专栏名称: 小张聊科研
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申请国自然感觉文章还不够,时间紧怎么破?

小张聊科研  · 公众号  · 科研  · 2017-09-24 17:25

正文

明年申国自然想多发篇SCI,满打满算只有6个月了啊。。。。。。这种状态的小伙伴可不在少数,尤其医口的童鞋,临床科研基金三不误的人,毕竟是神一般的存在,像那些抓了临床就落了科研,照顾到了科研就耽误了临床的小伙伴,扎心了。

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Boss:明年申请国自然还差篇文章,你能搞定吗?

我:老板,现在只有6个月了,还要写作投稿,很紧张啊

Boss:你算算6*30*24等于多少?4320个小时!

我:这。。。

Boss:卓越需要1万小时,但发篇文章而已啊

我:boss,我懂了

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3个月写作投稿写标书,剩下最多3个月做实验?开玩笑,连研究哪个分子都不知道啊!那就只能一切从简了,看看下面这些生信文章,时间还是够用的,能多发一篇是一篇了。


(1)期刊:Mol Med Rep(IF=1.7)

文章名称:Classifierof cross talk genes predicts the prognosis of hepatocellular carcinoma

单位:二军大长海医院肿瘤科

期刊介绍:审稿时间3个月,年文章量1458,命中率66.8%

文章思路:GEO肝癌转录本芯片数据(GSE36376)→差异表达基因→BioGrid绘制PPI网络→筛选出200多个差异基因,集中在23个通路中→AKT1, SOS1, EGF, MYC, IGF1, ERBB2,CDKN1B, SHC2, VEGFA,INS预后分析显著相关性


(2)期刊:Cancer Cell International(IF=2.7)

文章名称:Aberrantly methylated‑differentially expressed genes and pathways in colorectal cancer

单位:中国医科大学附属第一医院肿瘤病因与筛查研究室

期刊介绍:审稿时间3个月,命中率52.5%

文章思路:下载,GEO中结直肠癌基因表达芯片、基因甲基化芯片数据组→GEO自带分析工具GEO2R→甲基化的差异基因筛选→生信工具DAVID对基因GO注释和功能富集→PPI网络绘制(STRING构建,Cytoscape美化可视化)→TCGA中再次验证基因

(3)期刊:Oncol Rep(IF=2.6)

文章名称:Cross-validationof genes potentially associated with overall survival and drug resistance inovarian cancer

单位:广西医科大,昆明医科大学附属第一医院妇产科

期刊介绍:审稿时间2.5个月,年文章量878,命中率52.5%  

文章思路:TCGA、GEO中1648个卵巢癌转录本芯片数据→11个差异表达基因→预后等临床信息分析→4个差异基因CKAP2, BCHE, CLDN10 ,OVGP1在耐药卵巢癌细胞株中验证→耐药基因之间的PPI网络绘制(STRING构建,Cytoscape美化可视化)


不说了,继续搬砖了。。。


文中提及的一些工具使用方法参考以下文章:


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