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原以为我博士生导师对高分文章看淡了,看了这复旦大学的27.8分Treg细胞的Nature子刊,我觉得他只是花钱舍不得……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2024-12-23 08:20

主要观点总结

本文介绍了复旦大学生命科学学院周兆才、焦石团队发表在Nature子刊Nat Immunol上的研究,该研究围绕抑制微环境中的Treg免疫抑制细胞展开。通过特定的抑制剂抑制p97-Npl4相互作用,影响微环境中免疫细胞的抗肿瘤能力。文章详细阐述了研究过程、实验结果及机制。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景及目的

随着微环境相关高分文章的增多,研究者开始关注微环境中免疫细胞的作用。本文旨在通过抑制p97-Npl4相互作用,影响微环境中免疫细胞的抗肿瘤能力。

关键观点2: 研究方法和过程

研究团队使用复旦大学生命科学学院周兆才、焦石团队的研究方法,通过筛选p97-Npl4结合的抑制剂TB(溴化铵),来探究其对抗肿瘤的作用机制。他们通过单细胞测序分析,发现TB处理会影响Th细胞分化平衡,特别是Th17和Treg细胞的分化。

关键观点3: 实验结果

研究发现,TB处理可以打破Th17-Treg细胞在微环境中的平衡,减少Treg细胞的数量,增强CD8+ T细胞的抗肿瘤能力。此外,TB对移植瘤小鼠模型中的肿瘤生长有明显的抑制作用。

关键观点4: 机制探讨

研究进一步探讨了TB影响T细胞免疫的机制。发现TB通过激活JAK-STAT信号通路促进Th17细胞分化,从而抑制Treg细胞分化。此外,p97–Npl4结合促进STAT3泛素化,这一现象在p97–Npl4结合突变后被抑制。

关键观点5: 总结和展望

本文的研究为肿瘤免疫治疗提供了新的思路和方法。通过抑制p97-Npl4相互作用,可以调节微环境中免疫细胞的抗肿瘤能力。未来可以进一步探讨其他类型的抑制剂是否也可以达到类似的效果,以及在其他疾病中的潜在应用。


正文

原以为我博士生导师对高分文章看淡了,但看多了微环境相关的高分文章,我越来越觉得可能是我老板不舍得花钱。抑制微环境中的Treg免疫抑制细胞,其实也算是微环境研究中的一个热点。而通过特定的抑制剂来进行抑制,算是比较有意思的了。今天这篇文章是复旦大学生命科学学院周兆才、焦石团队,发表在27.8分的Nature大子刊Nat Immunol上的文章。他们研究了抑制特定靶点的抑制剂,通过靶向p97-Npl4相互作用(这里其实很有意思,他们并没有去直接抑制p97,而是通过抑制p97-Npl4相互作用,这其实和他们提出的假设有关,他们在初期提出的假设就围绕着p97本身的功能,而不是p97本身,不清楚假设如何提出的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》,抑制Treg的分化,我们就来看看他们都做了点什么吧:



p97是一种ATP酶,现有研究已经将p97作为了一种抗肿瘤药物的靶点,而p97在免疫细胞中是否发挥作用也并不清楚,他们想从p97对于免疫细胞影响作为突破口,提出新的假设(假设的提出,其实就是根据之前已有的信息,提出新的可以验证,可以证伪的新的思路,不清楚假设提出的话,可以看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》)。同时由于之前对于p97的抑制剂,都是针对p97的ATP酶活性。p97会和Npl4结合,而他们想要找一种更具有靶向选择性的p97抑制剂,也就可以阻断p97与Npl4的结合。通过p97与Npl4的结合位点氨基酸残基的分析,他们筛选出了可以阻止p97与Npl4结合的化合物TB(溴化铵):



有意思的是比起传统的抑制p97的ATP酶活性的抑制剂,TB对于p97-Npl4结合的抑制,似乎能更有效抑制移植瘤小鼠模型中的肿瘤生长。所以他们假设可能TB对于p97-Npl4结合的抑制,可以同时影响微环境中免疫细胞的抗肿瘤能力。于是对使用TB后的移植瘤小鼠模型,进行了单细胞测序(下图中的UMAP图和热图大家应该都能看懂了吧,UMAP图就是单细胞测序的结果,通过不同基因表达作为主成因,并降维分析,确定不同的细胞簇,热图则显示基因表达的情况,不清楚的话,可以去看看《夏老师带你读文献》和《列文虎克读文献》)。结果发现,TB处理后,小鼠体内CD8+ T细胞的抗肿瘤能力明显增强了:



那么TB对于肿瘤免疫微环境的作用,具体是什么呢?他们发现TB在野生型小鼠中显示出比裸鼠高得多的抗肿瘤功效,而传统的抑制ATP酶活性的p97抑制剂则并没有什么区别。这也坐实了p97-Npl4的结合对于免疫细胞的作用。而给免疫缺陷小鼠,重新注入CD3+T细胞(这一步其实就是柯霍氏法则的验证,通过将缺失的T细胞移入,可以恢复原有表型,不清楚柯霍氏法则的话,可以去看看《轻松的文献导读》和《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》),则能显著增强TB对肿瘤的抑制作用。也就是说TB的抗肿瘤作用,取决于T细胞免疫:



那TB是如何影响T细胞免疫的呢?他们还是通过单细胞测序分析,发现了TB在抑制p97-Npl4的结合,会导致Th细胞的分化产生微妙的变化,这一个变化主要是体现在Th17和Treg细胞的分化上。之前其实讲Th细胞分化的时候,就介绍过同样的CD4+ 幼稚T细胞,会通过激活TCR以及JAK-STAT信号通路,从而分化出Th17细胞;而通过TCR和TGFβ信号通路,则会分化形成免疫抑制的Treg细胞(TCR信号通路、JAK-STAT信号通路和TGFβ信号通路,都是在T细胞分化和激活过程中比较重要的信号通路,在微环境研究中也十分的常见,如果还不清楚这些信号通路的话,可以去看看《信号通路是什么鬼?》系列复习下)。他们发现,使用TB抑制p97-Npl4的结合,会打破Th17-Treg细胞在微环境中的平衡,减少Treg细胞的数量:



而TB处理,对于Th17-Treg细胞平衡的打破之外,并不会对其他的微环境中的免疫细胞产生影响:



通过流式进行验证后发现,使用TB抑制阻断了p97-Npl4的结合之后,也可以有效抑制Treg细胞的浸润。而单细胞测序的数据进行深入分析后发现,TB可以使得STAT3、RORa 和 RORγt的表达显著上调,这也就是说TB可能会通过激活JAK-STAT信号通路,促进Th17细胞分化,从而抑制Treg细胞分化产生:



那么p97-Npl4的结合是如何影响JAK-STAT信号通路的呢?他们发现,p97敲除显着降低了STAT3的泛素化水平。这种泛素化会被野生型的p97挽救,而p97-Npl4的结合突变的p97则无法挽救这一现象(这里通过对于p97-Npl4的结合位点突变,进行分析,更好地排除了p97其他功能造成的影响,通过这样的点对点分析,可以优效避免肯定后件的逻辑谬误,不清楚肯定后件逻辑谬误的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列)。之前的研究表明,PDLIM2是STAT3的E3连接酶,也就是负责对STAT3进行泛素化并促进其泛素化降解的。而p97–Npl4形成复合物后,会促进PDLIM2/PDLIM5介导的STAT3泛素化,这一现象在p97–Npl4结合突变后被抑制:



这篇文章,从筛选p97–Npl4结合抑制剂开始,逐步推进,到p97–Npl4结合抑制后,影响的免疫细胞微环境。再通过单细胞测序数据,推进到TB抑制p97–Npl4结合对于Th17-Treg细胞分化平衡的破坏。最后对其具体分化的变化机制,进行了验证:



这篇文章的每一步做得都非常扎实,这些验证估计也都花了不老少钱,看着都肉疼。好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话可以看看原文,祝你们心明眼亮。


公众号回复“公克”,没事可以翻翻精华帖,里面有不少宝藏工具,当作是科研过程中的一种调剂也是不错的选择哦科研并不一定要这么无聊又尴尬




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