期待已久的蛋白质组原始数据上传protocol来了！！！

已经做了蛋白质组的，正在做蛋白质组的以及打算做蛋白质组的老师，看过来！只要申请一个账号，准备好要上传的文件，轻轻松松就可以完成。

目前使用较多的两个平台： iProX与ProteomeXchange（简称PX ），两个平台虽然在操作上会有所差别，但对数据的要求都是一样的。

iProX

1. 国内的上传蛋白质学质谱数据的存储平台

2. 包括数据上传系统和蛋白质组数据库。

3. 数据提交系统是在由ProteomeXchange协会制定的数据共享指导方针的指导下建立的。

4. 用户可以将自己的蛋白质组数据以公开模式或者私密模式上传

5. 公共蛋白质组数据是免费提供的

6. 更多的私有数据资源可以通过加入用户组获得

7. 因服务器在国内，国内研究者可以选择该平台进行数据提交

8. 数据上传的速度相对较快，不需要下载和安装软件

ProteomeXchange （简称PX）

1. 是一个上传蛋白质学质谱数据的存储平台

2. 旗下包括了PRIDE Archive, MassIVE, PeptideAtlas, and jPOST等平台

3. 研究者可以根据需要选择通过ProteomeXchange客户端直接上传原始数据或通过旗下平台进行上传。

今天就来分享一下iProX的上传方法吧。

系统需求：建议使用火狐浏览器

操作步骤:注册账号→登录账号→提交数据

登陆iProX网址，注册账号，网址链接：http://www.iprox.org

设置用户名和密码：进入网站主页，点击右上角“Register”按钮，按操作要求进行。

准确填写个人信息，确认无误后，点击“Submit”提交即可。

在你注册使用的邮箱会收到一封确认邮件，点击邮件中的链接激活账号

输入个人用户名、密码及验证码之后就可进入自己的账号了。

在这之前，创建一个新的project：

在主页菜单栏点击“project—New project”按钮即可创建成功；

或者点击“My Space”在右边的Project目录下点击“New Project+”。

在导航栏里你会看到要完成数据上传，需要四步：Add New Project、Add New Subproject、Upload Data File、Submit

接下来就只需要按照系统出现的提示一步一步填写相应的信息就可以了。

Add New Project：主要填写主项目课题、个人信息、研究单位三方面信息，还有重要的一点是公开水平（Access level），有三个选项，你可以选择“Public”公开、“Plan to public”计划公开（在后面提示的日期栏选择将要公开的日期）、“Private”保密。 其他可以根据具体情况选择填与不填。

Add New Subproject：主要填写子课题、物种信息、质谱仪器三方面信息，其他为选填。

Upload Data File：上传文件，到了最重要的时刻了。