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为啥这6.113分SCI文章也还是让人看不太明白呢……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2021-07-18 08:20

正文

这是一篇分不算低,但看上去乱七八糟的蚊帐 。原来想给你们讲Wnt信号通路的文献, 可下载了一篇看了发现是讲GSK3β在非Wnt信号通路上的磷酸化的的 ,当然会有点复杂。所以夏老师就又搜了一篇 ,虽然这篇也是五分以上的蚊帐( IF=6.113 ,但实在是……



好吧,我们开始看蚊帐吧,这篇蚊帐讲的是牙齿发育的, 当然,牙齿发育离不开成骨细胞 。他们首先发现了一个miRNA的表达与成骨细胞中 ,相关标志物表达有关, 其实就是对体外表型有影响:



然后对此进行了敲减( miRNA Sponge )和过表达( Precursor )的验证 ,发现确实与体外表型相关



接着他们分析了一下这个miRNA的下游靶基因 ,甚至还做了靶基因突变后的Luciferase的实验( WT蓝框, Mut绿框 ):



接着, 他们分析了一下靶基因在老鼠的牙龈样本上表达的情况 ,说明了靶基因的表达相关性:



然后他们做了一下敲减靶基因后 ,各个信号通路中关键分子的磷酸化和表达影响,发现基本上多少都有点变化:




接着检测了一下miRNA敲减或者过表达后 ,各个信号通路中关键分子的磷酸化和表达变化



多少也有点变化 ,嗯,是的……接下去他们就做了大量的实验,用上了各个信号通路的抑制剂和miRNA过表达共同作用, 看最终体外表现的变化:



实际上这一步就是证明miRNA与信号通路上下游关系 ,作者实际上想表达的是比较复杂的一个过程, 大概就是这样:



miRNA抑制了靶基因 ,靶基因可以抑制信号通路 ,而信号通路抑制成骨表型……


但我们来看看他们的论证方式 ,这也是很多给你们讲MiRNA所谓套路里比较常见的, 首先是论证MiRNA和表型的关系, 然后论证miRNA和靶基因的关系, 接着就是靶基因和表型相关:



到这里其实还是差不多的, 但实际上你看到这张图就会发现,到这里为止,并没有证明miRNA是直接通过靶基因来调节体外表型的。接着那些滥用成语给你们讲套路的人会告诉你们: 哇,这种时候,必须要引入一个明星分子啊, 特别是引入一个信号通路就更好了!


于是整篇蚊帐变成了这样 我估计接下去,你们就该看不懂了。但别急,边看边想想吧 ):



在并没有证实miRNA通过靶基因调节表型的情况下, 却又引入了另一个不确定因素。这就使得原来想要表达的他们在一条线上 ,变成了错综复杂的网络。仔细看看哈,miRNA直接抑制成骨表型,但不是通过NFAT5,讲得通不? 应该可以吧,谁能保证miRNA就这么一个靶基因。那miRNA影响别的靶基因 ,从而影响到信号通路,这也说得过去吧? 因为这个命题和miRNA抑制NFAT5并不矛盾 ……

是不是看到文献就一头雾水 ?是不是连文献里的图都看不太懂 ?是不是即使全文翻译了,都还不知道文章讲的具体是什么意思


来了,终于来了! 这本终于正式出版了 ,祝你们心明 眼亮






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