R语言生信数据分析及可视化作图班

生信之家 · 公众号 · · 2023-06-30 11:57

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R语言生信数据分析及可视化作图

（理论+实践课）

（两天网络授课，具体安排：7月1-2日）

课程可免费回放，专家微信群指导，确保你能学会！

学习班简介

众所周知，R软件是用来做统计分析和作图的软件。本次学习通过手把手教学让学员掌握R软件下载安装、Rstudio用法、常用医学统计学算法模型R实现、R语言常用作图、R语言数据处理方法与编程技术、掌握R语言自主学习实践的方法与技巧，现场解答学员在实际工作中遇到的有关技术问题，让学员更好地掌握相关技术的应用。另外，课后学员有感兴趣的图片，老师也可以提供相应的R代码。

总体思路是根据生信相关的SCI文章为主题，完成里面所有的分析内容。该培训适用于对生信分析或者医学统计学分析感兴趣，编程零基础及以上的学员参加。

讲师简介

宋伟博士，中国精准医疗学会委员

成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。

培训经历：在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。

培训方向：《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等

培训目的

通过2天的培训（半天理论课程+1天半实践操作），可以学会R语言基础（输入文件格式、输出文件格式、操作代码的参数调整）、统计学上各种算法的实现、SCI常用图片生成。

R语言生信数据分析及可视化作图日程
课程		主要内容
第一天	R语言——编程环境、数据结构、语法和练习	R 软件的历史、简介、优缺点
上午		R 编程形式与资源
		R 软件的安装
		Rstudio 使用技巧及安装
		R 语言的数据结构（元素、向量、矩阵）
		R语言的编程方法
		一起练—— R 语言的编程练习
第一天	生信参考文献解读	生信文献的流程解读
下午		常用的生信分析流程
		流程模块使用的 R 包及函数简介
		案例展示
	常用R函数	统计编程思想与流程
		数据描述性分析 R 实现
		统计分析 R 实现
		实战操作演练——卡方检验、回归分析、方差分析、Fisher精确检验、相关性分析等
第一天	常用R包（1）	R包的介绍——r-project 来源及 Bioconductor 来源
晚上	转录组、蛋白组、表观组、代谢组等不同组学数据差异基因筛选及可视化	R包的安装——在线安装及本地安装方法
		芯片数据预处理——标准化，归一化
		差异分析——差异基因筛选，火山图
		无监督聚类分析——PCA分析，聚类热图分析
第二天上午	常用R 包（2）	R语言功能富集分析，包括KEGG pathway，以及GO BP, CC, MF分析，功能条形图，功能气泡图可视化
	基因、蛋白相关分析	共表达分析——pearson法，相关性散点图
		生存预后分析——KM曲线图，添加p值，HR值
		样本相关性及相关性热图分析
		实操
第二天下午	常用R包（3）	单细胞测序相关分析
	常见思路	RNA甲基化相关分析
		时间序列分析——多组连续样本的基因表达聚类
		实操
	R语言学习的方法与技巧	算法思想、R包及函数用法、参数说明、范例程序
		如何找到有用的R资源
		R语言学习小窍门
		互动环节与答疑

往期学员评价

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