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文章发不掉,是因为你不够硬气

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-11-19 07:04

正文

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现在人间三月天,国自然也都完事了,接下来要干啥呢,要想想怎么实施新一年的计划了,尤其是有科研规划的小伙伴,一定要启动了。


一年之计在于春,科研的好头也在于春天。


生信人除了介绍大佬的发文思路,新的生信,测序技术之外,也会给大家推荐一些超级好发表的,旱涝保收型的思路。


今天就给大家推荐一个,24年肯定有很多文章会出现这个思路。文章发表区间3到5分。


分析呢比较简单,属于我们家3系的技术服务产品。自己加点实验,性价比超高。来看这篇文章:Novel biomarkers of inflammation-associated immunity in cervical cancer


文章2024年3月刚发表在Frontiers in Oncology,这里就有小伙伴说了,这个杂志是不是不咋地。


我只能说这不是你该操心的问题,有大米,就找多大的锅。


看这个文章标题呢,浓浓的公开数据库纯生信挖掘的味道,当然它确实也是这样的文章。


首先文章开头说:宫颈癌是一种高度恶性的癌症,与炎症有直接的因果关系,主要由持续的高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染引起。这句话含金量超级高,会不会写文章,就看这句话了。


鉴于早期检测和中后期治疗的挑战,我们的研究旨在确定CC中炎症相关的免疫生物标志物。


这句话提出了这个方向研究的意义。怎么说,让你看起来不像是蹭热度,但是其实分析就是蹭热点。

文章主要使用生物信息学方法结合实验验证,将两个CC数据集(GSE39001和GSE63514)整合到基因表达综合库(GEO)中,以消除批量效应。通过R语言鉴定获得免疫相关炎症差异表达基因(DEG)。随后讨论了CC病例和对照组之间不同水平的免疫浸润。加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定了CC中的7个免疫浸润相关模块。在这些发现的交叉点上,确定了15个与炎症相关的免疫DEG。此外,使用String数据库构建了一个蛋白质相互作用网络,并使用“CytoHubba”筛选了五个枢纽基因:CXC趋化因子配体8(CXCL8)、CXC趋化因子配体10(CXCL10)、CX3C趋化细胞因子受体1(CX3CR1)、Fcγ受体3B(FCGR3B)和SELL。
通过PCR实验测定了这五个基因在CC中的表达。很典型的热点基因集筛选后,加实验验证。

文章做的图不是很好看,我就不都贴了,大概长这样。


那么做为生物信息分析出身的小编看到这篇文章,有如下几点感想:
一、如果是我做,那么我纳入的数据集估计会更多一些。
二、如果是我做,那么图肯定会更炫酷。
三、如果是我做,单细胞什么的我肯定会放上,卷一卷技术。
看到没这些都是从技术角度出发来说的这个问题。图好看,数据多,技术新,能解决文章档次吗,其实不能,只能是在一个对应的区间跳来跳去,并不能从本质上提升。

当然还有小伙伴说,我也做过类似的方向,热点基因集预后的,为啥就发不掉。因为你的那个文章太明显了,就是蹭热点。而这篇文章,看着就不是有意为之。他说的就很有道理。小故事编的就很到位。


尤其是第一句话:宫颈癌是一种高度恶性的癌症,与炎症有直接的因果关系。


咔嚓,就立住了。


你瞅瞅蹭热点的文章都是这么写的:xx很重要,但是在xx中并没有研究过,所以我们要研究。你这是一个必要条件,都不够充分,话说的都没底气。


肯定有小明要问,我也想这么硬气怎么做。


这个疾病是特殊的,宫颈癌是HPV感染,感染肯定有炎症,这就是废话。


但是其他的疾病就不一定。保不齐是炎症导致肿瘤,还是肿瘤导致炎症,这个只能说相关,不能说因果。


因果,有没有办法证明有因果呢。


要不说大家都是小聪明呢,我直接先用孟德尔随机证明因果,随后我硬气一把,然后咔咔咔,热点基因集做预后,可不可以。当然可以。

所以并不是说一定要技术够牛,主要是要看怎么编故事。


其他的数据,方法,都是素材。


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