用DNAMAN软件，如何导出序列比对图

如果核酸序列或没有能用的二级结构文件怎么办？今天给大家介绍一下用DNAMAN软件 如何 导出序列比对图片。

DNAMAN可以用来进行核酸和蛋白的多序列比对 ，操作方便、简单。

1.把要参与比对的序列加载到不同通道中。方法见下图（ 当然，也可以将单个序列文件逐一加载到通道中 ）。注：打开文件的格式要改为“All Files”，点“否”载入的是蛋白序列。

2. 对导入的序列进行多序列比对，方法见下图，参数全部保持默认，点“下一步”就可以。

比对后的最终结果

3. 对每行序列显示的“字母”个数和着色方案进行自定义。点击Options，进入调整面板，在Preferences下对每行序列显示的“字母”数进行调整（ 下图粉色线框 ），也可以更改字体。本文保持默认，每行显示40个氨基酸残基。

4. 在Shading homology下，依据序列相似性水平为序列着色，点击“色块”即可进入自定义颜色窗口，这里选了 比较鲜艳明快的颜色，当然，大家也可以添加使用自己喜欢的颜色，如下图。