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作者:阿甘(转载请注:解螺旋·医生科研助手)
我们实验室有句话口口相传:做上WB,走上不归路。WB难,磷酸化蛋白的WB就更难了。
我一共做了两百多次磷酸化的蛋白,但是出结果的只有六十几次,与理论预期相一致的只有四十多次,之前的几十次更是连磷酸化蛋白的影子都没见到。做了这么多失败的磷酸化蛋白WB,宝宝的心里苦呀!但宝宝不哭!
于是乎,我总结了一下我的操作经验,供大家在做磷酸化蛋白的时候参考,使大家的磷酸化蛋白之路顺利(其中最重要的东西已用蓝色标出)。
1.做磷酸化蛋白,磷酸酶抑制剂必不可少,若没有磷酸酶抑制剂,磷酸化蛋白很容易发生去磷酸化,轻者导致条带不明显,重者没有条带,从而导致实验重复性变差。下图就是加入磷酸酶抑制剂和不加磷酸酶抑制剂的区别(有图有真相,图1)。
图1. 加入磷酸酶抑制剂和不加入磷酸酶抑制剂的条带区别
2. 提蛋白一定全程要在4℃环境,尽量不要用超声波细胞破碎仪来粉碎细胞,低温高速离心机的转速不要超过14000rmp,时间不要超过10分钟,以5到8分钟为宜。得到的上清样品立即煮沸(最好用PCR仪煮沸)。所提取的蛋白样品一定要在两到三个星期之内全部做完。
3.凝胶电泳时,配置凝胶的试剂必须是两周之内新配制的,电泳缓冲液和转膜缓冲液必须现配现用,电泳时间不能超过2个小时。转膜完成后要用TBST缓冲液漂洗PVDF膜。
4.封闭液和抗体稀释液,最好选用3%或者5%的BSA溶液(具体浓度看抗体说明书)。不可以用牛奶去配制上述液体,因为牛奶里还有酪蛋白,可以促进蛋白质的去磷酸化,使磷酸化蛋白的条带变浅,甚至消失(用图说话,图2)。抗体尽量选用品牌抗体(Abcam,CST),一分钱一分货。
图2. BSA和脱脂奶粉封闭后的条带差别
想想当初,我的第一个磷酸化蛋白p-AKT做了好几十次都没出来,工作汇报时,分分钟被老板嫌弃的节奏,以至于我有点怀疑人生。后来随着操作细节的改进,我的磷酸化蛋白的WB成功率越来越高,老板对我的WB结果也越来越满意。苍天不负有心人,只要肯下功夫,多观察多思考,小白也会成为达人。最后,祝大家实验顺利,早日成为实验达人!