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最新微生物组学合作客户高分文章分享

基迪奥生物 · 公众号 · · 2024-09-15 11:00

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最近我们为收集整理了很多组学项目文章集锦专题，如下，感兴趣可以点击标题查看。

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基迪奥的组学服务口碑一直在线，除了单细胞转录组、空间转录组、转录组、代谢组等产品服务有大量的高分文章产出，在微生物组学上也有很多高分文章产出！下面我们分享几篇最新的基迪奥16S项目文章案例，研究样本有小鼠粪便、污水、堆肥、土壤等，希望可以给大家提供一些参考。

案例1

膳食纤维通过产酸拟杆菌和随后的氨解毒减轻酒精性肝损伤

英文标题： Dietary fiber alleviates alcoholic liver injury via Bacteroides acidifaciens and subsequent ammonia detoxification

发表期刊： Cell Host & Microbe

发表时间： 2024.08.14

产品服务： Meta 16s, 代谢组, DIA

客户单位： 安徽医科大学第一附属医院

影响因子： 2 0.6

物种样本： 小鼠粪便、肝脏、血清

DOI： 10.1016/j.chom.2024.06.008

肠道菌群与多种慢性肝病，如酒精性肝病（ALD）、代谢功能障碍相关性脂肪性肝病（MASLD）和肝硬化，之间存在关联。肠道菌群通过多种途径影响各种肝脏疾病的发生和发展，包括物质和能量代谢的改变以及免疫反应的激活机制。膳食纤维已被确定为肠道菌群组成和功能的关键决定因素，研究表明可溶性膳食纤维通过肠道菌群改善小鼠的肝脏缺血再灌注损伤，并抑制MASLD的发生。研究膳食纤维摄入是否可以通过改变肠道菌群来改变ALD的进展，具有重要的意义。

图1. B.acidifaciens 促进ALD小鼠肝脏中OAT水平的增加

案例2

磷脂酰丝氨酸改善衰老脓毒症存活率并调节肠道菌群

英文标题： Phosphatidylserine improves aging sepsis survival, modulates gut microbiome, and prevents sepsis-associated encephalopathy

发表期刊： Biomedicine & Pharmacotherapy

发表时间： 2024.07.24

产品服务： Meta 16s

客户单位： 上海市同仁医院

影响因子： 6.9

物种样本： 小鼠粪便

DOI： 10.1016/j.biopha.2024.117200

本研究使用雄性C57BL/6J小鼠模型，将其分为对照组（仅接受盐水注射）；脓毒症组（接受LPS注射）；磷脂酰丝氨酸(PS)+脓毒症组（接受LPS注射前，每三天注射一次磷脂酰丝氨酸）。在LPS注射60天后，从以上三组小鼠收集粪便样本，进行16SrDNA测序。结果发现PS改变了肠道菌群的β多样性；PCoA和NMDS分析显示，与未经治疗的脓毒症组相比，PS预处理组的肠道菌群组成存在显著差异，表明PS改变了肠道菌群的种类和比例。本文旨在探索磷脂酰丝氨酸在改善脓毒症和脓毒症相关脑病(SAE)预后方面的潜力。

图2. 小鼠的肠道微生物谱分析

案例3

16S测序揭示细菌-藻类生物膜共生体系在煤化工废水酚类物质降解中的关键作用

英文标题： Which biofilm reactor is suitable for degradation of 2,4-dimethylphenol, focusing on bacteria, algae, or a combination of bacteria-algae?

发表期刊： Journal of Hazardous Materials

发表时间： 2024.08.12

产品服务： Meta 16s

客户单位： 南京信息工程大学

影响因子： 12.2

物种样本： 污水

DOI： 10.1016/j.jhazmat.2024.135492

煤化工废水污染严重，酚类物质难以处理，传统方法效率有限且难以资源化。本研究从四种不同的反应器（活性污泥反应器、细菌生物膜反应器、藻类生物膜反应器以及细菌-藻类生物膜反应器）中各采集一个生物膜样本进行16S rRNA基因的高通量测序。从藻类生物膜反应器和细菌-藻类生物膜反应器中各采集一个藻类样本进行18S rRNA基因的高通量测序。文章旨在评估细菌-藻类生物膜反应器在处理酚类物质和NH4+-N方面的优势，探究其内部环境和微生物群落结构，阐明协同作用机制，为煤化工废水处理提供新的思路。

图3.细菌的群落结构组成

案例4

16S测序揭示不同施肥处理对微生物群落结构的影响

英文标题： Improving the value of planting and breeding waste compost in agricultural applications: A zucchini cultivation case and circular agricultural models analysis

发表期刊： Chemical Engineering Journal

发表时间： 2024.07.14

产品服务： Meta 16s

客户单位： 甘肃农业大学

影响因子： 13.3

物种样本： 堆肥

DOI： 10.1016/j.cej.2024.153984

本研究使用西葫芦作为作物模型，化学肥料和按照特定比例混合的堆肥原料（羊粪、尾菜、玉米秸秆）作为处理材料。通过两年的连续实验，研究了不同施肥处理对作物和土壤的影响。通过构建和优化“夏玉米-温室西葫芦-肥羊”的循环农业模型，进一步提高了氮、磷、钾的循环利用率，并增加了净能量产出比，显示出显著的经济和环境效益。

图4.不同类群中优势细菌的相对丰度

案例5

高酸度影响复合有机填料人工湿地处理酸性矿山废水性能

英文标题： High acidity notably influences acid mine drainage treatment performance in constructed wetlands packed with composite organic substrates by affecting both abiotic and biotic routes

发表期刊： Chemical Engineering Journal

发表时间： 2024.07.07

产品服务： Meta 16s

客户单位： 云南大学

影响因子： 13.3

物种样本： 湿地微生态系统

DOI： 10.1016/j.cej.2024.153836

本研究评估进水pH值对复合有机填料人工湿地处理酸性矿山废水性能的影响，揭示酸性矿山废水pH值对人工湿地处理性能影响的机制，确定人工湿地处理酸性矿山废水的最佳pH范围。复合有机填料人工湿地可以有效处理酸性矿山废水，但其性能受到进水pH值的显著影响。硫酸盐还原菌和有机物降解菌等关键微生物类群在酸性矿山废水生物修复过程中起着重要作用，需要进一步研究其生态功能和调控机制。

图5. CWs中生物炭基质中的细菌群落组成

案例6

盐度波动对高低核酸含量细菌多样性和生态功能的影响

英文标题： Metagenomics analysis reveals effects of salinity fluctuation on diversity and ecological functions of high and low nucleic acid content bacteria

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