为了鼓励freescience联盟的读者伙伴们深入思考、踊跃提问,我们为大家拿到了1个实用生物信息学培训班的免费名额(价值2500元)福利。把生信相关问题写在有道云笔记里,进qq群463367325,把有道云笔记链接私信发给小觅0号,我们将选出1组最优质问题,该提问者将获得这1个免费学习名额~本次活动的问题搜集截止时间:2017年10月20号18时整。授课地点:浙江大学紫金港校区。
点这里查看活动细则
本周是生信周,周六晚8点的线上沙龙,赵老师继续和大家分享 免编程学生信-genespring挖掘数据实操系列之找差异分子案例实践——万能芯片数据分析,并现场答疑。有兴趣的小伙伴点推文左下角的 阅读原文 报名参与周末沙龙直播~
发送沙龙到后台,复习前几期的沙龙内容,领录音和高清视频~
发送生信到后台,循序渐进学生信,领取genespring说明书。操作中有了具体问题,现场可以交流讨论~
小伙伴们,免编程找差异的genespring软件好用吗?赵老师写了一整个系列,用还原文献的方式介绍了genespring的使用(发送大数据到后台,查看整个系列)。
从第四期沙龙开始,赵老师陆续将genespring推文系列,用直播操作的形式,给大家演示一篇文章是怎么用免编程的genespring分析出来的~
生信沙龙与meta沙龙直播课程交替进行,第一、三、五、七期沙龙为猴哥meta主题,第二、四、六、八期为赵老师的生信主题。
有小伙伴说,如果能开文献解读沙龙就好了~
大星宝宝听见哭晕……第二期沙龙的主题就是lncRNA高分文章解读。
赵老师从生信临床应用的角度,在线讲解了一篇高分lncRNA文章套路;并现场解答了那周读者提出的以下方面疑问:genespring操作问题,生信检索问题,lncRNA文献流程相关问题,通路图绘制的入门问题。
猴哥也在现场回答了一系列meta循证+代码操作问题。
点这里复习第二期沙龙。
今天学术问答版展示的是 grahpad 相关讨论。
问:请问大家,我用ps组合了grahpad做的多张图片,为什么放出来后字体就很模糊了?急求
答:要改输出像素
问:这样的图用什么画比较好看呢?这个真是太丑了,我用的origin而且颜色有重复的。
答:用graphpad。
问:大家知道什么软件做的这种图吗?
答1:R吗?颜色好看
答2:R可以做吧,加一个jitter函数水平抖动
答3:说实话挺像excel,用graphpad也可以
答4:graphpad棒棒哒
答5:Graphpad prism就可以做
答1:也像orgin哎
答6:中间的黑线是指平均水平吗
问:是的,这是散点图最近流行的很啊
答6:prism能加吗,这种R,等很多能做的。R能加线,但我不知道prism怎么加,而且是平均值的位置。
答5:你设置啊,那个mean SD 或者SEM
答6:哦对,直接显示mean
答5:是呀
之前的学术问答版的作图相关讨论:
发送福利到后台,内有软件和教程。
看刘永鑫博士分享的 Endnote X8云同步:家里单位实时同步文献笔记,有网随时读文献
学术问答版23:图用什么做出来的,ppt作图low吗,single-organism process在转录组里go富集是什么意思
(前阵子攒了一包ppt作图的技能,发送技能到后台,仔细找就能看见。)
知识需要传播和交流,学习的过程中如果遇到具体问题,欢迎大家按需进入以下主题交流群。入群前发送wg21到后台,查看入群提问须知。
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生信大数据版主介绍:赵忻艺,将大数据应用于医学科研,主要包括临床医学数据的挖掘、收集、整理和利用(标准化和科学化的数据库),医学分子大数据的整理、利用及研究(基因、蛋白及代谢)。特别针对肿瘤个体化的基因测序和数据快速处理,寻找个体化的分子标志物、药物靶标和治疗方案。目前,已建立浙大大数据挖掘团队,旨在降低研究者学习大数据的门槛,推动大数据共享与研究协作,发表更高质量的研究成果,为科研决策提供精准的预测和实验证据。