TCGA及其他公共数据库（SEER、METABRIC）挖掘与应用研讨班
玮瑜主办
2017
年
7
月
8
日
-9
日（周六日）
北京
课程简介
随着大数据时代的到来，各种生物医学公共数据库井喷式涌现，其中就包括癌症领域熟为人知的癌症基因组图谱
TCGA
数据库。
TCGA
为肿瘤基础医学和转化医学研究者提供了海量的基因组数据和与其关联的临床数据，为挖掘有意义的基因组变化和发现影响肿瘤起始、发展、转移等生物学机制提供了海量数据。此外，其他诸多公共数据库（
SEER
、
METABRIC
）也为肿瘤研究者提供了绝佳的基础和临床数据宝藏。
然而，传统的基础医学和转化医学研究者缺乏信息学基础来处理大规模癌症数据，因而在面对这些极有价值的组学和临床数据时，往往心有余而力不足。作为医学信息领域研究者，我们需要将信息学和统计学知识运用到癌症基因组学数据分析的研究当中，构建连接大数据与基础医学研究者之间的纽带，帮助研究者去更好地挖掘探索这些数据。
课程内容、目标与特色
本次培训提供了一次系统了解
TCGA
、
SEER
、
METABRIC
等数据产生、糅合、分析及挖掘的课程
,
使基础医学和转化医学研究者能更好地挖掘
TCGA
多组学数据，以便为自身科研项目服务。
本次培训涵盖拟解决的问题包括：
1
、如何基于
TCGA
及其他公共数据库（
SEER
、
METABRIC
）设计课题；
2
、
TCGA
各组学数据及其他公共数据下载；
2
、获取数据后如何分析。
考虑到传统的基础医学和转化医学研究者缺乏利用公共数据库进行数据挖掘的经验本次学习班采用傻瓜实用式教学法，理论培训结合上机实战，与各位学员共同探讨如何利用大规模公共癌症数据助力科研。
授课老师
本次主讲老师是来自三甲医院临床医生和科研工作者，有着丰富的临床和转化研究经验，已发表主流
SCI
论文
30
余篇，其中成功用
TCGA
、
SEER
等数据库发表十几篇
SCI
，平均
4-5
分一篇。。
课程设置
第一天上午：
TCGA
数据库入门
1.
TCGA
数据库基本概念介绍及数据获取
2.
几篇基于
TCGA
数据库发表文章的深度解析
3.
上机实战：
TCGA
数据如何获取
4.
基于
TCGA
数据库课题设计讨论
第一天下午：组学研究课题设计与常用统计方法
1.
高通量测序与组学研究入门
2.
精准医学时代的肿瘤组学研究介绍
3.
实用科研统计方法介绍
4.
上机实战：实用科研统计方法实战
第二天上午：
TCGA
数据深度挖掘
1.
如何利用
TCGA
进行数据挖掘及临床转化课题设计
2.
上机实战：基于
TCGA
数据处理和分析实战
第二天下午：其他公共数据库（
SEER
、
METABRIC
）
1.
SEER
数据库入门（软件安装、数据获取、数据检索）
2.
几篇基于
SEER
数据库发表文章的深度解析
4.
如何利用
METABRIC
数据库进行数据挖掘及课题设计
3.
上机实战：
SEER
数据库、
METABRIC
数据库数据处理和分析
4.
TCGA
数据库及其他公共数据库（
SEER
、
METABRIC
）相互比较
备注：
自带笔记本电脑，安装
WINDOWS
操作系统，需要
SPSS
、
GraphPadPrism 5
、以及
Office Excel 2007
等软件。
主办单位
上海玮瑜生物科技有限公司
时间地点
会务时间：
2017
年
7
月
8
日
-9
日
7
日报到
会务地点：宝林轩国际大酒店（北京西站南路
