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走进组蛋白乙酰化,解析转录因子与DNA转录的关系

解螺旋  · 公众号  · 医学  · 2017-05-15 18:00

正文


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作者:亢小玉(转载请注:解螺旋·医生科研助手)

分析的文章题目为:Egr-1 and RNA POL II facilitate glioma cell GDNF transcription induced by histone hyperacetylation in promoter II(回复 170515 下载文献)


本文作者首先提出一个假设,组蛋白H3k9在GDNF启动子II区的高度乙酰化,组蛋白H3k9的高度乙酰化显著增加了Egr1与GDNF启动子区的结合,以及RNA聚合酶II募集到GDNF启动子区,从而促进GDNF在胶质瘤细胞中的高转录。


根据作者的题目和摘要的内容,首先想带入大家先了解下面的概念,以促使阅读者对文章做出更深刻的理解,这是小主人自己做的拙劣图。


乙酰化: 指将乙酰基转移到氨基酸侧链基因上的过程,最常见的是组蛋白乙酰化。如图Fig1为细胞中DNA与组蛋白存在的形态图。


一般来说,乙酰化修饰能够中和组蛋白尾巴上碱性氨基酸残基上的正电荷,减弱组蛋白与带有负电荷的DNA之间的结合,选择性地使得某些染色质区域的结构从紧密变得分散,有利于转录因子与DNA结合,从而促进某些基因的转录,增强基因的表达水平。



转录因子(Tf)与RNA聚合酶(Rp): 真核生物转录起始时,需要RNA聚合酶对起始上游的DNA启动子序列进行识别和结合,生成转录前起始复合体,但是转录起始时RNA聚合酶并不直接识别与结合启动子区,而是依赖转录因子识别并结合起始序列。转录因子与RNA聚合酶可以相互结合,也可以不结合,如图Fig2。

Fig2.经典启动子区转录模式


下面就对文章做出深度分析


作者利用分总的实验形式进行了以下的验证:


第一步,分----把现象分别一一展示


首先发现组蛋白乙酰化水平的变化,RNA聚合酶ll的变化,以及Egr-1的表达水平变化


1.在正常脑组织,低级别胶质瘤,高级别 胶质 肿瘤组织中,观察组蛋白H3k9在Egr1与GDNF启动子区的结合位点处的乙酰化水平。


结果显示:高级别胶质瘤组织中,组蛋白H3k9在Egr1与GDNF启动子区的结合位点处的乙酰化水平显著增高(如原图)。








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