专栏名称: 生物极客
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干细胞都去哪儿了?新技术直接最终单细胞层次追踪干细胞发育历程

生物极客  · 公众号  · 生物  · 2017-10-09 23:37

正文

在发育生物学中,最难回答的就是如何最终发育成如此斑斓的各种细胞,在各种细胞发育的过程,究竟是怎样的一个历程?

来自德国的科学家们,近期在Nature发表文章,通过使用基于Cre-LoxP的系统,创造了细胞分化追踪的新技术,最终利用这项技术,揭示了造血干细胞发育过程传统观点的问题。

cre是识别Loxp位点的重组酶,当两个Loxp位点同向时候,可以引起中间片段的删除,当反向时候, 能够引起颠倒,科学家们思考,如果有很多loxp位点,那么如果当cre酶瞬间表达,是否可以引发复杂的反应?

最终这种模式将导致许许多多的不同的序列产生,最终通过这些序列则可以推测细胞命运。

Rodewald说:“一开始,没有人会相信这会有所作为,因为Cre被认为在所有可用的loxP位点上完全反应。团队的直觉很正确,他们发现,当Cre弱或短暂表达时,Creo介导的Polylox基因座的重组是不完整的,并且可能导致生成180万个独特的条形码。然而,个别条形码的效用因频率而异。 “你得到一些条形码比别人更频繁,”Rodewald解释说。海德堡大学的托马斯·霍夫(ThomasHöfer)的小组与罗德瓦尔德(Rodewald)及其同事一起,在计算上和实验上都讨论了这个问题。他们确定某些条形码的生成概率很低,这些条形码通常不会在不同的实验中共享,因此在命运映射实验中具有高度的信息。


Rodewald及其同事将Polylox命运映射应用于小鼠造血系统。 Rodewald说:“我已经尝试了很多年以接近生理学。他认为目前使用的涉及造血干细胞的离体操作和随后的移植到被照射的小鼠中的测定是非常人为的。 “通过”移植方法,你清空系统...然后你必须重新开始,“罗德瓦尔德说。使用Polylox系统,这些干细胞的命运可以在稳态条件下进行研究,导致与移植实验不同的结果。例如,在稳态条件下,Rodewald和Höfer小组在早期的一项研究中发现,许多干细胞有助于系统的补充,但单个细胞贡献很小。







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