在美国化学会2025年春季会议（ACS）的“首次披露(
First-Time Disclosures
)”研讨会上，首次公开的 12 种临床候选药物(PCC)的化学结构，包括几款共价抑制剂和PROTAC。这些新分子可能治疗感染、癌症、神经系统疾病和心血管疾病。
Blacksmith Medicines
公司希望找到可以靶向金属酶的分子。大约三分之一的酶在其活性位点含有金属，因此这是一个丰富的药物发现领域。LpxC
是尿苷二磷酸-3-O-（羟基肉豆蔻酰）-N-乙酰氨基葡萄糖脱乙酰酶，是一种锌水解酶，特异性的存在于革兰氏阴性细菌中。靶向
LpxC特异性杀死革兰氏阴性菌可以对抗尿路感染，而不会杀死肠道中的有益细菌。
Blacksmith 利用生物无机化学驱动、基于片段的方法，发现了
FG-2101这种有效的纳摩尔级抑制剂。
FG-2101包含不同的金属结合基序：
3-羟基-2-嘧啶酮。
FG-2101选择性是其他细菌和人类金属酶的 >10,000 倍，覆盖病原菌谱范围广，并且
在动物模型中具有静脉注射和口服活性
。它避免了先前异羟肟酸盐 LpxC 抑制剂的毒性，并已完成 IND。
2. SMARCA2 PROTAC 降解剂：PRT3789（肿瘤）
Prelude Therapeutics 的第一代
SMARCA2 PROTAC 降解剂，特异性地降解 SMARCA2，但是需要静脉给药。以合成致死反式治疗 SMARCA4缺乏或发生突变的癌症。大约10%的非小细胞肺癌患者患有SMARCA4缺陷型肿瘤。
开发
SMARCA2抑制剂挑战是找到一种降解SMARCA2而不是SMARCA4的化合物，它也存在于一些非癌细胞中。
SMARCA2和SMARCA4非常保守，均存在一个类似的溴结构域，即介导与其他蛋白质相互作用的蛋白质区域。PRT3789连接子是一个手性甲基，Basch 及其同事认为这是引导降解剂构象的关键，因此它选择性地与SMARCA2和von Hippel-Lindau E3连接酶形成复合物，从而将SMARCA2送至蛋白质降解途径。PRT3789 目前正在与 Keytruda（帕博利珠单抗）联合用于具有 SMARCA4 突变的晚期、复发性或转移性实体瘤患者的 2 期临床试验 （NCT06682806）。
3. BCL6 PROTAC 降解剂：BMS-986458（肿瘤）
百时美施贵宝的 BMS-986458 靶向BCL6。BCL6是一种参与正常B细胞发育的蛋白质，但在B细胞癌(
B 细胞非霍奇金淋巴瘤)中其水平通常会升高。BCL6曾经被认为不可成药。
BMS-986458将BCL6 与 与E3泛素连接酶cereblon连接
，从而被降解。
该化合物表现出快速而深度的 BCL6 降解，与常见的 CRBN 底物相比具有高选择性，并且在体内具有很强的功效。口服给药在淋巴瘤模型中可实现强大的药效。此外，
BMS-986458具有三个立体中心，其中一个很容易产生差向异构。
这款可口服候选药物目前正在单独、并与抗淋巴瘤药物联合用于复发或难治性非霍奇金淋巴瘤患者中
进行1期临床试验 （NCT06090539）。
PLK4 (
polo 样激酶 4)是一种存在于某些类型肿瘤中的激酶。Repare Therapeutics的临床候选药物
RP-1664
的起点是活性本身较高的
Centrinone B。在细胞中，
Centrinone B 是PLK4的极好抑制剂
（Ki 值为 0.59 nM,
PMID-25931445）。问题是Centrinone B 代谢迅速且没有生物利用度。因此，Repare的科学家们优化了化合物的
ADME性质（吸收、分布、代谢和排泄），并进一步改进了效力。
尽管RP-1664和Centrinone B之间存在许多结构差异，但研究人员称，RP-1664中的
环丙基取代了Centrinone B中的甲氧基
，是该分子效力和选择性的关键。
RP-1664处于治疗晚期实体瘤的1期临床试验 （NCT06232408） 中。如果获得批准，它将是同类首创的药物。
5. PD-L1 大环肽抑制剂：BMS-986238（肿瘤）
百时美施贵宝的Paul M. Scola展示了本次会议最大的临床候选药物。BMS-986238 是该公司的第二代大环肽。第一代的大环肽 BMS-986189
，它抑制癌症免疫靶点 PD-L1，但在体内的半衰期较短。第二代大环肽
BMS-986238有低皮摩尔亲和力，长半衰期和可口服生物利用度。
为了改善大环肽的药代动力学，该公司的科学家决定在分子中添加一种脂肪酸，使其与血清白蛋白结合并延长其寿命。Wegovy和Zepbound等减肥药使用类似的策略来实现每周给药。研究人员发现，他们必须在脂肪酸和肽大环之间留出空间，因此聚乙二醇链将分子中的这些基团分开。Scola说，这是将肽大环转化为候选药物的良好的通用策略。
BMS-986238 可以通过皮下注射每周给药。通过制剂实现的口服给药是每天一次
。BMS-986238 最近完成了1期临床试验 （NCT06568458）。
6. OX2R 激动剂： ALKS 2680（
睡眠障碍）
发作性睡病是一种睡眠障碍，其特征是白天过度嗜睡，通常未被诊断出来。Alkermes 的临床候选药物ALKS2680靶向
2型食欲素受体（OX2R），它在人体的睡眠-觉醒周期中起着重要作用。
其他结合 OX2R 的分子呈C形，因此该公司
通过使用共价接头将这种C形构象锁定到位的大环
。Alkermes 公司的研究人员Brian Raymer称，
“当科学家们构建ALKS 2680 时，非常仔细的设计连接子至关重要”。通过
效力和药代动力学的多参数优化，ALKS 2680 可作为每日一次的口服剂量使用。
ALKS2680目前正处于多项临床试验中，包括 1 型发作性睡病 （NCT06358950） 的2期试验。
7. NKCC1选择性抑制剂：IAMA-6（
神经系统疾病）
钠-钾-氯协同转运蛋白 1 （NKCC1）与大脑中的氯离子失衡有关。该基因是某些神经系统疾病的标志物，包括自闭症谱系障碍、唐氏综合症和耐药性癫痫。
Iama Therapeutics 研究人员称，该项目的挑战在于设计一种不会同时影响NKCC2的分子，NKCC2是一种具有
利尿作用
的相关蛋白质。IAMA-6 完成这项任务，还可以穿透血脑屏障。在体内，IAMA-6 可恢复氯化物稳态，而没有较早期的 NKCC1 抑制剂（如 bumetanide） 的利尿副作用。
IAMA-6 在最近完成了1期临床试验 （NCT06300398）。IAMA-6 可能在2026年开始 2期临床试验。
8. EGFR/HER2 Ex20ins 不可逆抑制剂：ORIC-114（肿瘤）
EGFR 或HER2外显子20插入的非小细胞肺癌患者通常会在病程中发生脑转移。不幸的是，可用于治疗这些癌症的药物不会穿过血脑屏障。
Oric Pharmaceuticals的 Oric-114，是一种高度选择性的，脑部渗透剂，不可逆的 EGFR 和 HER2 外显子 20 插入的抑制剂。ORIC-114是一种通过与这些外显子20插入形成共价键来靶向这些插入突变的分子。
Oric Pharmaceuticals的研究人员
Anthony Romero
称 “当你第一次看到这个分子时，你不会认为这是大脑渗透剂”。但该公司已经在其1b 期临床试验 （NCT05315700） 中看到了早期临床的成功。
该分子表现出针对 CNS 肿瘤的临床前活性，包括那些具有非典型 EGFR 突变的临床前肿瘤，每天口服剂量在 NSCLC 模型中实现治疗活性。Romero 讲述了试验中一名55岁女性的故事，她有4个脑部病变，在用ORIC-114治疗一轮后消失，她的肺癌在两轮治疗后即出现反应。
9. FAP 共价抑制剂：AZD2389（MASH）
代谢功能障碍相关的脂肪性肝炎，也称为 MASH，是一种脂肪在肝脏中堆积的疾病。患有MASH的人可能会出现可能致命的肝纤维化。丝氨酸蛋白酶FAP(
成纤维细胞活化蛋白 )可能会促进这种纤维化。阿斯利康科学家开发了AZD2389，它通过分子的腈与蛋白质形成共价键来抑制 FAP。在 Cynomolgus Monkey 模型中，AZD2389 导致了纤维化的组织学改善，并进行了良好的耐受性
阿斯利康的Anneli Nordqvist表示，导致AZD2389的活动始于探索噻唑烷类化合物。
AZD2389 目前在肝纤维化和代偿期肝硬化患者中进行2期临床试验 （NCT06750276）。
10. PNPLA3
I148M突变共价抑制剂：PF-07853578（代谢疾病）
1-酰基甘油-3-磷酸 O-酰基转移酶 （PNPLA3） 在氨基酸148处携带异亮氨酸-蛋氨酸突变（
I148M）的患者易患更高水平的肝脏脂肪、肝脏炎症、肝硬化和肝癌。研究表明，这是因为这种酶突变体抑制了身体分解脂质的过程。
辉瑞开发的PF-07853578，通过与分子氨基甲酸酯基团与PNPLA3 I148M变体共价结合。这种共价相互作用导致从脂滴中去除致病蛋白质，并通过蛋白体诱导蛋白质降解。PF-07853578 已完成1期临床试验 （NCT05890105）。
11. Myosin 抑制剂：CK-4021586（
心力衰竭）
Cytokinetics 合成并测试了2,000 多种化合物，以寻找一种能够结合心脏肌原纤维 ATP 酶（
Myosin
，心脏中的一种运动蛋白）的分子。他们认为结合这种运动蛋白可以帮助射血分数保留 （HFpEF） 心力衰竭患者，这种疾病的特征是左心室在腔室充满血液期间无法充分放松。
CK-4021586具有一种不寻常的氮杂替丁氨基甲醛。CK-586 选择性地靶向肌球蛋白的调节轻链，从而降低收缩性过强的 HFpEF 亚群的收缩性。在发现 CK-4021586 的过程中克服了几个关键的开发障碍：包括谷胱甘肽反应性、活性代谢物形成和高流出等问题。该化合物目前处于2期临床试验 （NCT06793371）。
12. 凝血因子 FIIa 和 Xa 抑制剂：BAY 3389934（
凝血病）
当人们患上脓毒症（对扩散血液的感染的全身反应）时，他们可能会发展出一种影响血液凝固系统的疾病。这种疾病很难治疗，患上它的人通常会死亡。
通过阻断这些凝血因子，可能能够缓解与脓毒症相关的凝血病。尽管已经开发了针对这些凝血因子的其他候选药物，但大多数已经停产。
拜耳的临床候选药物BAY 3389934，是一种通过静脉给药的两种凝血因子（FIIa 和 FXa）的双重抑制剂。该静脉给药疗法还
采用代谢不稳定的酯设计，可快速清除，可严格控制重症监护环境中的抗凝活性。
BAY 3389934目前正处于1期临床试验 （NCT06854640），以评估其合适的剂量并研究它如何影响患有脓毒症诱导的凝血病的参与者。
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