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来呀~套路呀~我们来瞎看circRNA的文献吧！

实验万事屋 · 公众号 · 科研 · 2017-04-28 08:02

正文

这个世界上有很多路，在这种路上，即使是盲人，都能走得很顺，这种不用肉眼就能上路的路叫做套路。

一般的文章套路，基本上都是这样的：

首先挖数据，然后做验证

接着拉关系，最后吹牛B

今天就带你不用肉眼来看瞎这篇文献：

这是发表在Oncotarget上的文章，从现在起，你要谨记文章的套路了。“首先挖数据，然后做验证，接着拉关系，最后吹牛B”。于是他们首先自己做了个芯片，没错，是circRNA芯片：

他们在芯片中分析出了高表达的circRNA。接着，按照套路“首先挖数据，然后做验证，接着拉关系，最后吹牛B”，那第二步就应该是做验证，也就是把挖到的这个高表达的基因给验证一下。验证两点，第一是这玩意到底是不是circRNA，第二是验证这玩意是不是肿瘤中高表达：

他们还做了个ROC曲线来花样证明这个circRNA是关键：

蓝后，没错，“首先挖数据，然后做验证，接着拉关系，最后吹牛B”。接着是拉关系circRNA最简单的关系，就是作为MiRNA的吸附物。他们的自费芯片里，自带MiRNA分析软件的：

当然，没有这么高级的，我们也能分析哈，首先在circBASE上找到这个circRNA：

蓝后，找到对应的NCBI上的序列：

Bia到miRDB上去，随便一搜（为啥要用序列搜？因为TargetScan用的是3'UTR）：

就搜到这么多：

当然，不费事的话，还可以用MiRwalk（不过不好用，如果你只熟悉老版MiRwalk的话）：

也能搜到：

好了，然后就到了“首先挖数据，然后做验证，接着拉关系，最后吹牛B”的最后一步了，对，就是要吹牛B了。这就需要作者灵活应用了，要证明这circRNA调控了miRNA后，会达到什么样的效果。这种时候，必须要扯上这些MiRNA的功能才行：

就是把这些MiRNA做了一个GO分析，Pathway分析什么的，说明，这些miRNA都是很关键的，很厉害的，差不多就是导致肝癌的关键因素了。估计说的我自己都要信了。ps：他们用的是这个：

好了，大概的套路“首先挖数据，然后做验证，接着拉关系，最后吹牛B”走完一遍，是不是你也有所感悟呢？没感悟也不要紧，就是想给你们洗洗脑……就这样吧……

…华丽丽的分割线…

李莫愁博士：“首先挖数据，然后做验证，接着拉关系，最后吹牛B” 多看看文献才是关键，当你多看了很多文献，就能发现…………这些套路………………………………可能对你也并没有任何帮助。

延伸阅读：

新入学的研究生们颤抖吧，环状rna归你们了