本文介绍了复旦大学生命科学学院周兆才、焦石团队发表在Nature子刊Nat Immunol上的研究,该研究围绕抑制微环境中的Treg免疫抑制细胞展开。通过特定的抑制剂抑制p97-Npl4相互作用,影响微环境中免疫细胞的抗肿瘤能力。文章详细阐述了研究过程、实验结果及机制。
随着微环境相关高分文章的增多,研究者开始关注微环境中免疫细胞的作用。本文旨在通过抑制p97-Npl4相互作用,影响微环境中免疫细胞的抗肿瘤能力。
研究团队使用复旦大学生命科学学院周兆才、焦石团队的研究方法,通过筛选p97-Npl4结合的抑制剂TB(溴化铵),来探究其对抗肿瘤的作用机制。他们通过单细胞测序分析,发现TB处理会影响Th细胞分化平衡,特别是Th17和Treg细胞的分化。
研究发现,TB处理可以打破Th17-Treg细胞在微环境中的平衡,减少Treg细胞的数量,增强CD8+ T细胞的抗肿瘤能力。此外,TB对移植瘤小鼠模型中的肿瘤生长有明显的抑制作用。
研究进一步探讨了TB影响T细胞免疫的机制。发现TB通过激活JAK-STAT信号通路促进Th17细胞分化,从而抑制Treg细胞分化。此外,p97–Npl4结合促进STAT3泛素化,这一现象在p97–Npl4结合突变后被抑制。
本文的研究为肿瘤免疫治疗提供了新的思路和方法。通过抑制p97-Npl4相互作用,可以调节微环境中免疫细胞的抗肿瘤能力。未来可以进一步探讨其他类型的抑制剂是否也可以达到类似的效果,以及在其他疾病中的潜在应用。
原以为我博士生导师对高分文章看淡了,但看多了微环境相关的高分文章,我越来越觉得可能是我老板不舍得花钱。抑制微环境中的Treg免疫抑制细胞,其实也算是微环境研究中的一个热点。而通过特定的抑制剂来进行抑制,算是比较有意思的了。今天这篇文章是复旦大学生命科学学院周兆才、焦石团队,发表在27.8分的Nature大子刊Nat Immunol上的文章。他们研究了抑制特定靶点的抑制剂,通过靶向p97-Npl4相互作用(这里其实很有意思,他们并没有去直接抑制p97,而是通过抑制p97-Npl4相互作用,这其实和他们提出的假设有关,他们在初期提出的假设就围绕着p97本身的功能,而不是p97本身,不清楚假设如何提出的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》),抑制Treg的分化,我们就来看看他们都做了点什么吧:
p97是一种ATP酶,现有研究已经将p97作为了一种抗肿瘤药物的靶点,而p97在免疫细胞中是否发挥作用也并不清楚,他们想从p97对于免疫细胞影响作为突破口,提出新的假设(假设的提出,其实就是根据之前已有的信息,提出新的可以验证,可以证伪的新的思路,不清楚假设提出的话,可以看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》)。同时由于之前对于p97的抑制剂,都是针对p97的ATP酶活性。p97会和Npl4结合,而他们想要找一种更具有靶向选择性的p97抑制剂,也就可以阻断p97与Npl4的结合。通过p97与Npl4的结合位点氨基酸残基的分析,他们筛选出了可以阻止p97与Npl4结合的化合物TB(溴化铵):
有意思的是比起传统的抑制p97的ATP酶活性的抑制剂,TB对于p97-Npl4结合的抑制,似乎能更有效抑制移植瘤小鼠模型中的肿瘤生长。所以他们假设可能TB对于p97-Npl4结合的抑制,可以同时影响微环境中免疫细胞的抗肿瘤能力。于是对使用TB后的移植瘤小鼠模型,进行了单细胞测序(下图中的UMAP图和热图大家应该都能看懂了吧,UMAP图就是单细胞测序的结果,通过不同基因表达作为主成因,并降维分析,确定不同的细胞簇,热图则显示基因表达的情况,不清楚的话,可以去看看《夏老师带你读文献》和《列文虎克读文献》)。结果发现,TB处理后,小鼠体内CD8+ T细胞的抗肿瘤能力明显增强了:
那么TB对于肿瘤免疫微环境的作用,具体是什么呢?他们发现TB在野生型小鼠中显示出比裸鼠高得多的抗肿瘤功效,而传统的抑制ATP酶活性的p97抑制剂则并没有什么区别。这也坐实了p97-Npl4的结合对于免疫细胞的作用。而给免疫缺陷小鼠,重新注入CD3+T细胞(这一步其实就是柯霍氏法则的验证,通过将缺失的T细胞移入,可以恢复原有表型,不清楚柯霍氏法则的话,可以去看看《轻松的文献导读》和《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》),则能显著增强TB对肿瘤的抑制作用。也就是说TB的抗肿瘤作用,取决于T细胞免疫:
那TB是如何影响T细胞免疫的呢?他们还是通过单细胞测序分析,发现了TB在抑制p97-Npl4的结合,会导致Th细胞的分化产生微妙的变化,这一个变化主要是体现在Th17和Treg细胞的分化上。之前其实讲Th细胞分化的时候,就介绍过同样的CD4+ 幼稚T细胞,会通过激活TCR以及JAK-STAT信号通路,从而分化出Th17细胞;而通过TCR和TGFβ信号通路,则会分化形成免疫抑制的Treg细胞(TCR信号通路、JAK-STAT信号通路和TGFβ信号通路,都是在T细胞分化和激活过程中比较重要的信号通路,在微环境研究中也十分的常见,如果还不清楚这些信号通路的话,可以去看看《信号通路是什么鬼?》系列复习下)。他们发现,使用TB抑制p97-Npl4的结合,会打破Th17-Treg细胞在微环境中的平衡,减少Treg细胞的数量:
而TB处理,对于Th17-Treg细胞平衡的打破之外,并不会对其他的微环境中的免疫细胞产生影响:
通过流式进行验证后发现,使用TB抑制阻断了p97-Npl4的结合之后,也可以有效抑制Treg细胞的浸润。而单细胞测序的数据进行深入分析后发现,TB可以使得STAT3、RORa 和 RORγt的表达显著上调,这也就是说TB可能会通过激活JAK-STAT信号通路,促进Th17细胞分化,从而抑制Treg细胞分化产生:
那么p97-Npl4的结合是如何影响JAK-STAT信号通路的呢?他们发现,p97敲除显着降低了STAT3的泛素化水平。这种泛素化会被野生型的p97挽救,而p97-Npl4的结合突变的p97则无法挽救这一现象(这里通过对于p97-Npl4的结合位点突变,进行分析,更好地排除了p97其他功能造成的影响,通过这样的点对点分析,可以优效避免肯定后件的逻辑谬误,不清楚肯定后件逻辑谬误的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列)。之前的研究表明,PDLIM2是STAT3的E3连接酶,也就是负责对STAT3进行泛素化并促进其泛素化降解的。而p97–Npl4形成复合物后,会促进PDLIM2/PDLIM5介导的STAT3泛素化,这一现象在p97–Npl4结合突变后被抑制:
这篇文章,从筛选p97–Npl4结合抑制剂开始,逐步推进,到p97–Npl4结合抑制后,影响的免疫细胞微环境。再通过单细胞测序数据,推进到TB抑制p97–Npl4结合对于Th17-Treg细胞分化平衡的破坏。最后对其具体分化的变化机制,进行了验证:
这篇文章的每一步做得都非常扎实,这些验证估计也都花了不老少钱,看着都肉疼。好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话可以看看原文,祝你们心明眼亮。
公众号回复“公克”,没事可以翻翻精华帖,里面有不少宝藏工具,当作是科研过程中的一种调剂也是不错的选择哦,科研并不一定要这么无聊又尴尬:
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