本文介绍了浙江大学医学院附属邵逸夫医院团队在Advacnced Science期刊上发表的研究,关注m6Am甲基转移酶PCIF1如何促进LPP3介导的磷脂酸代谢和肾细胞癌进展。研究涉及RNA的m6Am修饰、磷脂酸代谢和线粒体分裂等科研热点。
研究关注肾细胞癌(RCC)的发病机制,特别是PCIF1介导的m6Am修饰对RCC进展的影响,以及通过LPP3调控磷脂酸代谢和线粒体分裂的作用机制。
研究逻辑清晰,从m6Am甲基转移酶PCIF1在RCC组织中的显著上调出发,通过增强LPP3 mRNA的翻译,调控磷脂酸代谢和线粒体分裂,促进RCC的进展。这个故事框架适合申请基金,特别是青年项目。
研究通过m6Am-Exo-Seq技术确定PCIF1的下游靶基因LPP3;使用RNA免疫共沉淀实验检测LPP3 mRNA上的m6Am修饰水平,通过多聚核糖体分析和新生蛋白质标记实验探究PCIF1对LPP3翻译的影响。此外,还研究了LPP3如何调控磷脂酸代谢和线粒体分裂,以及这些过程如何影响RCC的进展。
研究发现了PCIF1在RCC中的重要作用,以及如何通过调控LPP3影响磷脂酸代谢和线粒体分裂来促进RCC的进展。这些发现为理解RCC的发病机制和开发新的治疗策略提供了重要线索。
如题,今天介绍的文献是浙江大学医学院附属邵逸夫医院团队发表在
Advacnced Science
期刊上的研究:
m6Am Methyltransferase PCIF1 Promotes LPP3 Mediated
Phosphatidic Acid Metabolism and Renal Cell Carcinoma Progression
。
关注这项研究的主要原因有:
1.
研究关注了三个“科研热点”:
RNA
的
m6Am
修饰
、
磷脂酸代谢
和
线粒体分裂
;
m6A
是最常见的
RNA
甲基化修饰之一,主要发生在
mRNA
的
3'
非翻译区(
3'UTR
),
而
m6Am
则是一种相对较新发现的修饰,位于
mRNA
的转录起始位点,紧邻
7-
甲基鸟苷(
m7G
)帽子结构。
两者都是由特定的
“
写入者
”
(如
PCIF1
)添加到
RNA
上,并且可以被
“
擦除者
”
(如
FTO
)去除。这些修饰在调控
RNA
的稳定性、剪接、翻译和定位等方面
发挥重要作用(
国自然申请|研究“RNA修饰”的2种常见思路和4个关键要素,标书中如何体现逻辑严谨?
)。
2.
研究的逻辑非常清晰:
m6Am
甲基转移酶
PCIF1
在
RCC
组织中显著上调,并通过
m6Am
修饰增强磷脂磷酸酶
3
(
LPP3
)
mRNA
的翻译,进而调控
磷脂酸代谢
和
线粒体分裂
,促进
RCC
的进展。
因此这样的研究是完全可以模式化的,如果大家关注这些研究,基本上可以总结出一个很“套路”化的模式:“工具分子”
+
“功能分子”
+
“表型热点”,比如在这里“工具分子”是
PCIF1
,“功能分子”是磷脂酸代谢酶
LPP3
,“表型热点”是线粒体分裂,所以
10+
的高分文章也有套路和模式。
3.
从国自然的角度来说,
这样的故事框架非常适合申请基金,特别是青年项目
,当然出发点不同,
既可以从
m6A
到
6Am
,也可以从磷脂酸代谢、线粒体分裂出发。
下面我们通过问题来看研究内容:
1.
研究的主要疾病和研究角度是什么?
研究的主要疾病是肾细胞癌(
RCC
),研究角度集中在探索
PCIF1
介导的
m6Am
修饰对
RCC
进展的影响
,特别是其通过
LPP3
调控磷脂酸代谢和线粒体分裂的作用机制。
2.
研究如何选择
PCIF1
作为研究对象?
研究选择
PCIF1
作为研究对象是因为在
RCC
组织中观察到
PCIF1
和
m6Am
水平的显著上调,
这表明
PCIF1
可能在
RCC
的发病机制中扮演重要角色。此外,
PCIF1
作为
m6Am
修饰的“写入者”
,其功能在多种疾病中的研究还相对有限,尤其是在
RCC
中。
3.
在确定
PCIF1
的下游靶基因时,通过什么方法或者策略确定
LPP3
的?
在确定
PCIF1
的下游靶基因时,研究团队采用了
m6Am-Exo-Seq
技术,这是一种专门用于识别
m6Am
修饰的
RNA
测序技术
。通过这种方法,研究者能够鉴定出在
PCIF1
敲低后
m6Am
修饰水平发生变化的基因,从而确定
LPP3
作为
PCIF1
的关键下游靶基因。
4.
在具体机制上,如何确定
PCIF1
对
LPP3
的
m6Am
修饰,以及如何影响
LPP3
的翻译?
为了确定
PCIF1
对
LPP3
的
m6Am
修饰,研究者使用了
RNA
免疫共沉淀(
RIP
)实验
,结合抗
m6Am
抗体来检测
LPP3 mRNA
上的
m6Am
修饰水平。此外,通过
多聚核糖体分析和新生蛋白质标记实验
,研究者发现
PCIF1
敲低会抑制
LPP3
的翻译效率,而
PCIF1
过表达则增强了
LPP3
的翻译。
5.LPP3
是如何调控磷脂酸代谢的?
LPP3
调控磷脂酸代谢的方式是通过其磷脂磷酸酶的活性,
将磷脂酸(
PA
)去磷酸化生成二酰甘油(
DAG
)
。这一过程对于维持细胞内磷脂和三酰甘油的平衡合成至关重要。
6.
磷脂酸代谢是如何影响线粒体分裂的?
磷脂酸
PA
的积累可以抑制线粒体分裂,而
LPP3
的活性则有助于防止
PA
的积累,从而促进线粒体分裂
。线粒体分裂对于细胞能量代谢和质量控制非常重要。
7.
线粒体分裂与
RCC
是什么关系?
线粒体分裂与
RCC
的关系在于,
线粒体分裂的异常可以影响细胞的代谢状态和能量供应,促进
RCC
细胞的增殖和迁移
,从而加速了肿瘤的进展。