产品试用 | AlphaFold 3功能远远不够，用它看看？

北京石墨烯研究院 · 公众号 · · 2024-05-23 18:40

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谷歌DeepMind近期发布了AlphaFold的最新版本——AlphaFold 3生命分子结构的预测模型，在生物学领域再次掀起一股讨论热潮。在Nature发表的一篇论文中，将其称为这是一个革命性的新模型，它几乎可以检测所有生命分子的结构，包括蛋白质、DNA、RNA、配体等对蛋白质与其他分子类型的相互作用，可对药物发现带来至关重要的影响。

谷歌 DeepMind 发布的 A lphaFold 3

如今，AlphaFold 3对药企来说的功能还远远不够。例如，蛋白质结构中分主链与侧链之分，Alphafold 3在预测主链的结构上具备很大优势，但在侧链上的准确度略显逊色。

对于小分子药来说，由于本身药物的分子量小，与蛋白质的结合点位就少，所以主链和侧链结构都需要精准一些。在侧链结构检测中，药企更多的是使用动力学模拟的方法，这种方法需要依靠试验检测和计算的方式。Alphafold 3相比于试验检测的精确度要差一些。所以，只有把疾病认知和临床实验环节一起赋能，才能提升靶点发现能力和药物研发成功率。

冷冻透射电子显微镜是结构生物学中关于蛋白质结构研究的最新技术利器，冷冻透射电镜载网是其重要耗材，但传统电镜载网存在气液界面问题致使成像结果单一，样品暴露在空气外致使样品变性，制样过程中冰层过厚致使背景噪声太强等诸多问题，令测试结果不稳定。

BGI研制的石墨烯电镜载网

北京石墨烯研究院（BGI）研制的单层石墨烯电镜支撑膜（石墨烯电镜载网），是冷冻电镜表征制样的升级方案，通过在传统载网表面引入单原子层厚度的高品质单晶石墨烯薄膜，有效负载生物大分子、单原子、纳米颗粒等样品。单层石墨烯电镜支撑膜几乎无背景噪声，能有效缓解气液界面、优势取向、冰层不均、样品位移等问题，提升成像衬度，富集样品浓度，进而方便用户实现高分辨率成像及结构解析。