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中国抗癌协会主办线下公益培训（CNS文章空间多组学测序数据分析）

BioArt · 公众号 · 生物 · 2025-04-03 08:48

正文

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长江之滨风正劲，巴渝大地春潮涌！2025年4月11-13日，由中国抗癌协会肿瘤标志专委会肿瘤测序及大数据分析专家委员会主办的 “CNS文章肿瘤研究中空间多组学测序数据分析系统培训班” ， 将于4月11日重庆举办 。

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会议背景

近年来，随着空间组学技术的快速发展，肿瘤研究已进入“多模态、高维度、空间解析”的新阶段。为助力肿瘤标志物研究的创新发展，推动空间多组学测序在临床和科研中深度应用，探索肿瘤的发生发展分子机制， “CNS文章肿瘤研究中空间多组学测序数据分析系统培训班” 将于2025年4月11日在重庆重磅开启。本培训班聚焦前沿技术，让非生物信息学和生物信息学初学者在大数据分析技术的加持下做出更有价值的科研成果，推动医学研究和生命科学的发展。

主办单位：中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会

肿瘤测序及大数据分析专家委员会

协办单位：华哥生信、西部数智医疗研究院

支持单位：寻因生物

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课程亮点

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教学理念

从单细胞测序技术的最新进展到数据挖掘、免疫相关生信分析的核心技巧，覆盖肿瘤标志物研究的全链条应用场景。

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靠谱团队

华哥培训班已经开班六年，学员发表Cell、Nature、Science主刊文章8篇，子刊及一区文章累计超过90篇！

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专业负责

一对一指导、包教包会是我们开培训班六年来一贯的宗旨。我们敢承诺包教会的底气是来自多年的讲课经验和认真负责的态度。课程结束，答疑不结束！

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培训内容

深入剖析二十多篇CNS文章的分析思路和分析方法，按照CNS文章源代码讲解，以文章的fig为例进行代码演示和复现学习，个性化分析。

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课程内容

08：00-09：00： 空间转录组在CNS文章应用

1.空间转录组CNS文章思路解析 【 Nature】

2.空间转录组技术在科研领域的应用

3.空转在肿瘤研究内容及思路及常见图形解读 【 Cell】

09：15-10：15： 以Nature Genetics文章源代码为例，系统学习seurat的系统分析

1.常规空间转录组数据读取 【 Cancer Cell】

2.数据质控--去除低质量细胞

3.归一化处理、PCA降维、聚类、UMAP 【 Nat Cancer】

10：30-12：00：以Nature文章源代码为例空间转录组数据基本分析

1.多个空转样本整合 【 Nat Med】

2.单细胞和空转数据联合分析

3.三维图形展示和个性化作图 【 Science】

13：00-14：00： 空间轨迹分析

1.不同表达的基因和基因集轨迹变化 【 Nat Commun】

2.trendsceek识别基因空间表达梯度

3.SPARKX识别空间变量在轨迹上的非随机基因

14：15-15：15： 空间细胞共定位及细胞通讯

1.MISTy做细胞-细胞之间的dependency 【 Nat Genet】

2.CellChat v2推断细胞通讯网络

3.可视化网络中心性分数及绘制配体受体个性化展示 【 Sci Adv】

15：30-16：30： 肿瘤克隆空间演化

1.空间肿瘤细胞染色体拷贝数变异计算 【 Nature】

2. siCNV 分析并构建了克隆进化树

3.空间克隆分布与 Gleason 分级相关性

16：45-17：45：以Cell文章源代码分析肿瘤空间生态位

1.GeneTrajectory空间基因轨迹推断 【 Immunity】

2.基于深度学习Cellpose高质量的细胞分割

3.ISCHIA细胞类型和转录物在同一位置空间共现 【 Nature Metab】

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主讲老师

主讲老师华哥 ： 中山大学博士，师从加州大学终身教授 ，一直钻研于单细胞多组学数据分析和机器学习算法研究， 发表过多篇CNS子刊，参与过多项国自然重点、国家重大专项、孔雀计划等项目申报 ，在国内多家著名医院担任国自然标书指导老师，与多位院士团队和国外Top实验室合作，指导过多篇CNS文章生信分析。

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华哥科研平台介绍

1. 从19年开始到现在，我们在生信教育领域 深耕六年之久 ，时间是好的证明！

2. 一对一指导、包教包会是我们开培训班五年来一贯的宗旨 。我们敢承诺包教会的底气是来自多年的讲课经验和认真负责的态度。 课程结束，答疑不结束！

3.六年来华哥培训班的学员发表 Cell、Nature、Science 主刊文章8篇，子刊及一区文章累计超过90篇 ！部分学员成果展示如下：

4. 深入剖析 二十多篇CNS文章 的 分析思路和分析方法， 按照 CNS文章源代码讲解 ，以文章的fig为例进行代码演示和复现学习，个性化分析。

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注册报名

直接添加工作人员微信号
微信号： huagesx

备注"姓名+单位+单细胞测序"

联系方式

张老师 15623525389 （ 微信同号 ）

刘老师 15951678516 （ 微信同号 ）

往期回顾

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注意事项

1.中午主办方将为各位学员提供一顿简餐；

2.由于本次为免费公开课，学员需自理交通及住宿费；

3. 此次线下公开课名额有限（限定60人），请及时报名参加。

4. 没有获得名额的同学，或因路途遥远无法参加的同学请不要灰心，我们特别申请了一次线上内部预约直播分享。

复制下方链接到浏览器打开填写，即可进行预约：

https://www.wenjuan.com/s/UZBZJvx9PS/

预约名额有限，先到先得。审核通过后会及时和您取得联系，请注意查收消息。

培训时间：4月11日

培训地点：重庆市高新区高新大道国家生物产业基地1期6号楼1楼，西部数智医疗研究院学术报告厅