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手把手教你用FAPROTAX和FUNGuild进行菌群功能预测分析

生态学家  · 公众号  ·  · 2023-12-06 11:50

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01
课程简介
FAPROTAX是一款基于16S测序的功能预测软件。它整合了多个已发表的可培养菌文献的原核功能数据库,预测准确性较好。FAPROTAX较适用于对环境样本(如海洋、湖泊等)的生物地球化学循环过程(特别是碳、氢、氮、磷、硫等元素循环)进行功能注释预测。
FUNGuild是一款基于ITS的功能预测软件。由于真菌基因组数据的缺乏,很难做KEGG通路的预测,因此FUNGuild是基于已发表的文章数据所整合起来的一种称为“guild”的分类预测。Guild更类似是一种资源利用吸收所进行的功能分类,通过对Guild的预测,可以从另外的生态功能角度研究真菌的功能。
本次微科盟生信员将为大家带来FAPROTAX和FUNGuild菌群功能预测分析及生科云实操视频讲座,让您方便快速地学会微生物群落功能预测。微科盟生科云:https://www.bioincloud.tech

02
观 看 方 式

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