影片以战争为名，其实战争只是陪衬。确切地说，这是凯撒自己的战争。
三部曲一路走来，治疗人类老年痴呆的药物给了凯撒智商，从《猩球崛起》青年凯撒第一次怒吼NO！展现出的言论自由倾向，之后自我意识成熟形成了对身心自由的向往；第二部的中年凯撒说话简单缓慢，解决了猿族和人类这些来自外部的冲突；
如今《猩球崛起3：终极之战》里暮年的凯撒已然语言流利，要面对的则是自己的心魔。
与《猩球崛起2：黎明之战》相比，导演马特·里夫斯（Matt
Reeves）刻意削弱了战争场面，注重于角色心理层面的刻画，也因此增加了诸多希伯来文化元素。《猩球崛起》三部曲的前两部的人类主角都是站在猿族一边的和平主义人士，这一部却别出心裁将人类的角色集中于上校这个极致反派的身上。以上校为代表的人类因此极具宗教色彩，更准确的说应该是邪教色彩。
《失陷猩球》（1970）中受到人类崇拜的原子弹上印着ΑΩ
影片开篇，画面集中于人类士兵的头盔，头盔上有很醒目的字母ΑΩ，猿族叛徒“驴子”的额角也烙有这两个字母。ΑΩ即“阿尔法和欧米伽”（Alpha
and
Omega），这个概念来自原版“猩球”系列的第二部电影《失陷猩球》（1970），其中受到人类崇拜的原子弹上印着ΑΩ。编导把这个概念移植到《猩球崛起3：终极之战》中，上校把自己领导的国民自卫队命名为“阿尔法和欧米伽”，
导演马特·里夫斯解释说，影片通过人们对上校的盲目追随来告诫宗教狂热的非理性和危险。
红圈所示：片中字母ΑΩ/宗教图案ΑΩ
上校带着十字架项链，手背上烙着字母ΑΩ，办公室里也隐约可见十字架的各种象征。他把与猿族的战争称为“圣战”，士兵们怀着对战争胜利的期待和未知，高呼“我们既是开始也是结束”（We
are the beginning and the
end），而无论“阿尔法和欧米伽”还是“我们是开始也是结束”都出自《启示录》。“阿尔法和欧米伽”分别是希腊字母的第一个字母 alpha (α或Α)与最后一个尾字omega(ω或Ω)组成，是基督教的符号象征。在该书中耶稣以希腊文的首字与尾字来自承为一切受造物的起始与终末。天主和耶稣分别在《启示录》第一章与第廿二章以阿尔法和欧米伽自称，并言称自己“既是（一切的）开始也是结束”。
所有的迹象都指向这似乎是一位有着十足信仰的信徒，然而他可以为了自己的信念无所不用其极。所谓反常是妖、物极必反， 所以这些只是上校合理化所有极端偏执和独裁残忍的假象。
从另一个角度来说，藉由符号和口号，语言文字的僭越其实让以上校为首的人类犯下了渎神大罪。上校甚至声称“我为了拯救人类，牺牲了自己的儿子”，这句耶稣受难时语出上帝的名言，彻底暴露出上校俨然以上帝自居了。
极端和渎神，后果不言自明。
片中上校/《现代启示录》马龙·白兰度的角色
人类军队基地地道墙壁上有一闪而过的涂鸦文字是“现代启示录”（Apocalypse
Now）的变体。影片以此方式致敬科波拉（Francis Ford
Coppola）导演的旷世之作《现代启示录》（1979），另外尤为明显的情节就是上校用剃刀刮净头皮，与马龙·白兰度在《现代启示录》的形象如出一辙。
“启示录”英文Apocalypse一词的原意指“揭开覆盖着的（秘密）”，引申为“启示”。新约中的“启示录”作为宗教文学作品广为流传，包含语言和象征情景，多指大动乱和大毁灭，尤指世界末日迫近和正义者救世的内容。影片强调“启示录”的概念，应该还有一层原因：墙上潦草的涂鸦变体使该词的英文词头变成是ape（猿）这个词，这样该词语就衍生出“猿族启示录”（Ape-ocalypse）的意思。同时词根-calypse有“覆盖”的含义，“猿族的覆盖”所表达的含义就十分清楚了。片中此处中文翻译为“猴灾泛滥”，但是“覆盖”是具有双关含义的，也可以理解为“占据”。
上校用“启示录”这种标语类的用词当然是以“正义者救世”的角度来激励人类与猿族展开圣战，然而“（猿族）启示录”的一词双关，早已预定了结局，那就是人类世界末日的迫近。
科波拉旷世之作《现代启示录》（1979）
影片中所有的人类都变成了反派，这种设定一定会让人类观众具有强烈的不适感，好在还有小女孩诺娃。
诺娃的名字来自1968年版的第一部《人猿星球》，该角色本身的设定就是一个人类的哑女，但却是一个美丽的成年女子。第一部《人猿星球》没有解释人类为什么失去了语言的能力，《猩球崛起3：终极之战》对此给予了合理的解释。
原版《人猿星球》中是人类的男主角给这个美丽哑女起名叫诺娃（Nova），意思是新的或是新星；而本片中，诺娃的名字来自猿族角色莫里斯， 确切的说是来自一件金属饰品。不能说诺娃这个角色具有前后一致性，但是诺娃这个名字应该是联系新旧系列影片的纽带。
《人猿星球》的诺娃/小诺娃
诺娃的角色本身就是对前作的致敬，影片中有诸多对于原版系列电影的致敬。
凯撒的小儿子名叫柯尼利厄斯， 是对原版“猩球”系列电影中同名猿族角色的“颠倒式”致敬，原版中凯撒的父亲名叫柯尼利厄斯。
人类士兵的标语---“只有死猿才是好猿”，出自原版“猩球”系列的第二部电影《失陷猩球》（1970）。
原版《人猿星球》中有一个非常重要的道具---会说话的洋娃娃，它是证明人类曾经具备语言能力的关键证据。《猩球崛起3：终极之战》中，导演马特·里夫斯说诺娃的洋娃娃玩具在片中并非只是简单直白的复制，依然有着举足轻重的作用。
