必看！如何快速从NCBI认识一个「基因」？

编辑 | 澹泊研究僧

来源 | NIRO（ID：NIRO-keyanmiao）

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一、打开NCBI网站并搜索基因

1. 访问NCBI网站: 打开NCBI官网，这是生物信息学资源的重要平台；

2. 搜索基因: 在NCBI网站首页的搜索框中，选择“Gene”选项，然后输入想要查询的基因名称(如“IGF-1”)，点击“search”按钮进行搜索。

二、查看基因基本信息

1. 选择种属: 搜索结果中会显示多种种属的该基因，如人类(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)等。根据需要选择相应的种属，并点击进入该基因的详细信息页面。

2. 浏览基本信息: 在基因详细信息页面中，可以查看该基因的GeneID、基因名称、基因功能、MGI、Ensembl链接等基本信息。

三、深入了解基因序列信息

1. 访问Ensembl链接: 点击Ensembl链接，可以了解该基因的序列信息，包括基因转录本以及特定转录本的外显子信息。这些信息对于靶向设计sgRNA(如基因敲除实验)至关重要。

2. 查看外显子信息: 在Ensembl页面中，选择特定转录本，并点击左侧“exons”信息，即可得到该基因的外显子与内含子信息。敲除基因的外显子是最主要的敲除方式。

四、查找基因相关研究

1. 访问MGI链接: 点击MGI链接，可以查找该基因已有哪些研究。MGI网站收集了大部分小鼠基因编辑的模型，可以查询特定基因的已建模型，以及该基因对小鼠的影响(如是否胚胎致死)。

2. 阅读研究摘要: 在MGI页面中，可以阅读与该基因相关的研究摘要，了解该基因的功能、作用机制以及潜在的应用价值。

五、序列比对与引物设计(可选)

1. 进行序列比对: 如果需要，可以使用NCBI的BLAST工具进行序列比对。输入需要比对的序列，设置检索范围和优化选项，然后提交进行比对。比对结果可以帮助识别序列中的相似性和差异性。

2. 设计引物: 根据基因序列信息，可以使用相关软件(如Snapgene)进行引物设计。设计好的引物可以用于后续的基因克隆、测序等实验。需要了解Snapgene可以浏览这2篇文章《 科研软件 | 第四期：超详细的保姆级SnapGene软件应用汇总，建议收藏备用 》和《 科研软件 | 第三期：SnapGene 7.0.2版软件的安装教程、界面标注及酶切位点片段插入使用教程，干货满满 》。

六、注意事项

1. 基因命名规则: 不同物种的基因命名规则可能有所不同。在查询基因时，要注意区分不同物种的基因名称和ID。

2. 序列准确性: 在查看基因序列信息时，要确保所查看的序列是最新且准确的。可以定期访问NCBI网站以获取最新的基因序列信息。

3. 文献支持: 在了解基因功能和作用机制时，要查阅相关文献以获取更详细和准确的信息。