid Metabolism through Inhibition of Autophagy. Cell Metab, 2013. 18(3): p. 380-91.

5.承担的课题：

1.2021年度科技部国重点研发青年项目首席科学家：2021YFA1102300，499万

2.2021年度国家海外优秀青年基金项目，300万

3.2021年度浦江人才（A类）计划项目：21PJ1412200，30万

4.2023年国家自然科学基金面上项目 82270169，2023.01-2026.12，52万，项目负责人

5.2023年上海市原创探索项目 23ZR1480500，2023.04-2026.03, 50万，项目负责人

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四、

蒋冬生课题组

联系方式：[email protected]

1.简介：

蒋冬生 PhD

上海交通大学医学院研究员、博士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、PI

国家海外优秀青年科学基金获得者（2021）

上海领军人才海外青年项目获得者（2021）

新加坡国立大学学士

新加坡国立大学博士

德国乌尔姆大学博士后

德国亥姆霍兹慕尼黑研究中心，再生生物和医学研究所青年PI、副所长

2.研究方向：

创面愈合与再生、疤痕形成机制与疤痕修复

3.原创性科研成果：

1）从成纤维细胞异质性的角度阐释了疤痕的成因，为预防疤痕的形成提供了全新的治疗思路（Nat Cell Biol 2018）；

2）修正了疤痕形成的传统观念，开创性地揭示了皮下筋膜是疤痕组织的主要来源（Nature 2019）；

3）用活体成像技术展示疤痕的形成过程和其细胞分子机制，为疤痕研究提供了一个全新的时空维度视角（Nat Commun 2020）；

4）建立创面和疤痕组织外植体模型和转基因小鼠模型，优化了疤痕机制研究过程中涉及体内、外实验的模型（Nat Commun 2023）。

4.近5年代表性文章：

1) Correa-Gallegos D^#, Jiang D^#, Christ S, Ramesh P, Ye H, Wannemacher J, Kalgudde Gopal S, Yu Q, Aichler M, Walch A, Mirastschijski U, Volz T, Rinkevich Y. (2019). Patch repair of deep wounds by mobilized fascia. Nature 576(7786): 287-292.

2)Jiang D, Correa-Gallegos D, Christ S, Stefanska A, Liu J, Ramesh P, Rajendran V, De Santis MM, Wagner DE, Rinkevich Y. (2018). Two succeeding fibroblastic lineages drive dermal development and the transition from regeneration to scarring. Nat Cell Biol 20(4): 422-431.

3)Kalgudde Gopal S^#, Dai R^#, Stefanska AM, Ansari M, Zhao J, Ramesh P, Bagnoli J W, Correa-Gallegos D, Lin Y, Christ S, Angelidis I, Lupperger V, Marr C, Davies LC, Enard W, Machens HG, Schiller HB*, Jiang D*, Rinkevich Y*. (2023). Wound infiltrating adipocytes are not myofibroblasts. Nat Commun 14: 3020.

4)Jiang D, Christ S, Correa-Gallegos D, Ramesh P, Kalgudde Gopal S, Wannemacher J, Mayr CH, Lupperger V, Yu Q, Ye H, Mück-Häusl M, Rajendran V, Wan L, Liu J, Mirastschijski U, Volz T, Marr C, Schiller HB, Rinkevich Y. (2020). Injury triggers fascia fibroblast collective cell migration to drive scar formation through N-cadherin. Nat Commun 11: 5653.

5)Jiang D, Singh K, Muschhammer J, Schatz S, Sindrilaru A, Makrantonaki E, Qi Y, Wlaschek M, Scharffetter-Kochanek K. (2020). MSCs rescue impaired wound healing in a murine LAD1 model by adaptive responses to low TGF-beta1 levels. EMBO Rep 21(4): e49115.

至今60篇SCI论文: https://orcid.org/0000-0003-0961-2671

5.承担的课题：

团队于2023年12月组建，获得国家海外优秀青年科学基金、上海领军人才（海外）等项目资助。

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五、

王俊课题组

联系方式：[email protected]

1.简介

王俊 PhD

上海交通大学医学院研究员、博士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、PI

国家高层次青年人才（2022）

广东省自然科学基金杰青（2021）

中国科学院博士

美国劳伦斯伯克利国家实验室、美国肯塔基大学博士后

2.研究方向

黏膜免疫、黏膜修复、炎癌转变

3.原创性科研成果

3.1 发现感染促进新生儿肝脏自身免疫性B细胞前体扩增诱导胆道闭锁，美罗华可有效修复患儿肝脏免疫稳态（Cell, 2020）。

3.2 发现胞内cAMP浓度缺乏是各种儿童炎症性肠病发病的共通机制, 通过使用一种泛PDE抑制剂潘生丁可有效治疗儿童炎症性肠病（Cell, 2019）。研究成果获得2019年中国医学重大进展。

4.近5年代表性文章 (#第一作者；*通讯作者)

1)JunWang^#, YanhuiXu^#, ZhanghuaChen^#, JiankunLiang^#, ZefengLin^#, HuiyingLiang^#, YipingXu, QiWu, XuanjieGuo, JunliNie, BingtaiLu, BingHuang, HuifangXian, XiaohuiWang, QiangWu, JixiaoZeng, ChengweiChai, MeixueZhang, YuzhenLin, LiZhang, ShanmeiziZhao, YanluTong, XiaoqiongGu, LiangZeng, Zhuang-guiChen,ShuhongYi, TongZhang, DavidDelfouneso, YanZhang, StephenLNutt, AndrewMLew, LiweiLu, FanBai^*, HuiminXia^*, ZheWen^*andYuxiaZhang^*. Liverimmuneprofilingrevealspathogenesisandtherapeuticsforbiliaryatresia.Cell, 2020, 187(7):1867-1883.

2)BingHuang# , ZhanghuaChen# , LanlanGeng#, JunWang#, HuiyingLiang#, YujiaCao, HuanChen, WanmingHuang, MeilingSu, HanqingWang, YanhuiXu, YukunLiu, LuB, HuifangXian, HuiwenLi, HuilinLi, LuRen, JingXie, LipingYe, HongliWang, JunhongZhao, PeiyuChen, LiZhang, ShanmeiziZhaoS, TingZhang, BanglaoXu, DiChe, WenyueSi, XiaoqiongGu, LiangZeng , YongWang , DingyouLi, YifanZhan, DavidDelfouneso, AndrewM. Lew, JunCui, WaiHo. Tang, YanZhang, SitangGong*, FanBai*, MinYang*, YuxiaZhang*. MucosalProfilingofPediatric-OnsetColitisandIBDRevealsCommonPathogenicsandTherapeuticPathways. Cell, 2019;179(5):1160-1176.

3)HuahuaXu, GuihongPan, JunWang*. Repairingmechanismsfordistalairwayinjuriesandrelatedtargetedtherapeuticsforchroniclungdiseases. CellTransplantation, 2023, 32:1-16.

4)BingtaiLu#, MingLiu#, JunWang#, HuifengFan#, DiyuanYang, LiZhang, XiaoqiongGu, JunliNie, ZhenjunChen, AlexandraJ. Corbett, MichaelJ. Zhan, ShengboZhang, VanessaL. Bryant, AndrewM. Lew, JamesMcCluskey, Hai-binLuo, JunCui, YuxiaZhang*, YifanZhan*, GenLu*. IL-17 productionbytissue-residentMAITcellsislocallyinducedinchildrenwithpneumonia. MucosalImmunol., 2020; 13(5):824-835.

5)DalongSun, JingChen, LongziLiu, GuangxiZhao, PingpingDong, BingruiWu, JunWang*, LingDong*. Establishmentofa 12-geneexpressionsignaturetopredictcoloncancerprognosis. PeerJ, 2018, 6:e4942.

5.承担的课题

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六、

王义平课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

王义平 PhD

上海交通大学医学院副研究员

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、PI

国家优秀青年科学基金获得者（2023）

复旦大学博士

哈佛大学/麻省总医院博士后

中国科协青年人才托举工程

上海市青年科技启明星

2.研究方向：

细胞代谢与人类疾病

3.原创性科研成果：

3.1 肿瘤细胞感知代谢物调控线粒体生物发生以维持能量稳态；

3.2 线粒体代谢重塑调控细胞应激和表观遗传促进肿瘤发生发展；

4.近5年代表性文章：

1)Weiwei Yan#, Chengmei Xie#, Sijun Sun#, Quan Zheng#, Jingyi Wang, Zihao Wang, Cheuk-Him Man, Haiyan Wang, Yunfan Yang, Tianshi Wang, Leilei Shi, Shengjie Zhang*, Chen Huang*, Shuangnian Xu*, Yi-Ping Wang*.SUCLG1 restricts POLRMT succinylation to enhance mitochondrial biogenesis and leukemia progression. EMBO Jounal, 2024 已接收

2)Yi-Ping Wang, Azeem Sharda, Shuang-Nian Xu, Nick van Gastel, Cheuk Him Man, Una Choi, Wei Zhong Leong, Xi Li, David T Scadden*. Malic enzyme 2 connects the Krebs cycle intermediate fumarate to mitochondrial biogenesis. Cell Metab. 2021 May 4;33(5):1027-1041.e8

3)Wei-Wei Yan, Yun-Liu Liang, Qi-Xiang Zhang, Di Wang, Ming-Zhu Lei, Jia Qu, Xiang-Huo He, Qun-Ying Lei, Yi-Ping Wang*. Arginine methylation of SIRT7 couples glucose sensing with mitochondria biogenesis. EMBO Reports. 2018 Dec;19(12). pii: e46377

4)Xing-Yu Zhong, Xiu-Ming Yuan, Ying-Ying Xu, Miao Yin, Wei-Wei Yan, Shao-Wu Zou, Li-Ming Wei, Hao-Jie Lu, Yi-Ping Wang*, Qun-Ying Lei*. CARM1 Methylates GAPDH to Regulate Glucose Metabolism and Is Suppressed in Liver Cancer. Cell Reports. 2018 Sep 18;24(12):3207-3223

5)Yi-Ping Wang*, Jin-Tao Li, Jia Qu, Miao Yin, Qun-Ying Lei*. Metabolite sensing and signaling in cancer. J Biol Chem. 2020 Aug 14;295(33):11938-11946

5.承担的课题：

团队自2023年组建以来，获得国家自然科学基金优秀青年基金、国家自然科学基金面上项目、科技部重点研发计划、上海市自然科学基金等多项资助，总经费逾700万。

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七、

卢鹏飞课题组

联系方式：[email protected]

（本课题组同时招聘技术员，详情请联系课题组长）

1.简介:

卢鹏飞 PhD

上海交通大学医学院研究员、博士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、PI

国家海外优秀青年科学基金获得者

上海市领军人才（海外）

上海市浦江人才

美国爱因斯坦医学院副研究员

美国爱因斯坦医学院博士后

中科院上海生化细胞所博士

山东大学学士

2.研究方向：

心血管发育与疾病

3.原创性科研成果：

3.1 揭示冠状血管发育与再生修复机制，为冠状动脉疾病的防治提供理论基础；

3.2 阐明先天性二叶式主动脉瓣的致病机理，并实现宫内发育畸形纠正，为先天性疾病的预防和治疗提供了全新思路；

3.3 发现心肌细胞异质性，为心脏心肌损伤修复治疗奠定基础。

4.近5年代表性文章：

1)Pengfei Lu*, Yidong Wang*, Yang Liu, Yifeng Wang, Bingruo Wu, Deyou Zheng, Richard P Harvey, Bin Zhou. Perinatal angiogenesis from pre-existing coronary vessels via DLL4-NOTCH1 signalling. Nature Cell Biology. 2021 Sep;23(9):967-977. (* Co-first author)

2)Pengfei Lu^#, Bingruo Wu, Yidong Wang, Megan Russell, Yang Liu, Daniel J Bernard, Deyou Zheng, Bin Zhou^#. Prerequisite endocardial-mesenchymal transition for murine cardiac trabecular angiogenesis. Developmental Cell. 2023 May 8; 58, 791-805. (# Co-corresponding author)

3)Pengfei Lu, Bingruo Wu, Xuhui Feng, Wei Cheng, Richard N Kitsis, Bin Zhou. Cardiac Myosin Heavy Chain Reporter Mice to Study Heart Development and Disease. Circulation Research. 2022 Aug 5;131(4):364-366.

4)Pengfei Lu*, Ping Wang*, Bingruo Wu, Yidong Wang, Yang Liu, Wei Cheng, Xuhui Feng, Xinchun Yuan, Miriam M Atteya, Haleigh Ferro, Yukiko Sugi, Grant Rydquist, Mahdi Esmaily, Jonathan T Butcher, Ching-Pin Chang, Jack Lenz, Deyou Zheng, Bin Zhou. A SOX17-PDGFB Signaling Axis Regulates Aortic Root Development. Nature Communications. 2022 Jul 13;13(1):4065. (* Co-first author)

5)Pengfei Lu^#, Bingruo Wu, Yidong Wang, Jingran Zhang, Bin Zhou^#. A sandwiched ventricular explant assay to model mouse coronary angiogenesis ex vivo. STAR Protocols. 2023 Oct 27;4(4):102619. (# Co-corresponding author)

6)Yidong Wang*, Pengfei Lu*, Bingruo Wu, Bernice E Morrow, Bin Zhou. NOTCH maintains developmental cardiac gene network through WNT5A. Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 2018 Dec;125:98-105. (* Co-first author)

7)Huahua Liu*, Pengfei Lu*, Shan He, Yuru Luo, Yuan Fang, Sonia Benkaci, Bingruo Wu, Yidong Wang, Bin Zhou. β-Catenin regulates endocardial cushion growth by suppressing p21. Life Science Alliance. 2023 Jun 29;6(9):e202302163. (* Co-first author)

5.承担的课题：

团队自2023年组建以来，获得中组部、国家自然科学基金、上海市等科研项目资助。

1. 中组部，海外优青，2024-2026，在研，主持

2. 国家自然科学基金委员会，面上项目，2024-2027，在研，主持。

3. 上海市委组织部，领军人才计划（海外），2023-2026，在研，主持

4. 上海市科委，浦江人才计划，2023-2025，在研，主持

5. 上海市第一人民医院，启动经费，2023-2027，在研，主持

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八、

陈思思课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

陈思思 PhD

上海交通大学医学院研究员、博士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、PI

国家海外优秀青年科学基金获得者

上海市领军人才（海外）

上海市浦江人才

纪念斯隆-凯特琳癌症中心博士后

哈佛大学医学院博士后

美国印第安纳大学医学院博士

2.研究方向：

造血干细胞与血液肿瘤

3.原创性科研成果：

3.1 重要基因突变调控造血干细胞自我更新以及克隆性造血的分子机制

3.2 驱动衰老相关的克隆性造血发生的重要内源和外源因素

3.3 血液肿瘤发生的机制及靶向策略

4.近5年代表性文章：

1)Chen S^#, Vedula RS^#, Navarro AC^#, Lu B, Hogg SJ, Wang E, Benbarche S, Knorr K, Kim WJ, Stanley RF, Cho H, Erickson C, Singer M, Cui D, Tittley S, Durham BH, Pavletich T, Fiala E, Walsh MF, Inoue D, Monette S, Taylor J, Rosen N, McCormick F, Lindsley RC, Castel P, Abdel-Wahab O. Impaired proteolysis of non-canonical RAS proteins drives clonal hematopoietic transformation. Cancer Discovery. 2022 Jul 29;12(10):2434-2453. doi:10.1158/2159-8290.CD-21-1631.

2)North K^#, Benbarche S^#, Liu B, Pangallo J, Chen S, Stahl M, Bewersdorf JP, Stanley RF, Erickson C, Cho H, Pineda JMB, Thomas JD, Polaski JT, Belleville AE, Gabel AM, Udy DB, Humbert O, Kiem HP, Abdel-Wahab O, Bradley RK. Synthetic introns enable splicing factor mutation-dependent targeting of cancer cells. Nature Biotechnology. 2022 Jul;40(7):1103-1113. doi: 10.1038/s41587-022-01224-2.

3)Chen S, Abdel-Wahab O. Splicing regulation in hematopoiesis. Current Opinion in Hematology. 2021 Jul 1;28(4):277-283. doi: 10.1097/MOH.0000000000000661.

4)Chen S, Benbarche S, Abdel-Wahab O. Splicing factor mutations in hematologic malignancies. Blood. 2021 Jun;138(8):599-612. doi:10.1182/blood.2019004260.

5)Inoue D^#, Polaski JT^#, Taylor J^#, Castel P, Chen S, Kobayashi S, Hogg SJ, Hayashi Y, Pineda JMB, El Marabti E, Erickson C, Knorr K, Fukumoto M, Yamazaki H, Tanaka A, Fukui C, Lu SX, Durham BH, Liu B, Wang E, Mehta S, Zakheim D, Garippa R, Penson A, Chew GL, McCormick F, Bradley RK, Abdel-Wahab O. Minor intron retention drives clonal hematopoietic disorders and diverse cancer predisposition. Nature Genetics. 2021 May;53(5):707-718. doi: 10.1038/ s41588-021-00828-9.

6)Chen S, Yu H, Gao R, Nabinger SC, Kobayashi M, Yao C, Liu SZ, Yoder MC, Kapur R, Broxmeyer HE, Gao Z, and Liu Y. Mutant p53 Drives Clonal Hematopoiesis through Modulating Epigenetic Pathway. Nature Communications. 2019 Dec 11;10(1):5649. doi: 10.1038/ s41467-019-13542-2.

7)Chen S and Liu Y. p53 involvement in clonal hematopoiesis of indeterminate potential. Current Opinion in Hematology. 2019 Jul;26(4):235-240. doi:10.1097/MOH.0000000000000509.

8)Chen S, Gao R, Yao C, Kobayashi M, Liu SZ, Yoder MC, Broxmeyer HE, Kapur R, Boswell HS, Mayo LD, and Liu Y. Genotoxic stresses promote the clonal expansion of hematopoietic stem cells expressing mutant p53. Leukemia. 2018 Mar;32(3):850-854. doi:10.1038/leu.2017.325.

9)Cai Z, Kotzin JJ, Ramdas B, Chen S, Nelanuthala S, Palam LR, Pandey R, Mali RS, Liu Y, Kelley MR, Sandusky G, Mohseni M, Williams A, Henao-Mejia J, Kapur R. Inhibition of Inflammatory Signaling in Tet2 Mutant Preleukemic Cells Mitigates Stress-Induced Abnormalities and Clonal Hematopoiesis. Cell Stem Cell. 2018 Dec 6;23(6):833-849.e5. doi:10.1016/j.stem.2018.10.013.

5.承担的课题：

课题组自2023年组建以来，获得中组部、上海市等人才项目资助。

1.国家海外优秀青年科学基金，中组部，2024-2026，在研，主持。

2.上海市领军人才（海外），上海市委组织部，2024-2026，在研，主持。

3.上海市白玉兰人才计划浦江项目，上海市科委，2023-2025，在研，主持。

4.上海市第一人民医院启动经费，2023-2027，在研，主持。

5.Leukemia & Lymphoma Society Career Development Award, 2021-2024，在研，主持。

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九、

周鲁明课题组

联系方式：[email protected]

[email protected]

1.简介:

周鲁明 PhD

上海交通大学医学院研究员

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、PI

国家海外优秀青年科学基金获得者

上海市领军人才计划

英国伦敦帝国理工学院医学院博士后

德国图宾根大学医学院Hertie研究所博士

2.研究方向：

神经损伤与修复、神经免疫学、衰老神经生物学

3.原创性科研成果：

3.1 发现CXCL13依赖性CD8⁺ T细胞与背根神经节（DRG）神经元交互在老年小鼠坐骨神经再生衰退中的重要作用，并利用CXCL13特异性抗体治疗显著提升了坐骨神经的再生与功能修复，填补了干预手段逆转衰老导致神经再生退化的空白；

3.2 在神经内源性再生机制方面，阐明了在DRG神经元再生过程中发挥重要作用的组蛋白乙酰化与代谢调控机制。

4.近5年代表性文章：

1)Zhou, L., Kong, G., Palmisano, I., Cencioni, M.T., Danzi, M., De Virgiliis, F., Chadwick, J.S., Crawford, G., Yu, Z., and De Winter, F. (2022). Reversible CD8 T cell–neuron cross-talk causes aging-dependent neuronal regenerative decline. Science 376, eabd5926.

2)Serger, E., Luengo-Gutierrez, L., Chadwick, J.S., Kong, G., Zhou, L., Crawford, G., Danzi, M.C., Myridakis, A., Brandis, A., and Bello, A.T. (2022). The gut metabolite indole-3 propionate promotes nerve regeneration and repair. Nature 607, 585-592.

3)Müller, F. *, De Virgiliis, F. *, Kong, G. *, Zhou, L. *, Serger, E., Chadwick, J., Sanchez-Vassopoulos, A., Singh, A.K., Eswaramoorthy, M., and Kundu, T.K. (2022). CBP/p300 activation promotes axon growth, sprouting, and synaptic plasticity in chronic experimental spinal cord injury with severe disability. PLoS biology 20, e3001310. (*co-first author)

4)Kong, G.*, Zhou, L.*, Serger, E., Palmisano, I., De Virgiliis, F., Hutson, T.H., Mclachlan, E., Freiwald, A., La Montanara, P., and Shkura, K., Puttagunta R., Di Giovanni S. (2020). AMPK controls the axonal regenerative ability of dorsal root ganglia sensory neurons after spinal cord injury. Nature Metabolism 2, 918-933. (*co-first author).

5)De Virgiliis, F., Hutson, T.H., Palmisano, I., Amachree, S., Miao, J., Zhou, L., Todorova, R., Thompson, R., Danzi, M.C., and Lemmon, V.P. (2020). Enriched conditioning expands the regenerative ability of sensory neurons after spinal cord injury via neuronal intrinsic redox signaling. Nature Communications 11, 1-16.

6)Hervera, A.*, Zhou, L.*, Palmisano, I., McLachlan, E., Kong, G., Hutson, T.H., Danzi, M.C., Lemmon, V.P., Bixby, J.L., Matamoros‐Angles, A., Forsberg K., De Virgiliis F., Matheos D.P., Kwapis J., Wood M.A., Puttagunta R., Del Rio Ja., Di Giovanni S. (2019). PP4‐dependent HDAC3 dephosphorylation discriminates between axonal regeneration and regenerative failure. The EMBO journal 38. (*co-first author).

7)De Virgiliis, F., Hutson, T.H., Palmisano, I., Amachree, S., Miao, J., Zhou, L., Todorova, R., Thompson, R., Danzi, M.C., and Lemmon, V.P., Bixby J.L., Wittig I., Shah A.M., Di Giovanni S. (2020). Enriched conditioning expands the regenerative ability of sensory neurons after spinal cord injury via neuronal intrinsic redox signaling. Nature Communications 11, 1-16.

8)Palmisano, I., Danzi, M.C., Hutson, T.H., Zhou, L., McLachlan, E., Serger, E., Shkura, K., Srivastava, P.K., Hervera, A., and O’Neill, N., Liu T., Dhrif H., Wang Z., Kubat M., Wuchty S., Merkenschlager M., Levi L., Elliott E., Bixby J.L., Lemmon V.P., Di Giovanni S. (2019). Epigenomic signatures underpin the axonal regenerative ability of dorsal root ganglia sensory neurons. Nature Neuroscience 22, 1913-1924.

9)Hutson, T.H., Kathe, C., Palmisano, I., Bartholdi, K., Hervera, A., De Virgiliis, F., McLachlan, E., Zhou, L., Kong, G., and Barraud, Q., Danzi M.C., Medrano-Fernandez A., Lopez-Atalaya J.P., Boutillier A.L., Sinha S.H., Singh A.K., Chaturbedy P., Moon L.D.F., Kundu T.K., Bixby J.L., Lemmon V.P., Barco A., Courtine G., Di Giovanni S. (2019). Cbp-dependent histone acetylation mediates axon regeneration induced by environmental enrichment in rodent spinal cord injury models. Science Translational Medicine 11, eaaw2064.

10)Hervera, A., De Virgiliis, F., Palmisano, I., Zhou, L., Tantardini, E., Kong, G., Hutson, T., Danzi, M.C., Perry, R.B.-T., and Santos, C.X., Kapustin A.N., Fleck R.A., Del Rio J.A., Carroll T., Lemmon V.P., Bixby J.L., Shah A.M., Fainzilber M., Di Giovanni S. (2018). Reactive oxygen species regulate axonal regeneration through the release of exosomal NADPH oxidase 2 complexes into injured axons. Nature Cell Biology 20, 307-319.

5.承担的课题：

团队预计于2024年初正式组建运行。目前获得国家自然科学基金面上项目1项。

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十、

孔德平课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

孔德平 PhD

上海交通大学医学院副研究员、硕士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、PI

上海市青年科技启明星（2021）

中国科学院大学博士

天津医科大学博士后

中国生理学会循环委员会委员

中国药理学会心血管药理委员会青年委员

2.研究方向：

血管免疫学、血管代谢生物学

3.科研成果：

3.1 结合非激素类消炎药NSAID临床应用中存在的心血管问题，解析COX-2下游脂质代谢产物前列腺素D2在炎症与心血管稳态的相关研究。对合理使用NSAID提供了理论依据，也为筛选抗心血管疾病的第三代NSAID提供了潜在靶点。

3.2 聚焦代谢性炎症与血管稳态的基础医学与临床转化研究，围绕代谢和免疫在病理状态下相互作用的调控网络，从RNA多样性层面挖掘血管重构的异质性新靶点。

4.代表性文章：

1)Kong D*#, Liu J#, Lu J#, Chen H, Duan Z, Ke Yu, Zheng X, Zou P, Zhou L, Zeng C, Lv Y, Zeng Q, Lu L, Li L, He Y*. HMGB2 Release Promotes Pulmonary Hypertension and Predicts Severity and Mortality of Patients with Pulmonary Arterial Hypertension. Arterioscler Thromb Vasc Biol. doi: 10.1161/ATVBAHA.123.319916. (2024)

2)Wu H, Lu Y, Duan Z, Wu J, Lin M, Wu Y, Han S, Li T, Fan Y, Hu X, Xiao H, Feng J, Lu Z*, Kong D*, Li S*. Nanopore long-read RNA sequencing reveals functional alternative splicing variants in human vascular smooth muscle cells. Commun Biol. 6(1):1104. (2023 )

3)Kong D^#*; YuY* ; Prostaglandin D2 signaling and cardiovascular homeostasis, J Mol Cell Cardiol,167: 97-105(2022)

4)Kong D^#, Wan Q^#, Li J, et al, Yu Y*. DP1 activation reverses age-related hypertension via NEDD4L-mediated T-bet degradation in T Cells. Circulation. 141(8):655-666 (2020)

5)He Y^#, Zuo C^#, Jia D^#, Bai P^#, Kong D^#, Chen D^#, Liu G, et al, Wang J*, Lyu A*, Shen Y*, Yu Y*. Loss of DP1 aggravates vascular remodeling in pulmonary arterial hypertension via mTORC1 signaling. Am J Respir Crit Care Med. doi: 10.1164/rccm.201911-2137OC. (2020)

6)Li J^#, Kong D^#, Wang Q^#, Wu W^#, Tang Y, et al, Wang L*, Yu Y*. Niacin ameliorates ulcerative colitis by activation of D prostanoid receptor 1. EMBO Mol Med. 9(5):571-588 (2017)

7)Kong D, Li J, Shen Y, et al, Yu Y*. Niacin promotes cardiac healing after myocardial infarction through activation of myeloid Prostaglandin D₂ receptor subtype 1. J Pharmacol Exp Ther. 360:435-444 (2017).

8)Kong D, Shen Y, Zuo S, et al, Yu Y*. PKA regulatory IIa subunit is essential for PGD₂-mediated resolution of inflammation. J Exp Med. 213:2209-26 (2016).

5.承担的课题：

团队自2020年组建以来，获得获得医院启动经费、国家自然科学基金面上基金、专项基金和上海市科委项目等多项资助。

1）糖酵解醛缩酶ALDOA及其乳酰化修饰调控肺动脉高压中血管重塑的作用和机制研究(国家自然科学基金委员会, 专项项目, 82241018, 2023.01 - 2025.12, 50万元);

2）NEDD4L下调介导的IRS4积累在心肌梗死中的作用及机制研究 (国家自然科学基金委员会, 面上项目, 82170253, 2022.01-2025.12, 58万元);

3）E3泛素连接酶NEDD4L在心肌梗死中的作用及机制研究 (上海市科学技术委员会, 上海市自然科学基金原创探索类项目, 21ZR1481200, 2021.07-2024.06, 50万元)。

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十一、

李胜利课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

李胜利 PhD

上海交通大学医学院副研究员、硕士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、PI

上海市青年科技启明星

上海市领军人才（海外）

美国德州大学休斯顿健康科学中心博士后

复旦大学博士

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会委员

中国生物信息学会（筹）重大疾病组学信息学专委会委员

2.研究方向：

计算生物学与生物信息学、蛋白质翻译及调控、肿瘤发生与精准医疗

3.原创性科研成果：

3.1 解析了肿瘤RNA转录本图谱，识别了大量未注释的RNA转录本（如AC092803-u1）,构建了RNA结合蛋白-转录本-抗肿瘤药物关系网络（如PTBP1-KIAA1522-a6-Decitabine）,并识别了癌症类型特异的RNA标志物；

3.2 提出了基于蛋白质组的胃食管结合部肿瘤的三种分子分型，并识别了不同分子亚型特异的潜在药物靶点。

4.近5年代表性文章：

1)Hu W, Wu Y, Shi Q, Wu J, Kong D, Wu X, He X, Liu T, Li S^*. Systematic characterization of cancer transcriptome at transcript resolution. Nat Commun. 2022 Nov 10;13(1):6803. PMID:36357395.

2)Shi Q, Liu T, Hu W, Chen Z, He X, Li S^*. SRTdb: an omnibus for human tissue and cancer-specific RNA transcripts. Biomark Res. 2022 Apr 26;10(1):27. PMID: 35473935.

3)Wu H, Lu Y, Duan Z, Wu J, Lin M, Wu Y, Han S, Li T, Fan Y, Hu X, Xiao H, Feng J, Lu Z, Kong D, Li S*. Nanopore long-read RNA sequencing reveals functional alternative splicing variants in human vascular smooth muscle cells. Commun Biol. 2023 Oct 31;6(1):1104. PMID: 37907652

4)Li S, Yuan L, Xu Z, Xu J, Chen G, Guan X, Pan G, Hu C, Dong J, Du Y, Yang L, Ni M, Jiang R, Zhu X, Lv H, Xu H, Zhang S, Qin J, Cheng X. Integrative proteomic characterization of adenocarcinoma of esophagogastric junction. Nat Commun. 2023 Feb 11;14(1):778. PMID: 36774361.

5)Li S, Hu Z, Zhao Y, Huang S, He X. Transcriptome-wide analysis reveals the landscape of aberrant alternative splicing events in liver cancer. Hepatology. 2019 Jan;69(1):359-375.

6)Li S, Li Y, Chen B, Zhao J, Yu S, Tang Y, Zheng Q, Li Y, Wang P, He X, Huang S. exoRBase: a database of circRNA, lncRNA and mRNA in human blood exosomes. Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D106-D112. PMID: 30053265.

7)Li S, Zhang J, Huang S, He X. Genome-wide analysis reveals that exon methylation facilitates its selective usage in the human transcriptome. Brief Bioinform. 2018 Sep 28;19(5):754-764. PMID: 28334074.

8)Feng J, Wu H, Li S*. Noncanonical translation of circRNAs drive antitumor immunity. Trends Cancer. 2024 Jan 18:S2405-8033(24)00006-2. PMID: 38242823.

9)Liu Y, Hu W, Xie Y, Tang J, Ma H, Li J, Nie J, Wang Y, Gao Y, Cheng C, Li C, Ma Y, Su S, Zhang Z, Bao Y, Ren Y, Wang X, Sun F, Li S*, Lu R. Single-cell transcriptomics enable the characterization of local extension in retinoblastoma. Commun Biol. 2024 Jan3;7(1):11. PMID: 38172218.

10)Wu Y, Xu M, Feng Z, Wu H, Wu J, Ha X, Wu Y, Chen S, Xu F, Wen H, Li S^*, Wu X. AUF1-induced circular RNA hsa_circ_0010467 promotes platinum resistance of ovarian cancer through miR-637/LIF/STAT3 axis. Cell Mol Life Sci. 2023 Aug 17;80(9):256. PMID: 37589744.

11)Li C, Wu H, Guo L, Liu D, Yang S, Li S^*, Hua K. Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and molecular stratification of cervical cancer. Commun Biol. 2022 Nov 10;5(1):1208. PMID: 36357663.

12)Zhang J, Li S^#, Zhang L, Xu J, Song M, Shao T, Huang Z, Li Y. RBP EIF2S2 promotes tumorigenesis and progression by regulating MYC-mediated inhibition via FHIT-related enhancers. Mol Ther. 2020 Apr 8;28(4):1105-1118. PMID: 32059763.

13)Zhang J, Li S^#, Zhang J. Docetaxel resistance-derived LINC01085 contributes to the immunotherapy of hormone-independent prostate cancer by activating the STING/MAVS signaling pathway. Cancer Lett. 2022 Oct 1:545:215829. PMID: 35868534.

14)Shen M, Li S^#, Zhao Y, Liu Y, Liu Z, Huan L, Qiao Y, Wang L, Han L, Chen Z, He X. Hepatic ARID3A facilitates liver cancer malignancy by cooperating with CEP131 to regulate an embryonic stem cell-like gene signature. Cell Death Dis. 2022 Aug 25;13(8):732. PMID: 36008383.

15)Chen Z, Li S^#, Shen M, Lu X, Bao C, Chen D, Ding J, Wang Q, Huang S, Cong W, Han L, He X. The Mutational and transcriptional landscape of hepatocarcinogenesis in a rat model. iScience. 2020 Oct 15;23(11):101690. PMID: 33163943.

16)Xu J, Wang Z, Li S^#, Chen J, Zhang J, Jiang C, Zhao Z, Li J, Li Y, Li X. Combinatorial epigenetic regulation of non-coding RNAs has profound effects on oncogenic pathways in breast cancer subtypes. Brief Bioinform. 2018 Jan 1;19(1):52-64. PMID: 27742663.

17)Ruan H, Xiang Y, Ko J, Li S^#, Jing Y, Zhu X, Ye Y, Zhang Z, Mills T, Feng J, Liu C, Jing J, Cao J, Zhou B, Wang L, Zhou Y, Lin C, Guo A, Chen X, Diao L, Li W, Chen Z, He X, Mills G, Blackburn M, Han L. Comprehensive characterizationof circular RNAs in ~1000 human cancer cell lines. Genome Med. 2019 Aug 26;11(1):55. PMID: 311446897.

5.承担的课题：

6.软件著作权：

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十二、

林达课题组

联系方式：[email protected]

1.简介

林达 PhD

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、PI

第三届博士后创新人才支持计划（2018）

2.研究方向：

肿瘤基因组学、三维基因组学、单细胞组学

3.原创性研究成果

3.1 开发了一系列新型染色质空间构象捕获及基因组结构变异检测技术，其中包括针对大量细胞的DLO Hi-C（Nature Genetics，2018），针对微量细胞的DLO Hi-C 2.0（JGG，2020），针对单细胞的sciDLO Hi-C（Nature Communications，2022）。Nature Genetics专门发表评论文章，对DLO Hi-C方法给予较高评价。

3.2 利用DLO Hi-C系列技术，解析了巨噬细胞分化及免疫活化过程中染色质空间构象重塑和表观修饰重编程，拓展了疾病易感基因，发掘了新的药物治疗靶点，寻找到了新的潜在治疗药物。

3.3 基于肿瘤基因组三维结构特征，开发了多重基因组结构异常及ecDNA检测方法MGA-Seq，并绘制了肾癌组织中ecDNA互作网络（Genome Biology，2023）。

4.近5年代表性文章：

1)Da Lin^#, Ping Hong^#, Siheng Zhang, Weize Xu, Muhammad Jamal, Keji Yan, Yingying Lei, Liang Li, Yijun Ruan, Zhen F. Fu, Guoliang Li^*, Gang Cao^*, Digestion-ligation-only Hi-C is an efficient and cost-effective method for chromosome conformation capture, Nature Genetics, 2018, 50(5): 754-763. (5-year IF: 39.321) (亮点文章，Nature genetics同期评论文章专题报道)。

2)Da Lin^*#, Yanyan Zou^#, Xinyu Li, Jinyue Wang, Qin Xiao, Xiaochen Gao, Fei Lin, Ningyuan Zhang, Ming Jiao, Yu Guo, Zhaowei Teng, Shiyi Li, Yongchang Wei, Fuling Zhou, Rong Yin, Siheng Zhang, Lingyu Xing, Weize Xu, Xiaofeng Wu, Bing Yang, Ke Xiao, Chengchao Wu, Yingfeng Tao, Xiaoqing Yang, Jing Zhang, Sheng Hu, Shuang Dong, Xiaoyu Li, Shengwei Ye, Zhidan Hong, Yihang Pan, Yuqin Yang, Haixiang Sun^*, Gang Cao^*, MGA-seq: robust identification of extrachromosomal DNA and genetic variants using multiple genetic abnormality sequencing, 2023, Genome Biology. (5-year IF: 17.4)

3)Da Lin^#, Weize Xu^#, Ping Hong^#, Chengchao Wu, Zhihui Zhang, Siheng Zhang, Lingyu Xing, Bing Yang, Wei Zhou, Qin Xiao, Jinyue Wang, Cong Wang, Yu He, Xi Chen, Xiaojian Cao, Jiangwei Man, Aikebaier Reheman, Xiaofeng Wu, Xingjie Hao, Zhe Hu, Chunli Chen, Zimeng Cao, Rong Yin, Zhen F. Fu, Rong Zhou, Zhaowei Teng, Guoliang Li^*, Gang Cao^*, Decoding the Spatial Chromatin Organization and Dynamic Epigenetic Landscapes of Macrophage Cells During Differentiation and Immune Activation, Nature Communications, 2022 Oct 4;13(1):5857. (5-year IF: 17.763)

4)Zhihui Zhang, Chengchao Wu, Khaista Rahman, Weize Xu, Guoliang Li^*, Da Lin^*, Gang Cao^*, Robust capturing chromosome conformation using the DLO Hi-C 2.0 method, Journal of Genetics and Genomics, 2020, 47(10): 655-658.

5)Da Lin, Siheng Zhang, Zhihui Zhang, Weize Xu, Ping Hong, Guoliang Li, Gang Cao, The "toolbox" for chromatin conformation capture (in Chinese), SCIENTIA SINICA Vitae, 2020, 50(5): 497-505.

5.承担的课题

先后主持国自然面上项目（2024）、国自然青年项目（2019）、博士后创新人才支持计划（2018）、博士后一等面上资助（2018）等基金项目多项。

6.授权专利：

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十三、

施雷雷课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

施雷雷 PhD

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、PI、博士生导师

上海市浦江人才

2.研究方向：

生物活性光敏剂、多肽水凝胶材料

3. 原创性科研成果：

3.1 分子靶向光敏剂。本团队突破传统光敏剂在应用过程中遇到的瓶颈问题，例如O₂含量、自由基清除以及激光光源等的限制，先后开发了四代光敏剂，尤其是最新一代的自发光分子靶向光敏剂能够在低氧状态下，通过病灶部位特殊生理生化特征的刺激下能够驱动光敏剂自发光产生氧自由基；

3.2 生物大分子药物透皮递送。皮肤角质层的屏障作用使得药物透皮速率和渗透量难以满足治疗的需求，是开发透皮给药制剂的重大障碍，尤其是大分子生物药类。针对生物大分子透皮递送领域的难题，研究团队通过大量的筛选，设计出了具备高透皮性能的新型多肽水凝胶材料，可高效透皮递送功能核酸、功能蛋白等生物大分子药物。

4.近5年代表性文章：

1)Leilei Shi, Peng Zhang, Xiaoxiao Liu, Yuzhen Li, Wenbo Wu, Xihui Gao*, and Bin Liu*. “An Activity-Based Photosensitizer to Reverse Hypoxia and Oxidative Resistance for Tumor Photodynamic Eradication” Advanced Materials, 34 (2022), 202206659. (IF: 32.086, 1区)

2)Leilei Shi, Xiaoxiao Liu, Yuzhen Li, Sha Li, Wenbo Wu, Xihui Gao*, and Bin Liu*. “Living Bacteria-Based Immuno-Photodynamic Therapy: Metabolic Labeling of Clostridium Butyricum for Eradicating Malignant Melanoma” Advanced Science, 9 (2022), e2105807. (IF: 17.521, 1区)

3)Leilei Shi, Wenbo Wu, Yukun Duan, Li Xu, Sha Li, Xihui Gao*, and Bin Liu*. “Carrier-Free Hybrid DNA Nanoparticles for Light-induced Self-Delivery of Functional Nucleic Acid Enzymes” ACS Nano, 15 (2021), 1841-1849. (IF: 18.027, 1区)

4)Leilei Shi, Wenbo Wu, Yukun Duan, Li Xu, Yingying Xu, Lidan Hou, Xiangjun Meng, Xinyuan Zhu, and Bin Liu*. “Light Induced Self-Escape of Spherical Nucleic Acid from Endo/Lysosome for Efficient Non-Cationic Gene Delivery” Angew. Chem. Int. Ed., 59 (2020), 19168-19174. (IF: 16.823, 1区)

5)Leilei Shi, Fang Hu, Yukun Duan, Wenbo Wu, Jinqiao Dong, Xiangjun Meng, Xinyuan Zhu, Bin Liu*. “Hybrid Nanospheres to Overcome Hypoxia and Intrinsic Oxidative Resistance for Enhanced Photodynamic Therapy.” ACS Nano, 14 (2020), 2183-2190. (IF: 18.027, 1区)

6)Lianfeng Fan, Chuanjiang Jian, Ling Li, Li Wang, Xuejiao Song, Minjia Wang, Chutong Liu, Xiaoxiao Liu, Shidang Xu, Xihui Gao*, Xianjie Shi, Miaomiao Yuan*, Bin Liu*, Leilei Shi*, “A Bioactive Photosensitizer for Hypoxia-Tolerant Molecular Targeting-Photo-Immunotherapy of Malignant Tumor”, Advanced Functional Materials, 2023, 202313755. (IF:19.0, 1区)

7)Yu Tian, Li Wang, Yunyun Qian, Ling Li, Hao Li*, Xuejiao Song, Minjia Wang, Najia Zhu, Yao Tong, Wenbo Wu*, Leilei Shi*, “DNA-Targeting Bioactive Photosensitizer for Chemo-Photodynamic Therapy of Malignant Tumor”, ACS Materials Letters, 6 (2024), 969−975. (IF: 11.4, 1区)

8)Chuan Ma, Chuanjiang Jian, Lihao Guo, Wenting Li, Cai Zhang, Li Wang, Miaomiao Yuan, Peng Zhang*, Jinqiao Dong, Ping He*, Leilei Shi*, “Adipose Tissue Targeting Ultra-Small Hybrid Nanoparticles for Synergistic Photodynamic Therapy and Browning Induction in Obesity Treatment”, Small, 2023, e2308962. (IF:13.3, 1区)

5.承担的课题：

团队自2022年组建以来，获得国家自然科学基金、广东省自然科学基金等多项基金项目支持。

6.发明专利：

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十四、

杨正峰课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

杨正峰 PhD

上海交通大学医学院副研究员、硕士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、青年PI

疑难疾病精准研究中心副主任

急诊危重病科科研副主任

上海高校青年东方学者

上海市浦江人才计划

上海交通大学医学院“双百人”临床专职科研队伍

圣路易斯华盛顿大学博士后

华东师范大学博士

2.研究方向：

钙信号调控与黏膜病理

3.原创性科研成果：

3.1 阐明LGR4突变及下游钙信号异常所致人类骨质疏松的原因，揭示RANKL自身负反馈抑制通路，发现LGR4是RANKL新型受体，研究鉴定的LGR4重组蛋白可作为相关疾病潜在药物；

3.2 明晰SOCE介导的钙稳态调节机制在髓样细胞及其分化的破骨细胞和巨噬细胞炎性应答中的作用，以及由此对病理条件下骨质平衡及细胞因子风暴的调控；

3.3 发现百草枯为STIM1的小分子激动剂及在肺纤维化进展中的作用机制。

4.近年来代表性文章：

1)1. Wang R#, Peng X#, Yuan Y#, Shi B#, Liu Y, Ni H, Guo W, Yang Q, Liu P, Wang J, Su Z, Yu S, Liu D, Zhang J, Xia J, Liu X*, Li H*, Yang Z*, Peng Z*. Dynamic immune recovery process after liver transplantation revealed by single-cell multi-omics analysis. Innovation (Camb). 2024 Mar 1;5(3):100599. doi: 10.1016/j.xinn.2024.100599. eCollection 2024 May 6.

2)Yang W#, Tian R#, Zhu Y#, Huang P#, Ma X, Meng X, Dai W, Tao Y, Chen D, Zhang J, Lu J, Xie H, Jian X*, Yang Z*, Wang R*. Paraquat is an agonist of STIM1 and increases intracellular calcium levels. Commun Biol. 2022 Oct 30;5(1):1151. doi: 10.1038/s42003-022-04130-0.

3)Yang Z, Yan H, Dai W, Jing J, Yang Y, Mahajan S, Zhou Y, Li W, Macaubas C, Mellins ED, Shih CC, Fitzpatrick JAJ, Faccio R*. Tmem178 negatively regulates store-operated calcium entry in myeloid cells via association with STIM1. J Autoimmun. 2019 Jul;101:94-108.

4)Yang Z, Kim S, Mahajan S, Zamani A, Faccio R*. Phospholipase Cγ1 (PLCγ1) Controls Osteoclast Numbers via Colony-stimulating Factor 1 (CSF-1)-dependent Diacylglycerol/β-Catenin/CyclinD1 Pathway. J Biol Chem. 2017 Jan 27;292(4):1178-1186..

5)Luo J#*, Yang Z#, Ma Y, Yue Z, Lin H, Qu G, Huang J, Dai W, Li C, Zheng C, Xu L, Chen H, Wang J, Li D, Siwko S, Penninger JM, Ning G, Xiao J*, Liu M*.LGR4 is a receptor for RANKL and negatively regulates osteoclast differentiation and bone resorption. Nat Med. 2016 May;22(5):539-46.

5.承担的课题：

团队自2019年组建以来，获得国家自然科学基金面上项目、科技部重点研发计划计划子课题等国家级省部级多项资助，总经费逾400万。

6.授权专利：

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十五、

汤晓芳课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

汤晓芳 PhD

上海交通大学医学院附属第一人民医院 课题组长、青年PI

美国希望之城国家癌症中心博士后

中国科学院动物研究所博士

2.研究方向：

内皮细胞、血管生成、糖尿病及其并发症研究、

3.代表性文章：

1)Tang X^#, Miao Y^#, Luo Y, Sriram K, Qi Z, Lin FM, Gu Y, Lai CH, Hsu CY, Peterson KL, Van Keuren-Jensen K, Fueger PT, Yeo GW, Natarajan R, Zhong S, Chen ZB^*. Suppression of endothelial AGO1 promotes adipose tissue browning and improves metabolic dysfunction. Circulation. (2020) Jul 28;142(4):365-379. 9.

2)Tang X^#, Luo Y^#, Yuan D^#, Calandrelli R, Malhi NK, Sriram K, Miao Y, Lou CH, Tsark W, Tapia A, Chen AT, Zhang G, Roeth D, Kalkum M, Wang ZV, Chien S, Natarajan R, Cooke JP, Zhong S, Chen ZB^*. Long Non-Coding RNA LEENE Promotes Angiogenesis and Ischemic Recovery in Diabetes Model. Long Non-Coding RNA LEENE Promotes Angiogenesis and Ischemic Recovery in Diabetes Model. J Clin Invest. (2022) Dec 13;e161759.

3)Tang X^#*, Lai CH^#, Malhi NK, Chadha R, Luo Y, Liu X, Yuan D, Tapia A, Abdollahi M, Zhang G, Calandrelli R, Shiu YT, Wang ZV, Rhee JW, Zhong S, Natarajan R, Chen ZB^*. Genetic Deletion of the LINC00520 Homolog in Mouse Aggravates Angiotensin IIInduced Hypertension. Noncoding RNA. 2023 May 15;9(3):31.

4)Malhi NK^#, Luo Y^#, Tang X^#, Sriram K, Calandrelli R, Zhong S, Chen ZB. Isolation and Profiling of Human Primary Mesenteric Arterial Endothelial Cells at the Transcriptome Level. J Vis Exp. (2022) Mar 14;(181)

5)Tang X^#, Chen Y, Ran H, Jiang Y, He B, Wang B, Kong S^*, Wang H^*. Systemic morphine treatment derails normal uterine receptivity leading to embryo implantation failure. Biol Reprod (2015). May; 92(5):118. (第二作者，IF:3.6)

6)Tang X^#, Zhang C^*. Relationship between Sloan-Kettering virus expression and mouse follicular development. Endocrine (2011) 40:187–195. (第一作者，IF:4.285)

7)Furuta K, Tang X, Islam S, Tapia A, Chen ZB, Ibrahim SH. Endotheliopathy in the metabolic syndrome: Mechanisms and clinical implications. Pharmacol Ther. 2023 Apr; 244:108372. 2023.108372. Epub 2023 Mar 7.

8)Jiang R^#, Tang X, Pan J, Li G, Yang N, Tang Y, Bi S, Cai H, Chen Q, Chen D, Wang H^*, Kong S^*. CDC42 deficiency compromises oviduct multiciliogenesis derailing timely embryo transportation in early pregnancy. Cell Death Dis. (2022) Sep 2;13(9):757.

9)Lai CH^#, Chen AT^#, Burns AB^#, Sriram K, Luo Y, Tang X, Branciamore S, O'Meally D, Chang SL, Huang PH, Shyy JY, Chien S, Rockne RC, Chen ZB^*. RAMP2-AS1 Regulates Endothelial Homeostasis and Aging. Front Cell Dev Biol. (2021) Feb 12; 9:635307.

10)Calandrelli R^#, Xu L^#, Luo Y^#, Wu W, Fan X, Nguyen T, Chen CJ, Sriram K, Tang X, Burns AB, Natarajan R, Chen ZB^*, Zhong S^*. Stress-induced RNA-chromatin interactions promote endothelial dysfunction. Nat Commun. (2020) Oct 15;11(1):521.

11)Feng L^#, Wang Y, Cai H, Sun G, Niu W, Xin Q, Tang X, Zhang J, Wang C, Zhang H^*, Xia G*. ADAM10-Notch signaling governs the recruitment of ovarian pregranulosa cells and controls folliculogenesis in mice. J Cell Sci. (2016) Jun 1;129(11):2202-12.

12)Chen Y^#, Kong S, Tang X, Fu Y, Wang B, Zhang S^*, Wang H^*. Preimplantation mouse embryo is a target for opioid ligand-receptor signaling. Biol Reprod. (2014) Jul;91(1):4.

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十六、

楼方舟课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

楼方舟PhD

上海交通大学医学院副研究员、硕士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、青年PI

上海市青年科技启明星（2022）

上海交通大学医学院博士、博士后

2.研究方向：

皮肤免疫学原理与慢性炎症性疾病

3.原创性科研成果：

3.1 角质形成细胞来源的自身核酸与代谢物复合体激活树突状细胞、介导慢性皮肤炎症。

3.2 “长链非编码RNA”编码具有免疫调节功能的微肽。

3.3 成功构建人源化的银屑病动物模型。

3.4 完成银屑病/白癜风的1.1类候选新药临床前研究。

4.近5年代表性文章：

1)Lou F#, Xu Z#, Bai J#, Zhao X, Cui L, Li Q*, Wang H*. Identification and pre-clinical investigation of CKBA as a drug for external use to treat psoriasis. Br J Pharmacol. 2023 Sep 25. doi: 10.1111/bph.16253. Epub ahead of print. PMID:37749894.

2)Lou F#, Sun Y#, Xu Z, Niu L, Wang Z, Deng S, Liu Z, Zhou H, Bai J, Yin Q, CaiX, Sun L, Wang H, Li Q, Wu Z, Chen X, Gu J, Shi YL, Tao W, Ginhoux F*, Wang H*. Excessive Polyamine Generation in Keratinocytes Promotes Self-RNA Sensing by Dendritic Cells in Psoriasis. Immunity. 2020 Jul 14;53(1):204-216.e10. doi:10.1016/j.immuni.2020.06.004. PMID: 32553276.

3)Lou F*, Sun Y, Wang H*. Protocol for Flow Cytometric Detection of Immune Cell Infiltration in the Epidermis and Dermis of a Psoriasis Mouse Model. STAR Protoc. 2020 Sep 17;1(3):100115. doi: 10.1016/j.xpro.2020.100115. PMID: 33377011.

4)Niu L#, Lou F#, Sun Y#, Sun L, Cai X, Liu Z, Zhou H, Wang H, Wang Z, Bai J, YinQ, Zhang J, Chen L, Peng D, Xu Z, Gao Y, Tang S, Fan L, Wang H*. A micropeptide encoded by lncRNA MIR155HG suppresses autoimmune inflammation via modulatingantigen presentation. Sci Adv. 2020 May 20;6(21):eaaz2059. doi:10.1126/sciadv.aaz2059. PMID: 32671205.

5.承担课题：

6.授权专利：

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十七、

袁苗苗课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

袁苗苗 PhD

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、青年PI

2.研究方向：

基于微针等微纳器件及纳米材料研发疾病诊疗新策略

3.原创性科研成果：

在自供能生物传感系统、可穿戴微针生物传感器、诊疗一体化等方面取得了创新性成果。代表工作包括（1）为了解决场效应晶体管生物传感器无法实时在线监测的问题，我们开发了一种基于微针阵列的扩展栅极场效应晶体管生物传感平台，实现了人体在线健康监测，该平台可用于葡萄糖、钠离子等的实时动态监测；（2）同时，为解决学术界难题“如何为生物传感器提供与之相匹配的电源”，我们提出了使用生物相容性的纳米发电机，并完成了自供能生物传感器在体内的实时检测。（3）为实现疾病的诊疗一体化，我们不仅构建了多种新型的多功能纳米材料用于成像介导的疾病诊疗，此外还将生物传感器和自修复材料相结合实现了伤口创面的实时监测与治疗等。目前，以第一作者或通讯作者（包含共同）发表SCI论文29篇，以第一发明人申请专利7项，其中已授权专利4项。主持国家自然科学基金2项。除此之外，担任2022中国最具国际影响力学术期刊 Chinese Chemical Letters的青年编委，担任国际期刊sensors和Frontiers in Bioengineering and Biotechnology等期刊的客座编辑。并担任Advanced Science、Advanced Functional Materials等学术期刊的审稿人。

4.代表性文章：

1)Luoyijun Xie#, Li Wang#, Ling Li#, Chutong Liu, Lihao Guo, Yingying Liao, Shuyi Zhou, Weiwei Wu, Yanhong Duo,* Leilei Shi,* and Miaomiao Yuan*. Novel Carrier-Free Nanodrug Enhances Photodynamic Effects by Blocking the Autophagy Pathway and Synergistically Triggers Immunogenic Cell Death for the Efficient Treatment of Breast Cancer, ACS Applied Materials & Interfaces. 2024, https://doi.org/10.1021/acsami.3c17977.

2)Jinmei Liu#, Saixuan Li#, Shuyi Zhou#, Zijun Chen, Jiongyao Xu, Nuanyang Cui, Miaomiao Yuan*, Bo Li *, Long Gu *. A high-performance, biocompatible, and fully biodegradable piezo-triboelectric hybrid nanogenerator based on PVA/Glycine/PVA heterostructured piezoelectric film. Nano Energy 2024, 122, 109310.

3)Shuxiang Xu #, Shuyi Zhou #, Luoyijun Xie #, Wenlong Dou , Rongjun Zhang, Bingxia Zhao, Yang Xu*, Xuemei Fu*, Miaomiao Yuan *. A versatile NiS₂/FeS₂ hybrid nanocrystal for synergistic cancer therapy by inducing ferroptosis and pyroptosis. Chemical Engineering Journal, 2023,460: 141639.

4)Miaomiao Yuan#, Tong Chen#, Lu Jin#, Peng Zhang*, Luoyijun Xie, Shuyi Zhou, Lianfeng Fan, Li Wang, Cai Zhang, Ning Tang, LiHao Guo, Chengmei Xie, Yanhong Duo, Ling Li* and Leilei Shi* A carrier-free supramolecular nano-twin drug for overcoming irinotecan-resistance and enhancing efficacy against colorectal cancer. Journal of Nanobiotechnology 2023, 21:393.

5)Lianfeng Fan#, Chuanjiang Jian#, Ling Li#, Li Wang, Xuejiao Song, Minjia Wang, Chutong Liu,Xiaoxiao Liu, Shidang Xu, Xihui Gao,* Xianjie Shi, Miaomiao Yuan,* Bin Liu,*and Leilei Shi*.A Bioactive Photosensitizer for Hypoxia-Tolerant Molecular Targeting-Photo-Immunotherapy of Malignant Tumor. Advanced Functional Materials 2023, 2313755.

6)Rongjun Zhang#, Youbin Zheng#, Tianqing Liu#, Ning Tang#, Lianzhi Mao, Lihan Lin, Jiahui Ye, Luoyijun Xie, Wenwen Hu, Weiwei Wu*, Wenzhen Liao*, Miaomiao Yuan*. The marriage of sealant agent between structure transformable silk fibroin and traditional Chinese medicine for faster skin repair, Chinese Chemical Letters, 2022, 33,3, 1599-1603.

7)Youbin Zheng#, Rawan Omar#, Rongjun Zhang#, Ning Tang, Muhammad Khatib, Qi Xu, Yana Milyutin, Walaa Saliba, Yoav Y Broza, Weiwei Wu, Miaomiao Yuan*, and Hossam Haick*.Wearable Microneedle-Based Extended Gate Transistor for Real-Time Detection of Sodium in Interstitial Fluids. Advanced Materials 2022, 2108607.

8)Ning Tang#, Rongjun Zhang#, Youbin Zheng, Jing Wang, Muhammad Khatib, Xue Jiang, Cheng Zhou, Rawan Omar, Walaa Saliba, Weiwei Wu, Miaomiao Yuan,* Daxiang Cui,*and Hossam Haick*.Highly Efficient Self-Healing Multifunctional Dressing with Antibacterial Activity for Sutureless Wound Closure and Infected Wound Monitoring. Advanced Materials 2022, 2106842.

9)Miaomiao Yuan#, Xiaoying Li#, Jingfeng Liu#, Youbin Zheng,* Li Cheng, Ning Tang, Rongjun Zhang, Shuxiang Xu, Xuemei Fu, Hossam Haick,* and Yang Xu*.Fully Integrated Self-Powered Electrical Stimulation Cell Culture Dish for Noncontact High-Efficiency Plasmid Transfection. ACS Applied Materials & Interfaces. 2021 13 (46), 54762-54769.

10)Miaomiao Yuan #,*, Shuxiang Xu, Qianbing Zhang#, Bingxia Zhao, Bingbing Feng, Kaiyuan Ji, Lili Yu, Wancheng Chen, Meirong Hou, Yang Xu*, Xuemei Fu*. Bicompatible porous Co3O4 nanoplates with intrinsic tumor metastasis inhibition for multimodal imaging and DNA damage–mediated tumor synergetic photothermal/photodynamic therapy. Chemical Engineering Journal, 2020.394:124874.

11)YuanMiaoMiao#, Cheng Li,Xu Qi,Wu Weiwei, Bai Suo, Gu Long, Wang Zhe,Lu Jun Li Huanping,Qin Yong*，Jing Tao*,Wang ZhongLin. Biocompatible nanogenerators through high piezoelectric coefficient 0.5Ba(Zr0.2Ti0.8)O3-0.5(Ba0.7Ca0.3)TiO3 nanowires for in-vivo applications. Advanced Materials, 2014.26(44):7432~7437.

5.承担的课题：

自组建团队以来，获得国家自然科学基金面上项目等多项资助。

6.授权专利：

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十八、

范广建课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

范广建 PhD

上海交通大学医学院副研究员、硕士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、青年PI

山东省泰山学者(青年专家)

上海市启明星人才计划

上海市卫健委优秀医学人才计划

上海医学科技奖青年奖

中国生物化学与分子生物学会生物技术专业委员会委员

北京生理科学会再生医学专业委员会委员

2.研究方向：

肿瘤分子生物学、肿瘤异质性、蛋白质翻译后修饰、中心体调控

3.原创性科研成果：

范广建研究员，2015年于华东师范大学获得理学博士，目前在上海交通大学附属第一人民医院，任职青年PI。主持多项国自然项目，获得上海市启明星人才、卫健委优秀医学青年人才等称号。已在Science Translational Medicine、Cell Research、Nature Communications (4篇)、Current biology、Cellular & Molecular Immunology和Oncogene (2篇)等经典杂志发表SCI论文数十篇。长期以来一直围绕肿瘤的发生发展、耐药和复发进行研究，取得多项创新性的研究成果: 鉴定乳腺癌中CAFs新亚型，并针对该亚型制备了相关抗体和抑制剂，联合使用促进乳腺癌尤其是三阴性乳腺癌的治疗；绘制肿瘤非组蛋白乳酰化图谱，发现数千个非组蛋白乳酰化位点，并进一步揭示乳酰化蛋白在肿瘤异质性和铜死亡中的关键作用；深入探讨中心体调控与肿瘤进展的关系，发现中心体过度复制可直接导致肿瘤发生，揭示DNA损伤诱导多余中心体凝集从而使肿瘤细胞成为恶化的“种子细胞”，导致肿瘤复发。

4.近年来代表性文章：

1)Chen J, Zhao D, Fan G*. Lactylation-induced Apolipo promotes Immunotherapy Resistance by Releasing Extracellular FFAs. Advanced Science, 2024.07, 最后通讯, IF：14.3

2)Fan G^#, Yu B^#, Tang L^#, Zhu R^#, Chen J, Zhu Y, Huang H, Zhou L, Liu J, Wang W, Tao Z, Zhang F, Yu S, Lu X, Cao Y, Du S, Li H, Li J, Zhang J, Ren H, Gires O, Liu H, Wang X, Qin J, Wang H*. TSPAN8⁺ myofibroblastic cancer-associated fibroblasts promote chemoresistance in patients with breast cancer. Science Translational Medicine. 16, eadj5705 (2024), 第一作者, IF：19.3

3)Sun L^#, Zhang Y^#, Yang B^#, Sun S#, Zhang P, Luo Z, Feng T, Cui Z, Zhu T, Li Y, Qiu Z, Fan G*, Chen Huang*. Lactylation of METTL16 promotes cuproptosis via m6A-modification on FDX1 mRNA in gastric cancer. Nature Communications. (2023) 14:6523, 共通讯作者，IF：17.39

4)Fan G^#, Sun L^#, Meng L^#, Hu C, Wang X, Shi Z, Hu C, Yang Q, Cao L, Zhang X, Song X, Xia S, He B, Zhang S, Zhang S*, Wang C*. The ATM and ATR kinases regulate centrosome clustering and tumor recurrence by targeting KIFC1 phosphorylation. Nature Communications. (2021) 12:20. 第一作者，IF: 17.394.

5)Fan G^#, Sun L^#, Shan P^#, Zhang X, Huan J, Zhang X, Li D, Wang T, Wei T, Zhang X, Gu X, Yao L, Xuan Y, Hou Z, Cui Y, Cao L, Li X, Zhang S*, Wang C*. Loss of KLF14 triggers centrosome amplification and tumorigenesis. Nature Communications. 2015. 6: p. 8450. 第一作者，IF: 12.121.

6)Li J^#, Chen X, Zhu L, Lao Z, Zhou T, Zang L, Ge W, Jiang M, Xu J, Cao Y, Du S, Yu Y, Fan G*, Wang H*. SOX9 is a critical regulator of TSPAN8-mediated metastasis in pancreatic cancer. Oncogene (2021) 40:4884–4893. 共通讯作者. IF: 9.867.

7)Chen J^#, Zhuang G^#, Xiao C, Wang X, Yan D, Wang Y, Song G, Liu X, Chen J, Lu H, Chen C, Guo W, Tang H, Fan G*, Peng Z*. Loss of SHMT2 mediates 5-FU chemoresistance by inducing autophagy in colorectal cancer. Oncogene, 2021. 40(23): p. 3974-3988. 共同通讯作者. IF: 9.867.

8)Lu X^#, An L^#, Fan G^#, Zang L, Li J, Liu J, Ge W, Huang Y, Xv J, Du S, Cao Y, Zhou T, Yin H, Yu L, Jiao S, Wang H*. EGFR Signaling Triggers Nuclear Translocation of Plasma Membrane Protein TSPAN8 to Promote Tumor Progression via STAT3-mediated Transcription. Cell research (2022), 32(4):359-374. 共同第一作者, IF: 47.6.

9)Yuan Y^#, Fan G^#, Liu Y^#, Liu L, Zhang T, Liu P, Tu Q, Zhang X, Luo S, Yao L*, Chen F*, Li J*. The transcription factor KLF14 regulates macrophage glycolysis and immune function by inhibiting HK2 in sepsis. Cellular & Molecular Immunology, 2022 Apr;19(4):504-515. 共同第一作者，IF: 22.3.

10)Chen L^#, Sha M^#, Chen F, Jiang C, Li D, Xu C, Pan D, Xu Z, Tang Q, Xia S, Sun L*, Fan G*, Shao Y*. Upregulation of KLF14 expression attenuates kidney fibrosis by inducing PPARalpha-mediated fatty acid oxidation. Free Radic Biol Med. 2023; 195:132-44. Co-corresponding author，共通讯作者，IF: 8.01.

11)Sun L^#, Fan G^#, Shan P^#, Qiu X, Dong S, Liao L, Yu C, Wang T, Gu X, Li Q, Song X, Cao L, Li X, Cui Y, Zhang S*, Wang C*. Regulation of energy homeostasis by the ubiquitin-independent REGγ proteasome. Nature Communications, 2016 Aug 11; 7:12497 共一作者，IF: 12.12.

12)Shan P^#, Fan G^#, Sun L^#, Liu J, Wang W, Hu C, Zhang X, Zhai Q, Song X, Cao L, Cui Y, Zhang S* and Wang C*. SirT1 functions as a master regulator of poly (A) RNA transport under stress conditions.Current biology. 2017. 27(15): p. 2271-2284 e5. 共一，IF: 9.251.

5.承担的课题：

团队自2021年组建以来，获得国家自然科学基金面上项目2项、青年项目1项，以及上海市多项人才项目的资助。总经费约520万元。

1. 国家自然基金,面上项目：32270749, 载脂蛋白APOC2乳酰化修饰调控及其促进肿瘤转移的机制研究。2023.01-2026.12， 53万，在研，主持。

2.国家自然基金, 面上项目：31970720, DNA损伤诱导的KIFC1磷酸化介导肿瘤耐药和复发的机制及策略研究。2020.01-2023.12，58万，在研，主持。

3.上海市启明星人才计划：19QA1407100，Centrosome Clustering促进多类型肿瘤耐药和复发的机制及其对应策略研究。2019.06-2022.05，40万，已结题，主持。

4. 山东省泰山学者工程（青年专家计划）：非组蛋白乳酰化调控肿瘤进展、耐药和复发的机制及其干预策略研究。2023.01-2025.12，200万，在研，主持。

5. 上海市第一人民医院启动经费：载脂蛋白APOCs的蛋白翻译后修饰调控及其促进肿瘤进展的机制研究。2021.01-2023.12，100万，在研，主持。

6. 国家自然基金,青年项目：81602616，肿瘤抑制因子KLF14参与细胞有丝分裂灾变促进肿瘤治疗的机制研究。2017.01-2019.12，19万，已结题，主持。

7. 上海市卫健委-优秀青年医学人才计划：2018YQ44，肿瘤抑制因子KLF14诱发有丝分裂灾变促进胰腺癌治疗的功能及其机制研究。2018.07-2021.06，30万，已结题，主持。

8. 上海市青年科技英才扬帆计划项目：16YF1409100，肿瘤发生过程中转录因子KLF14的功能及其调控研究。2016.06-2019.05，20万，已结题，主持。

6.授权专利：

1) 预测肿瘤耐药、复发的标志物KIFC1及其抑制剂和应用，专利号：202011110775.6。

2) 一种人源化降糖多肽、其制备方法和应用，专利号：2020113253653。

3) 一种来源于截短型人SirT2蛋白的融合蛋白、其制备方法及应用专利号：2020112783563。

4) 一种人源化降糖多肽及其应用，专利号：2020112257055。

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十九、

王当歌课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

王当歌 PhD

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、青年PI

上海市科技创新行动计划启明星（2023）

入选中国科协青年人才托举工程、中国科学院青年创新促进会

中国抗癌协会纳米肿瘤学专委会青年常委

中国科学院上海药物研究所博士

2.研究方向：

药物递送系统与肿瘤免疫治疗

3.原创性科研成果：

围绕肿瘤免疫治疗药物递送系统及其免疫调控机制开展研究。通过构建生理响应性递药系统，实现肿瘤抗原和免疫调节药物的靶向递送、组织深部渗透和生理响应性释放，为改善肿瘤免疫抑制微环境，提高免疫治疗的响应率和疗效提供新方法和新策略。1）脂质载药系统的理性化设计、构建与开发，包括：新免疫佐剂、新脂质材料合成，载药处方开发和制备工艺优化；2）脂质载体肿瘤疫苗的应用基础研究，包括：抗原发现与筛选，疫苗的制备与表征、体内转运行为研究和效应评价；3）载药系统调控免疫应答的机制研究，包括：与抗原呈递细胞、T细胞等免疫细胞互作的分子机制，基于新机制的联合治疗策略开发等。

4.近5年代表性文章：

1)Lei Zhou^#, Wenzhe Yi^#, Zehong Zhang^#, Xiaoting Shan, Zitong Zhao, Xiangshi Sun, Jue Wang, Hao Wang, Hualiang Jiang, Mingyue Zheng*, Dangge Wang*, Yaping Li*. STING agonist-boosted mRNA immunization via intelligent design of nanovaccines for enhancing cancer immunotherapy. National Science Review 2023, 10, nwad214.

2)Xiangshi Sun, Xiaoxuan Xu, Jue Wang, Xinyue Zhang, Zitong Zhao, Xiaochen Liu, Guanru Wang, Lesheng Teng, Xia Chen*, Dangge Wang*, Yaping Li*. Acid-switchable nanoparticles induce self-adaptive aggregation for enhancing antitumor immunity of natural killer cells. Acta Pharmaceutica Sinica B 2023, 13, 3093-3105.

3)Wenzhe Yi, Ping Xiao, Xiaochen Liu, Zitong Zhao, Xiangshi Sun, Jue Wang, Lei Zhou, Guanru Wang, Haiqiang Cao, Dangge Wang*, Yaping Li*. Recent advances in developing active targeting and multi-functional drug delivery system via bioorthogonal chemistry. Signal Transduction and Targeted Therapy 2022, 7, 386.

4)Xiaochen Liu, Zitong Zhao, Xiangshi Sun, Jue Wang, Wenzhe Yi, Dangge Wang*, Yaping Li*. Blocking cholesterol metabolism with tumor-penetrable nanovesicles to improve photodynamic cancer immunotherapy. Small Methods 2022, 7, 202200898.

5)Zitong Zhao, Lei Fang, Ping Xiao, Xiangshi Sun, Lei Zhou, Xiaochen Liu, Jue Wang, Guanru Wang, Haiqiang Cao, Pengcheng Zhang, Yanyan Jiang*, Dangge Wang*, Yaping Li*. Walking dead tumor cells for targeted drug delivery against lung metastasis of triple-negative breast cancer. Advanced Materials 2022, 34, 2205462.

6)Lei Zhou^#, Bing Feng^#, Hao Wang*, Dangge Wang*, Yaping Li*. A bispecific nanomodulator to potentiate photothermal cancer immunotherapy. Nano Today 2022, 44, 101466.

7)Lei Fang, Zitong Zhao, Jue Wang, Ping Xiao, Xiangshi Sun, Yaping Ding, Pengcheng Zhang, Dangge Wang*, Yaping Li*. Light-controllable charge-reversal nanoparticles with polyinosinic-polycytidylic acid for enhancing immunotherapy of triple negative breast cancer. Acta Pharmaceutica Sinica B 2022, 12, 353-363.

8)Ping Xiao, Jue Wang, Lei Fang, Zitong Zhao, Xiangshi Sun, Xiaochen Liu, Haiqiang Cao, Pengcheng Zhang, Dangge Wang*, Yaping Li*. Nanovaccine-mediated cell selective delivery of neoantigens potentiating adoptive dendritic cell transfer for personalized immunization. Advanced Functional Materials 2021, 31, 2104068.

9)Ping Xiao, Jue Wang, Zitong Zhao, Xiaochen Liu, Xiangshi Sun, Dangge Wang*, Yaping Li*. Engineering nanoscale artificial antigen-presenting cells by metabolic dendritic cell labeling to potentiate cancer immunotherapy. Nano Letters 2021, 21, 2094-2103.

10)Lei Fang^#, Zitong Zhao^#, Jue Wang, Pengcheng Zhang, Yaping Ding, Yanyan Jiang, Dangge Wang*, Yaping Li*. Engineering autologous tumor cell vaccine to locally mobilize antitumor immunity in tumor surgical bed. Science Advances 2020, 6, eaba4024.

11)Lei Zhou, Pengcheng Zhang, Hao Wang, Dangge Wang*, Yaping Li*. Smart nanosized drug delivery systems inducing immunogenic cell death for combination with cancer immunotherapy. Accounts of Chemical Research 2020, 53, 1761-1772.

12)Dangge Wang, Tingting Wang, Haijun Yu*, Bing Feng, Lei Zhou, Fangyuan Zhou, Bo Hou, Hanwu Zhang, Min Luo, Yaping Li*. Engineering nanoparticles to locally activate T cells in the tumor microenvironment. Science Immunology 2019, 4, eaau6584.

13)Tingting Wang^#, Dangge Wang^#, Haijun Yu*, Bing Feng, Fangyuan Zhou, Hanwu Zhang, Lei Zhou, Shi Jiao, Yaping Li*. A cancer vaccine-mediated postoperative immunotherapy for recurrent and metastatic tumors. Nature Communications 2018, 9, 1532.

5.承担的课题：

6.授权专利：

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二十、

岳智颖课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

岳智颖 PhD

上海交通大学医学院副研究员、硕士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、青年PI

上海市科技创新行动计划启明星（2023）

上海市卫生健康优秀青年人才

上海交通大学医学院博士后

华东师范大学博士

2.研究方向：

G蛋白偶联受体与肿瘤细胞代谢

3.原创性科研成果：

3.1 发现GPCR家族成员LGR4（GPR48）在肿瘤转移骨微环境的重要功能，揭示了RSPO2/RANKl-LGR4-Gαq信号促进破骨前体细胞招募形成转移前骨微环境的新机制及临床相关性，为靶向GPCR治疗骨转移开辟新方向；

3.2 解析GPCR依赖线粒体NAD⁺调控细胞代谢重编程在肿瘤药物抵抗的分子机制，该研究将丰富GPCR信号转导与肿瘤细胞代谢网络调控的新机制。

4.近5年代表性文章：

1）Yue Z#, Niu X#, Yuan Z, Qin Q, Jiang W, He L, Gao J, Ding Y, Liu Y, Xu Z, Li Z, Yang Z, Li R, Xue X, Gao Y, Yue F, Zhang XH, Hu G, Wang Y, Li Y, Chen G, Siwko S, Gartland A, Wang N, Xiao J, Liu M, Luo J*. RSPO2 and RANKL signal through LGR4 to regulate osteoclastic premetastatic niche formation and bone metastasis. J Clin Invest. 2022 Jan 18;132(2):e144579.

2）Yue Z#, Yuan Z#, Zeng L#, Wang Y, Lai L, Li J, Sun P, Xue X, Qi J, Yang Z, Zheng Y, Fang Y, Li D, Siwko S, Li Y, Luo J*, Liu M*. LGR4 modulates breast cancer initiation, metastasis, and cancer stem cells. FASEB J. 2018 May;32(5):2422-2437.

3）Xu F#, Shangguan X#, Pan J#, Yue Z#, Shen K, Ji Y, Zhang W, Zhu Y, Sha J, Wang Y, Fan L, Dong B*, Wang Q*, Xue W*. HOXD13 suppresses prostate cancer metastasis and BMP4-induced epithelial-mesenchymal transition by inhibiting SMAD1. Int J Cancer. 2021 Jun 15;148(12):3060-3070.

4）Zhu M, He J, Xu Y, Zuo Y, Zhou W, Yue Z, Shao X, Cheng J, Wang T, Mou S. AMPK activation coupling SENP1-Sirt3 axis protects against acute kidney injury. Mol Ther. 2023 Oct 4;31(10):3052-3066.

5）Sun P, He L, Jia K, Yue Z, Li S, Jin Y, Li Z, Siwko S, Xue F, Su J, Liu M, Luo J. Regulation of body length and bone mass by Gpr126/Adgrg6. Sci Adv. 2020 Mar 20;6(12):eaaz0368.

6）Luo J, Yang Z, Ma Y, Yue Z, Lin H, Qu G, Huang J, Dai W, Li C, Zheng C, Xu L, Chen H, Wang J, Li D, Siwko S, Penninger JM, Ning G, Xiao J, Liu M. LGR4 is a receptor for RANKL and negatively regulates osteoclast differentiation and bone resorption. Nat Med. 2016 May;22(5):539-46.

5.承担的课题：

课题组获得医院科研启动经费、国自然基金面上项目、国自然基金青年项目、上海市启明星人才项目、上海市卫健委人才项目、上海市自然基金面上项目等多项资助。

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二十一、

李露课题组

联系方式：[email protected]

（本课题组同时招聘技术员，详情请联系课题组长）

1.简介:

李露 PhD

上海交通大学医学院附属第一人民医院 课题组长、青年PI

上海科技大学/华南理工大学附属第二医院博士后

中国科学院分子细胞科学卓越创新中心博士

2.研究方向：

肝脏疾病的神经调控机制

3.科研成果：

3.1 揭示了肝脏损伤下巨噬细胞的炎症信号通过损伤特异的转录调控模式诱导肝细胞去分化的机制，为探索诱导体内重编程的因子，开发治疗肝脏疾病相关药物，奠定了重要的理论基础。

3.2 聚焦“脑-肝”互作与调控机制，解析调控肝脏疾病进展的神经通路、信号分子、调控机制和干预策略。

4.代表性文章：

1)Li L*, Cui L*, Lin P*, Liu Z, Bao S, Ma X, Nan H, Zhu W, Cen J, Mao Y, Ma X, Jiang L, Nie Y, Ginhoux F, Li Y, Li H, and Hui L. Kupffer cell-derived IL-6 is repurposed for hepatocyte dedifferentiation via activating progenitor genes from injury-specific enhancers. Cell Stem Cell. 2023. (*co-first author)

2)Li L*, Li D*, Tian F, Cen J, Chen X, Ji Y, Hui L. Hepatic loss of Borealin impairs postnatal liver development, regeneration, and hepatocarcinogenesis. J Biol Chem. 2016. (*co-first author)

3)Yue L*, Li L*, Li D, Yang Z, Han S, Chen M, Lan S, Xu X, and Hui L. High-throughput screening for Survivin and Borealin interaction inhibitors in hepatocellular carcinoma. Biochem Biophys Res Commun. 2017. (*co-first author)

4)Li W, Li L, and Hui L. Cell plasticity in liver regeneration. Trends Cell Biol. 2020.

5)Li W, Yang L, He Q, Hu C, Zhu L, Ma X, Ma X, Bao S, Li L, Chen Y, Deng X, Zhang X, Cen J, Zhang L, Wang Z, Xie WF, Li H, Li Y, Hui L. A homeostatic Arid1a-dependent permissive chromatin state licenses hepatocyte responsiveness to liver-injury-associated YAP signaling. Cell Stem Cell. 2019.

6)Deng X, Zhang X, Li W, Feng R, Li L, Yi G, Zhang X, Yin C, Yu H, Zhang J, Lu B, Hui L, Xie W. Chronic liver injury induces conversion of biliary epithelial cells into hepatocytes. Cell Stem Cell. 2018.

7)Li D, Fu J, Du M, Zhang H, Li L, Cen J, Li W, Chen X, Lin Y, Conway E, Pikarsky E, Wang H, Pan G, Ji Y, Wang H, Hui L. Hepatocellular carcinoma repression by TNFα-mediated synergistic lethal effect of mitosis defect-induced senescence and cell death sensitization. Hepatology. 2016.

8)Zhang L, Shao Y, Li L, Tian F, Cen J, Chen X, Hu D, Zhou Y, Xie W, Zheng Y, Ji Y, Liu M, Li D, Hui L. Efficient liver repopulation of transplanted hepatocyte prevents cirrhosis in a rat model of hereditary tyrosinemia type I. Sci Rep. 2016.

5.承担的课题：

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二十二、

李文文课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

李文文 PhD

上海交通大学医学院副研究员、硕士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、青年PI

上海市卫健委优秀青年人才

复旦大学 博士

2.研究方向：

T细胞分化与肿瘤免疫；放疗免疫

3.原创性科研成果：

3.1 发现STING通路对肿瘤浸润T细胞干性的调节机制，为提高T细胞治疗效果提供新策略；

3.2发现肿瘤细胞机械力感应门控离子通道对放疗诱导的抗肿瘤免疫应答的调节机制

4.近5年代表性文章：

1)Lingling Wu^#, Xiaochuan Hong^#, Chao Yang, Yuanqin Yang, Wenwen Li, Lu Lu, Meichun Cai, Dongqing Cao, Guanglei Zhuang, Liufu Deng^*. Noncanonical MAVS signaling restrains dendritic cell-driven antitumor immunity by inhibiting IL-12. Science immunology. 2023, Dec 1, 8: eadf4919 (2023).

2)Lu Lu^#, Yang Cao^#, Zhou Xingyue, Wu Lingling, Hong Xiaochuan, Li Wenwen, Wang Xinran, Yang Yuanqin, Cao Dongqing, Zhang Ao, Di Wen, and Deng Liufu^*. STING signaling promotes NK cell antitumor immunity and maintains a reservoir of TCF-1+ NK cells. Cell Reports. 2023 Sep 26;42(9):113108.

3)Yang C^#, Jin J^#, Yang Y, Sun H, Wu L, Shen M, Hong X, Li Wenwen, Lu L, Cao D, Wang X, Sun J, Ye Y, Su B, Deng L^*. Androgen receptor-mediated CD8+ T cell stemness programs drive sex differences in antitumor immunity. Immunity. 2022 Jul 12;55(7):1268-1283.e9.

4)Yang Y^#, Wu M^#, Cao D^#, Yang C, Jin J, Wu L, Hong X, Li Wenwen, Lu L, Li J, Wang X, Meng X, Zhang Z, Cheng J, Ye Y, Xiao H, Yu J^*, Deng L^*. ZBP1-MLKL necroptotic signaling potentiates radiation-induced antitumor immunity via intratumoral STING pathway activation. Science Advances. 2021 Oct 8;7(41):eabf6290.

5)Li, Wenwen^#; Lu, Lu^#; Lu, Juanjuan; Wang, Xinran; Yang, Chao; Jin, Jingsi; Wu, Lingling; Hong, Xiaochuan; Li, Fanlin; Cao, Dongqing; Yang, Yuanqin; Wu, Meng; Su, Bing; Cheng, Jinke; Yang, Xuanming^*; Di, Wen^*; Deng, Liufu^*; cGAS-STING mediated DNA sensing maintains CD8(+) T cell stemness and promotes antitumor T cell therapy., Science Translational Medicine, 2020, 12(549): eaay9013.

6)Yong Huang, Ke Ning, Wen-Wen Li, et al. Hydrogen sulfide accumulates LDL receptor precursor via downregulating PCSK9 in HepG2 cells. American Journal of Physiology-Cell Physiology. 2020, 319(6):C1082-C1096.

7)Zhou, Yu^#; Li, Xing-Hui^#; Zhang, Cai-Cai^#; Wang, Ming-Jie; Xue, Wen-Long; Wu, Dong-Dong; Ma, Fen-Fen; Li, Wen-Wen; Tao, Bei-Bei; Zhu, Yi-Chun^*; Hydrogen sulfide promotes angiogenesis by downregulating miR-640 via the VEGFR2/mTOR pathway, American Journal of Physiology - Cell Physiology, 2016, 310(4): 305-317.

8)Xue, Rong^#; Hao, Dan-Dan^#; Sun, Ji-Ping^#; Li, Wen-Wen; Zhao, Man-Man; Li, Xing-Hui; Chen, Ying; Zhu, Jian-Hua; Ding, Ying-Jiong; Liu, Jun; Zhu, Yi-Chun^*; Hydrogen Sulfide Treatment Promotes Glucose Uptake by Increasing Insulin Receptor Sensitivity and Ameliorates Kidney Lesions in Type 2 Diabetes, Antioxidants and Redox Signaling, 2013, 19(1): 5-23.

5.承担的课题：

课题组获得国自然基金面上项目、国自然基金青年项目、上海市卫健委人才项目等多项资助。

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二十三、

张嘉农课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

张嘉农 PhD

上海交通大学医学院副研究员、硕士生导师

上海交通大学医学院附属第一人民医院课题组长、青年PI

上海市领军人才

2.研究方向：

前列腺癌分子生物学、基因转录调控、RNA甲基化修饰

3.原创性科研成果：

3.1 发现SPOP突变前列腺癌导致DNA高甲基化的新机制并揭示SPOP突变前列腺癌对甲基化依赖的生成特征，提出用甲基化抑制剂治疗SPOP突变前列腺癌的全新思路；

3.2 发现RNA甲基化在前列腺癌进展过程中的调控作用，并鉴定到非编码RNA FTO-IT1在调节RNA甲基化过程中的全新功能。该工作为晚期前列腺癌的治疗提供新的靶点。

4.近5年代表性文章：

1)Zhang J, Wei J, Sun R, Sheng H, Yin K, Pan Y, Jimenez R, Chen S, Cui XL, Zou Z, Yue Z, Emch MJ, Hawse JR, Wang L, He HH, Xia S, Han B, He C, Huang H. A lncRNA from the FTO locus acts as a suppressor of the m6A writer complex and p53 tumor suppression signaling. Mol Cell. 2023 Aug 3;83(15):2692-2708.e7

2)Jianong Zhang; Kun Gao; Hongyan Xie; Dejie Wang; Pingzhao Zhang; Ting Wei; Yuqian Yan; Yunqian Pan; Wenbin Ye; Huifen Chen; Qing Shi; Yao Li; Shi-min Zhao; Xiaonan Hou; Saravut J. Weroha; Yuzhuo Wang; Jun Zhang; R. Jeffrey Karnes; Housheng Hansen He; Liguo Wang; Chenji Wang; Haojie Huang ; SPOP mutation induces DNA methylation via stabilizing GLP/G9a, Nature Communications, 2021, 12(1): 5716

3)Jianong Zhang; Liang Zhang; Ji Nie; Yan Lin; Yao Li; Wei Xu; Jian-Yuan Zhao; Shimin Zhao;Chenji Wang ; Calcineurin inactivation inhibits pyruvate dehydrogenase complex activity and induces the Warburg effect, Oncogene, 2021, 40(49): 6692-6702

4)Liang Zhang; Jianong Zhang; Yan Liu; Pingzhao Zhang; Ji Nie; Rui Zhao; Qin Shi; Huiru Sun; Dongyue Jiao; Y Chen; Xiaying Zhao; Yan Huang; Yao Li; Jian-Yuan Zhao; Wei Xu; Shimin Zhao; Chenji Wang ; Mitochondrial STAT5A promotes metabolic remodeling and the Warburg effect by inactivating the pyruvate dehydrogenase complex, Cell Death and Disease, 2021, 12(7): 634

5)Ding D, Blee AM, Zhang J, Pan Y, Becker NA, Maher LJ 3rd, Jimenez R, Wang L, Huang H. Gain-of-function mutant p53 together with ERG proto-oncogene drive prostate cancer by beta-catenin activation and pyrimidine synthesis. Nat Commun. 2023 Aug 3;14(1):4671

6)Xia-Di He; Wei Gong; Jia-Nong Zhang; Ji Nie; Cui-Fang Yao; Fu-Shen Guo; Yan Lin; Xiao-Hui Wu; Feng Li; Jie Li; Wei-Cheng Sun; En-Duo Wang; Yan-Peng An; Hui-Ru Tang; Guo-Quan Yan; Peng-Yuan Yang; Yun Wei; Yun-Zi Mao; Peng-Cheng Lin; Jian-Yuan Zhao; Yanhui Xu; Wei Xu; Shi-Min Zhao; Sensing and Transmitting Intracellular Amino Acid Signals through Reversible Lysine Aminoacylations, Cell Metabolism, 2018, 27(1): 151-166

7)Rui Sun; Ting Wei; Donglin Ding; Jianong Zhang; Sujun Chen; Housheng Hansen He; Liguo Wang; Haojie Huang ; CYCLIN K down-regulation induces androgen receptor gene intronic polyadenylation, variant expression and PARP inhibitor vulnerability in castration-resistant prostate cancer, Proceedings of the National Academy of Sciences, 2022, 119(39): e2205509119

5.承担的课题：

获得2024年国家自然科学基金青年项目

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二十四、

王长平课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

王长平 PhD

上海交通大学医学院 副研究员

上海市第一人民医院骨科临床医学中心青年PI

2.研究方向：

新型刺激响应纳米药物的构建及应用；

智能水凝胶药物递送系统的构建及应用；

生物大分子药物递送载体的设计构造；

3.原创性科研成果：

长期致力于新型生物材料的设计构造及其生物医学应用的研究。设计开发了多种刺激响应纳米药物、智能水凝胶药物递送系统、生物大分子药物递送载体等在内的多种智能药物递送平台，应用于肿瘤治疗及抗菌领域当中，大大提高了生物活性药物的安全性以及有效性。

4.近5年代表性文章：

1)Yang Lei †; Wang Changping †; Li Lin; Zhu Fang; Ren Xiancheng; Huang Quan; Cheng Yiyun *; Li Yiwen *, Bioinspired Integration of Natural Occurring Molecules towards Universal and Smart Antibacterial Coatings. Adv. Funct. Mater. 2021, 2108749.

2)Wang Changping†; Li Lin†; Zhang Song; Yan Yang; Huang Quan; Cai Xiaopan; Xiao Jianru*; Cheng Yiyun*, Carrier-Free Platinum Nanomedicine for Targeted Cancer Therapy. Small 2020, 16, e2004829.

3)Rong Guangyu†; Wang Changping†; Chen Lijie; Yan Yang; Cheng Yiyun*, Fluoroalkylation promotes cytosolic peptide delivery. Sci. Adv. 2020, 6, eaaz1774.

4)Wang Changping†; Liu Chongyi†; Wei Qiyao; Yang Lei; Yang Peng; Li Yiwen*; Cheng Yiyun*, S,S-Tetrazine-Based Hydrogels with Visible Light Cleavable Properties for On-Demand Anticancer Drug Delivery. Research 2020, 2020, 6563091.

5)Wang Changping†; Sang Huajun†; Wang Yitong; Zhu Fang; Hu Xinhao; Wang Xinyu; Wang Xing; Li Yiwen*; Cheng Yiyun*, Foe to Friend: Supramolecular Nanomedicines Consisting of Natural Polyphenols and Bortezomib. Nano Lett. 2018, 18, 7045-7051.

6)Wang Changping†; Wang Dong†; Dai Tianjiao; Xu Peng; Wu Peilun; Zou Yuan; Yang Peng; Hu Jingjing; Li Yiwen*; Cheng Yiyun*, Skin Pigmentation-Inspired Polydopamine Sunscreens. Adv. Funct. Mater. 2018, 28.

7)Wang Changping†; Zhang Qiang†; Wang Xinyu; Chang Hong; Zhang Sanjun; Tang Yuankai; Xu Jianhua; Qi Ruijuan; Cheng Yiyun*, Dynamic Modulation of Enzyme Activity by Near-Infrared Light. Angew. Chem. Int. Ed. 2017, 56, 6767-6772.

8)Wang Xing†; Wang Changping†; Wang Xinyu; Wang Yitong; Zhang Qiang*; Cheng Yiyun*, A Polydopamine Nanoparticle-Knotted Poly(ethylene glycol) Hydrogel for On-Demand Drug Delivery and Chemo-photothermal Therapy. Chem. Mater. 2017, 29, 1370-1376.

5.承担的课题：

6.授权专利：

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二十五、

陈雪课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

陈雪 PhD

上海交通大学医学院附属第一人民医院 课题组长、青年PI

上海交通大学医学院硕博、博士后

2.研究方向：

血小板在肿瘤、炎症、心脑血管及自身免疫等疾病中的调控作用与机制研究

3.原创性科研成果：

发现血小板调控Tfh细胞分化及自身免疫性疾病，血小板缺失PTEN导致小鼠免疫稳态失衡，过度活化血小板介导的Tfh细胞活性增强可能是人类自身免疫疾病的hallmark。
发现血小板调控血栓形成与心脑血管疾病（CVD）的新机制，揭示PDK1/AKT等信号通路调控血小板活化与CVD，为CVD的治疗提供新的药物靶点。
发现血小板调控炎症性关节炎的发展，阐明血小板在类风湿关节炎中的调控作用与潜在的药物靶点探索。

4.代表性论著：

1. Xue Chen*, Yanyan Xu, Qidi Chen, Heng Zhang, Yu Zeng, Yan Geng,Lei Shen, Fubin Li, Lei Chen, Guo-Qiang Chen, Chuanxin Huang*, Junling Liu*. The phosphatase PTEN links platelets with immune regulatory functions of T follicular helper cells. Nature Communications. 2022 (13): 2762.

2. Xue Chen, Yue Zhang, Yanhua Wang, Ding Li, Lin Zhang, Kemin Wang, Xinping Luo, Zhongzhou Yang, Yi Wu and Junling Liu *. PDK1 regulates platelet activation and arterial thrombosis. Blood. 2013. 121(18): 3718-26.

3. Xue Chen*. Rac1 Regulates Platelet Microparticles Formation and Rheumatoid Arthritis Deterioration. Platelets. 2020. 31 (1): 112-119.

4. Wen Gao, Kemin Wang, Lin Zhang, Jian Li, Junling Liu, Xue Chen* & Xinping Luo*. Pharmacological inhibition of S6K1 facilitates platelet activation by enhancing Akt phosphorylation. Platelets. 2019. 30 (2): 241-250.

5. Huihui Gao, Ying Zhou, Xue Chen*. Tregs and Platelets Play Synergistic Roles in Tumor Immune Escape and Inflammatory Diseases. Crit Rev Immunol. 2022. 42(2): 59-69.

5.承担课题：

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二十六、

黄鑫课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

黄鑫 PhD

上海交通大学医学院附属第一人民医院 课题组长、青年PI

美国St. Jude Children’s Research Hospital，Garwood Fellowship博士后

中国科学院上海生命科学研究院，博士

2.研究方向：

发育和发育异常导致的疾病如白血病、儿童实体瘤等

3.原创性科研成果：

3.1 通过基于发育和多组学的系统生物学方法，利用生物物理，细胞与分子生物学等‘干湿’结合的手段，发现并从机制上验证多种肿瘤的新靶点和克服药物抗性的联合用药策略，推动了多个国内外临床转化试验。（Cancer Cell, 2024; Developmental Cell, 2022）

3.2 进行了肿瘤特异性PROTAC研究，使其仅靶向肿瘤细胞而不影响正常组织。(Nature Communications, 2020)

4.近5年代表性文章：

1.Huang, X. *, Li Y*, Zhang J*, Yan L, Zhao H, Ding L, Bhatara S, Yang X, Yoshimura S, Yang W, Karol SE, Inaba H, Mullighan C, Litzow M, Zhu X, Zhang Y, Stock W, Jain N, Jabbour E, Kornblau SM, Konopleva M, Pui CH, Paietta E, Evans W, Yu J, Yang JJ. Single-cell systems pharmacology identifies development-driven drug response and combination therapy in B cell acute lymphoblastic leukemia. Cancer Cell 42(4):552-567.e6 (2024).

https://doi.org/10.1016/j.ccell.2024.03.003

2.Patel, A. G. *, Chen, X. *, Huang, X. *, Clay, M. R., Komorova, N., Krasin, M. J., Pappo, A., Tillman, H., Orr, B. A., McEvoy, J., Gordon, B., Blankenship, K., Reilly, C., Zhou, X., Norrie, J. L., Karlstrom, A., Yu, J., Wodarz, D., Stewart, E. & Dyer, M. A. The myogenesis program drives clonal selection and drug resistance in rhabdomyosarcoma. Dev Cell 57, 1226-1240 e1228 (2022). https://doi.org:10.1016/j.devcel.2022.04.003

3.Yang, S. W. *, Huang, X. *, Lin, W., Min, J., Miller, D. J., Mayasundari, A., Rodrigues, P., Griffith, E. C., Gee, C. T., Li, L., Li, W., Lee, R. E., Rankovic, Z., Chen, T. & Potts, P. R. Structural basis for substrate recognition and chemical inhibition of oncogenic MAGE ubiquitin ligases. Nat Commun 11, 4931 (2020). https://doi.org:10.1038/s41467-020-18708-x

4.Huang, X., Zheng, Y., Zhang, F., Wei, Z., Wang, Y., Carrell, R. W., Read, R. J., Chen, G. Q. & Zhou, A. Molecular Mechanism of Z alpha1-Antitrypsin Deficiency. J Biol Chem 291, 15674-15686 (2016). https://doi.org:10.1074/jbc.M116.727826

4.承担的课题：

团队2024年8月组建

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二十七、

何金男课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

何金男 PhD

上海交通大学医学院附属第一人民医院 课题组长、青年PI

清华大学博士

2.研究方向：

相分离在转录调控、表观遗传等领域的生物学意义，转录调控异常与疾病

3.原创性科研成果：

3.1 通过新开发的，可以在全基因组范围内精确定位和识别转录凝聚体的测序技术ACC-seq，在小鼠胚胎干细胞系（mESC）中鉴定出一类具有相分离能力的，具有双向转录调控作用的新型转录因子，名为dual-action TFs。并详细阐述dual-action TFs 是如何实现双向转录调控和维持基因表达稳定的机制（Cell，2024）。

4.近5年代表性文章：

Jinnan He#, Xiangru Huo#, Gaofeng Pei#, Zeran Jia#, Yiming Yan, Jiawei Yu, Haozhi Qu, Yunxin Xie, Junsong Yuan, Yuan Zheng, Yanyan Hu, Minglei Shi, Kaiqiang You, Tingting Li, Tianhua Ma, Michael Q. Zhang, Sheng Ding, Pilong Li*, Yinqing Li *. (2024). Dual-role transcription factors stabilize intermediate expression levels. Cell. 187, 1–21.

5.承担的课题：

团队2024年8月刚刚组建，目前有多个正在申报的项目。

6.授权专利：

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二十八、

马铎课题组

联系方式：[email protected]

1.简介:

马铎 PhD

上海交通大学医学院附属第一人民医院 课题组长、青年PI

美国加州理工学院博士后

美国亚利桑那州立大学博士

2. 研究方向：

RNA开关调控mRNA表达；核酸检测试纸开发；基因编辑时空操控；细胞核酸时空成像；mRNA肿瘤疫苗设计；mRNA序列优化算法开发

3. 原创性科研成果：

3.1 开创了首个无序列限制的RNA开关设计，为响应细胞内源信号的RNA基因电路的开发提供了新的方法；

3.2 设计了首个智能化体外便携式核酸检测试纸，可实现任意病毒核酸的精准检测；

3.3 开发了全新的mRNA序列优化算法，所优化的mRNA序列蛋白表达量达业界领先水平

4.近5年代表性文章：

(1) Ma, D., Li, Y., Wu, K., Yan, Z., Tang, A., Chaudhary, S., Ticktin, Z., Alcantar-Fenandez, J., Moreno-Camacho, J., Campos-Romero, A., Green, A. A. (2022). Multi-arm RNA junctions encoding molecular logic unconstrained by input sequence for versatile cell-free diagnostics. Nature Biomedical Engineering, 6, 298-309. 影响因子31.072

(2) Ma, D., Shen, L., Wu, K., Diehnelt, C. W., Green, A. A. (2018). Low-cost detection of norovirus using paper-based cell-free systems and synbody-based viral enrichment. Synthetic Biology (Oxf), 3(1), ysy018. (杂志主页‘高被引文章’板块第一名)

(3) Hong, F., Ma, D., Wu, K., Mina, L. A., Luiten, R. C., Liu, Y., Yan, H., Green, A. A. (2020). Precise and programmable detection of mutations using ultraspecific riboregulators. Cell, 180(5), 1018-1032.

(4) Zhang, Q., Ma, D., Wu, F., Standage-Beier, Kylie., Chen, X., Green, A. A., Wang, X. (2021). Predictable control of RNA lifetime using engineered degradation-tuning RNAs. Nature Chemical Biology, 17, 828-836.

(5) Green, A. A., Kim, J., Ma, D., Silver, P. A., Collins, J. J., & Yin, P. (2017). Complex cellular logic computation using ribocomputing devices. Nature, 548(7665), 117-121.

(6) Yan Z, Eshed A, Tang AA, Arevalos NR, Ticktin ZM, Chaudhary S, Ma D., …Collins JJ, Yin P, Green AA. (2024). Rapid, Multiplexed, and Enzyme-Free Nucleic Acid Detection Using Programmable Aptamer-Based RNA Switches. Chem, 10(7):2220-2244.

(7) Pardee, K., Green, A. A., Takahashi, M. K., Braff, D., Lambert, G., Lee, J. W., Ferrante, T., Ma, D., … Collins, J. J. (2016). Rapid, Low-Cost Detection of Zika Virus Using Programmable Biomolecular Components. Cell, 165(5), 1255-1266.

5.承担的课题：

6.授权专利：

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二十九、

郭滨课题组

联系方式：[email protected]

1.简介：

郭滨 PhD

国家海外高层次青年人才计划

上海交通大学医学院附属第一人民医院 课题组长、PI

上海交通大学医学院研究员、博士生导师

上海市东方学者特聘教授

上海市海外高层次人才计划

2. 研究方向：

利用化学重编程、基因编辑、LNP基因递送等技术构建高潜能造血干细胞用于血液系统肿瘤、恶性贫血及重度免疫缺陷等相关疾病的治疗

3. 原创性科研成果：

先后主持科技部国家重点研发计划“干细胞及转化研究”重点专项青年项目、基金委重大研究计划培育项目、面上项目等。相关研究成果发表在Nature Medicine、Nature Cell Biology、Journal of Clinical Investigation、Cell Reports、Leukemia等期刊，申请造血干细胞应用相关国家专利四项。

团队主要利用脐血干细胞为模型，系统研究人类造血干细胞体外扩增、干性维持及归巢的调控机制，从而开发提高人类造血干细胞临床治疗效果的新策略。经过十年的探索，团队筛选鉴定一个国际原创高效造血干细胞体外扩增激活剂小分子候选药物，接下来将以此为契机全面解析造血干细胞体外扩增的分子机制，开展临床转化研究，结合干性维持与归巢调控新靶点，为血液系统等相关疾病的治疗提供高数量、高质量和高动能的新型造血干细胞。

课题组因发展需要，拟招聘助理研究员、技术员、博士后。

4. 近5年代表性文章：

1.Gu X*, Li K*, Zhang M, Chen Y, Zhou J, Yao C, Zang Y, He J^#, Wan J^#, Guo B^#. (2023). Aspartyl-tRNA synthetase 2 orchestrates iron-sulfur metabolism in hematopoietic stem cells via fine-tuning alternative RNA splicing. Cell Reports. DOI: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2023.113264. (#Corresponding author)

2.Li L, Huang J, Zhang S, Yao C, Chen Y^#, Wang H^#, Guo B^#. (2024)The Chaperone Protein Cct5 is Essential for Hematopoietic Stem Cell Maintenance. Stem Cell Reviews and Reports, 20(3):769-778. .( #Corresponding author)

3.Ding Q, Zhou J, Li Y, Wang Q, Yao C, Jiang R, Meng Q, Wang H^#, Chen Y^#, Guo B^#. (2023). Highly Engrafting Cord Blood Hematopoietic Stem Cells are Enriched in CD34+ Cell Population with High Autophagy Activity. Stem Cell Reviews and Reports, 19(2), 578–581. (#Corresponding author)

4.Chen Y*, Fang S*, Ding Q*, Jiang R*, He J, Wang Q, Jin Y, Huang X, Liu S, Capitano ML, Trinh T., Teng Y^#, Meng Q^#, Wan J^#, Broxmeyer HE^#, and Guo B.^# 2021. ADGRG1 enriches for functional human hematopoietic stem cells following ex vivo expansion-induced mitochondrial oxidative stress. Journal of Clinical Investigation 131(20):e148329. doi: 10.1172/JCI148329. (^#Corresponding author)

5.Chen Y*, Yao C*, Teng Y, Jiang R, Huang X, Liu S, Wan J, Broxmeyer HE^#, Guo B^#. (2019). Phorbol ester induced ex vivo expansion of rigorously-defined phenotypic but not functional human cord blood hematopoietic stem cells: a cautionary tale demonstrating that phenotype does not always recapitulate stem cell function. Leukemia 33:2962-2966. (^#Corresponding author)

6.Guo B*, Huang X*, Lee MR, Lee SA, Broxmeyer HE. (2018). Antagonism of PPAR-γ signaling expands human hematopoietic stem and progenitor cells by enhancing glycolysis. Nature Medicine 24:360-367. (*Co-first author; Spotlight on Cell Stem Cell)

7.Guo B, Huang X, Cooper S, Broxmeyer HE. (2017). Glucocorticoid hormone-induced chromatin remodeling enhances human hematopoietic stem cell homing and engraftment. Nature Medicine 23:424-428.

8.Guo B*, Liang Q*, Li L, Hu Z, Wu F, Zhang P, Ma Y, Zhao B, Kovas AL, Zhang Z, Feng D, Chen S, Zhang H. (2014). O-GlcNAc-modification of SNAP-29 regulates autophagosome maturation. Nature Cell Biology 16:1215-1226. (*Co-first author)

9.Guo B*, Huang X*, Zhang P, Qi L, Liang Q, Zhang X, Huang J, Fang B, Hou W, Han J, Zhang H. (2014). Genome-wide screen identifies signaling pathways that regulate autophagy during C. elegans development. EMBO reports 15:1001-1102. (*Co-first author)

10.Guo B*, Huang J*, Wu W, Feng D, Wang X, Chen Y, Zhang H. (2014). The nascent polypeptide-associated complex is essential for autophagic flux. Autophagy 10:1738-1748. (*Co-first author)

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三十、

白琳课题组

联系方式：[email protected]

1.简介：

白琳 PhD

上海交通大学医学院附属第一人民医院 课题组长、青年PI

复旦大学博士

2. 研究方向：

基于蛋白质组的转录调控解析研究，建立转录因子DNA修饰结合偏好性解析技术；利用多维度组学解析肿瘤队列分子调控网络图景；肿瘤蛋白质组学，基因组学，转录组学等多组学整合。

3. 原创性科研成果：

以第一作者或共同第一作者在Nature Biomedical Engineering、Advanced Science、Nature Communications、EMBO Reports等国际权威期刊发表多篇SCI论文。

4. 近5年代表性文章：

1: Bai L, Yang G, Qin Z, Lyu J, Wang Y, Feng J, Liu M, Gong T, Li X, Li Z, Li J, Qin J, Yang W, Ding C. Proteome-Wide Profiling of Readers for DNA Modification. Adv Sci (Weinh). 2021 Oct;8(19):e2101426. doi: 10.1002/advs.202101426. Epub 2021 Aug 5. PMID: 34351703; PMCID: PMC8498917.

2: Bai L*, Lyu J*, Feng J*, Xiao Q*, Qu Y*, Yang G*, Zhu Y*, Gao H, Liao L, Zang A, Ding W, Zhang H, Zhu L, Wang Y, Wang L, Wang X, Li Y, Li J, Yin X, Zhao G, Liu D, Gao X, Liao Y, Ye D, Jia Y, Ding C. Proteomic profiling of pan-cancer plasma study for biomarker discovery. Nature Biomedical Engineering. 2024 (Accepted).

3: Zhang H*, Bai L*, Wu XQ*, Tian X*, Feng J*, Wu X*, Shi GH*, Pei X*, Lyu J*, Yang G, Liu Y, Xu W, Anwaier A, Zhu Y, Cao DL, Xu F, Wang Y, Gan HL, Sun MH, Zhao JY, Qu Y, Ye D, Ding C. Proteogenomics of clear cell renal cell carcinoma response to tyrosine kinase inhibitor. Nat Commun. 2023 Jul 17;14(1):4274. doi: 10.1038/s41467-023-39981-6. PMID: 37460463; PMCID: PMC10352361.

4: Lyu J*, Bai L*, Li Y*, Wang X*, Xu Z, Ji T, Yang H, Song Z, Wang Z, Shang Y, Ren L, Li Y, Zang A, Jia Y, Ding C. Plasma proteome profiling reveals dynamic of cholesterol marker after dual blocker therapy. Nat Commun. 2024 May 8;15(1):3860. doi: 10.1038/s41467-024-47835-y. PMID: 38719824; PMCID: PMC11078984.

5: Jin J*, Bai L*, Wang D*, Ding W, Cao Z, Yan P, Li Y, Xi L, Wang Y, Zheng X, Wei H, Ding C, Wang Y. SIRT3-dependent delactylation of cyclin E2 prevents hepatocellular carcinoma growth. EMBO Rep. 2023 May 4;24(5):e56052. doi:10.15252/embr.202256052. Epub 2023 Mar 10. PMID: 36896611; PMCID: PMC10157311.

6: Gao H*, Ge W*, Bai L*, Zhang T, Zhao L, Li J, Shen J, Xu N, Zhang H, Wang G, Lin X. Proteomic analysis of leaves and roots during drought stress and recovery in Setaria italica L. Front Plant Sci. 2023 Oct 11;14:1240164. doi:10.3389/fpls.2023.1240164. PMID: 37885665; PMCID: PMC10598781.

7: Qu Y*, Feng J*, Wu X*, Bai L*, Xu W, Zhu L, Liu Y, Xu F, Zhang X, Yang G, Lv J, Chen X, Shi GH, Wang HK, Cao DL, Xiang H, Li L, Tan S, Gan HL, Sun MH, Qiu J, Zhang H, Zhao JY, Ye D, Ding C. A proteogenomic analysis of clear cell renal cell carcinoma in a Chinese population. Nat Commun. 2022 Apr 19;13(1):2052. doi:10.1038/s41467-022-29577-x. PMID: 35440542; PMCID: PMC9019091.

8: Li L, Jiang D, Zhang Q, Liu H, Xu F, Guo C, Qin Z, Wang H, Feng J, Liu Y, Chen W, Zhang X, Bai L, Tian S, Tan S, Xu C, Song Q, Liu Y, Zhong Y, Chen T, Zhou P, Zhao JY, Hou Y, Ding C. Integrative proteogenomic characterization of early esophageal cancer. Nat Commun. 2023 Mar 25;14(1):1666. doi:10.1038/s41467-023-37440-w. PMID: 36966136; PMCID: PMC10039899.

9: Li L, Jiang D, Liu H, Guo C, Zhao R, Zhang Q, Xu C, Qin Z, Feng J, Liu Y, Wang H, Chen W, Zhang X, Li B, Bai L, Tian S, Tan S, Yu Z, Chen L, Huang J, Zhao JY, Hou Y, Ding C. Comprehensive proteogenomic characterization of early duodenal cancer reveals the carcinogenesis tracks of different subtypes. Nat Commun. 2023 Mar 29;14(1):1751. doi: 10.1038/s41467-023-37221-5. PMID: 36991000; PMCID: PMC10060430.

10: Qu Y, Wu X, Anwaier A, Feng J, Xu W, Pei X, Zhu Y, Liu Y, Bai L, Yang G, Tian X, Su J, Shi GH, Cao DL, Xu F, Wang Y, Gan HL, Ni S, Sun MH, Zhao JY, Zhang H, Ye D, Ding C. Proteogenomic characterization of MiT family translocation renal cell carcinoma. Nat Commun. 2022 Dec 5;13(1):7494. doi:10.1038/s41467-022-34460-w. PMID: 36470859; PMCID: PMC9722939.

11: Ni J, Tian S, Bai L, Lv Q, Liu J, Liu J, Fang Y, Zhai Y, Shen Q, Rao J, Ding C, Xu H. Comparative proteomic analysis of children FSGS FFPE tissues. BMC Pediatr. 2022 Dec 12;22(1):707. doi: 10.1186/s12887-022-03764-7. PMID: 36503536; PMCID: PMC9743561.

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附录

上海市第一人民医院介绍

上海交通大学附属第一人民医院始建于1864年，时称Shanghai General Hospital，后更名为公济医院，为当时国内规模最大的西医医院，也是全国建院最早的西医综合性医院之一。医院分设虹口和松江两部，占地29.5万平方米，是目前上海市内占地面积最大的公立医院。医院始终秉承“一切以患者为中心”的服务理念，倡导“公溥仁心，济世臻程”的医院使命，以严谨的医疗作风、精湛的医疗技术和严格的科学管理为国内外患者提供优质医疗服务。

158年来，市一医院在国内、市内卫生系统中一直处于领先地位。医院名医荟萃，在上世纪中后叶汇集了许多国内著名医学专家，在医学上创出了众多国内第一，如：第一例肝叶切除、第一例足趾移植再造拇指、第一例针麻手术、第一台国产心向量图描记器研制、首个国产心脏临时起搏器样机研制等。改革开放40年来，医院在学科建设和人才培养等诸多方面取得新的进展。医院现拥有1个国家临床医学研究中心，1个教育部重点学科，8个国家临床重点专科建设项目，多个上海市临床医学中心、急救中心、医学领先重点学科、重点实验室、医疗质量控制中心、眼科研究所等。近年来，医院着力推动南北两部错位协调发展，开展新一轮“尖峰、高峰、高原”重点学科建设；成立了医院临床转化研究院，技术平台体系涵盖了引领性首席科学家研究平台、中心生物样本库以及临床大数据中心等。

医院科研成果丰硕。获得以国家科技进步二等奖、上海市科技进步一等奖、教育部科技成果二等奖为代表的科技奖励多项。2022年医院重大科研项目取得突破，牵头国家科技部重点研发计划项目3项，总经费5000万元，数量位居上海医疗机构首位；获批国家自然科学基金72项，其中重点项目2项。论文发表刷新纪录，以第一或通讯作者单位发表SCI论文576篇，其中在Cell Research, Radiology, Science translational Medicine等IF>10的期刊发表论著48篇。

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临床研究院介绍（http://icr.shgh.cn/）

临床研究院是上海交通大学医学院附属第一人民医院（上海市第一人民医院）进行科学研究的主要载体，是以临床科学问题为导向、基础与临床跨学科交叉的转化型研究基地。研究院旨在培养一支深度融合的基础-临床研究型团队，实现疾病研究与临床诊治技术的新突破，为实现解决人民健康问题、造福百姓的宏观发展目标奠定基础。研究院为医院各级各类课题科学研究提供实验技术平台，是研究生、进修生、本科生培养和进行科学研究的主要基地，也是医药生物技术交流及大型科研仪器设备共享的重要平台。近年来，临床研究院相继在Science，Immunity，Nature Cell Biology，Nature Communications等国际顶尖学术期刊上发表了重要研究成果。临床研究院对基础与临床研究交叉合作的全新模式进行有益的探索，最终建设成为具有国际先进水平的研究平台，充分吸引和网罗优秀人才，成为人才汇聚新高地。

临床研究院疑难疾病精准研究中心拥有7000平米的实验大楼，并拥有包括流式平台、测序平台、显微成像平台、代谢与蛋白组学平台、分子病理平台和药效评估平台在内的六大平台，并且配备有丰富相关科研经验的团队。中心配备的50万以上的大型设备31台，各类设备总值7000余万元。其中，流式平台能满足流式分析与分选，目前已配置流式分析仪（BD Fortessa）、流式分析仪（BD C6）、流式分选仪（BD Aria III），以及贝克曼流式分选仪（Moflo XDP）；测序平台能满足全流程的测序服务，已配置细胞分析仪（Bioptic Qsep1）、生物信息工作站（浪潮）、测序仪（Illumina Miseq）、核酸提取仪（Qiagen QIAcube）及建库仪（10X Genomics）；显微成像平台能满足多光子、共聚焦等高精尖成像检测，已配置激光共聚焦（Leica SP8）、倒置荧光（Leica DMi8）、正置荧光（Leica DM5500B）、体式显微镜（Leica M125）、双光子显微成像（Leica STELLARIS）及单细胞钙成像（Leica Thunder）；代谢与蛋白质组平台能满足各类基因和蛋白表达及细胞代谢状况的检测，已配置四级杆高分辨液质联用系统（Thermo Q Exactive）、实时无标记细胞功能分析仪（ACEA XCELLigence RTCA）、高效细胞分析系统（Biocep）、细胞能量代谢分析仪（Seahorse XFe96）及单分子基因表达谱分析仪（Nano stringnCounterSystem）；分子病理平台能满足一系列组织细胞形态学研究，已配置染色机（Leica Autostainer XL）、冷台（HistoCore Acradia C）、冷冻切片机（Leica CM3050 S）、切片机（HistoCore BIOCUT）及台式组织脱水机（Leica TP1020）。中心还配有临床生物样本库，可以进行各类临床样本的制备和保存，为基础与临床研究提供样本基础。

目前，中心累计发表论文100多篇（第一作者/通讯作者），申请和中标各级课题65项。平台参与服务的科研课题（局级以上）达1000余项。实验人员使用实验平台或核心研究技术，共发表论文5000余篇，获得各类科技成果奖50多项。中心首批完成申康医院发展中心为期两年的《市级医院中心实验室建设项目》课题，并通过专家组验收。

近五年，中心获批56项国家级项目，总经费超5000万元，其中包括国家重点研发计划1项（1442万元）、国家重点研发计划青年项目1项（499万元）、国家自然科学基金原创探索计划项目1项及延续资助1项（600万元）、国家自然科学基金重点项目1项（297万元）、国家自然科学基金优秀青年科学基金项目2项（400万元）、国家自然科学基金优秀青年科学基金项目（海外）6项、教育部海外引才专项2项（180万元）、国家自然科学基金面上项目22项（1164.5万元）、青年项目18项（498万元）、国自然青年学生基础研究项目1项（30万元）。其中，2024年度中心获批国家级基金15项，包括国自然原创探索项目延续计划1项、国家优秀青年科学基金（海外）1项、教育部海外引才专项2项、国自然面上项目2项、国自然青年项目8项、国自然青年学生基础研究项目1项。2020年以来，中心科研人员以第一作者/通讯作者身份在Immunity、Gastroenterology、Science Advances、Nature Communications等国际知名杂志发表科研成果超百篇，累计影响因子1300多。

2023年，中心在转化研究方面取得阶段性突破。中心主任王宏林教授与临床团队合作，通过单细胞测序分析3岁到91岁人体骨髓样本信息，创新性挖掘了鉴定了1个特异指标用于精准评估人体免疫年龄，该研究成果已与广东泰恩康医药股份有限公司签署技术转让合同，合同转让总金额6亿人民币，首期付款到账3000万元，创下上海市医疗机构专利转让首批到账金额最高记录。

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