如何获得外显子变异频率信息

外显子的研究是高效的发现人类疾病信息的研究手段。虽然其大小只占约 1%人类基因组 ，但多数疾病都是由编码基因的低频或罕见突变引起的。

外显子测序分析中，变异注释尤为关键。通过变异注释，可以了解突变的变异位置、频率等信息，从而结合生物学背景筛选出候选新生变异位点，以用于后期功能研究或疾病模型构建。外显子变异注释主要分为四大类：位置注释，变异频率信息，蛋白变异信息，变异基因功能类型。今天就对变异频率信息挖掘进行简单介绍。

正常人体基因组存在大量的变异信息，其中，90%以上的变异信息是高频率（>5%）的。一般来说，高频的变异往往与疾病无关，只有部分低频的变异具有致病性。通过对变异进行频率分析筛选，能有助于找出有效致病突变位点。

为达到变异筛选目的，一般会在几个大型的外显子变异数据库中对新发现的突变进行注释，了解突变频率等情况。

常用的数据库有以下：

◎ dbSNP、

◎ Hapmap、

◎ COSMIC、

◎ 1000Genomes projects千人基因组计划（根据人种来源，分为全部人种、东亚人、美洲人等不同子数据库）、

◎ ESP6500外显子计划、

◎ ExAC（根据人种来源，分为全部人种、东亚人等不同子数据库）。