正文
近日，
美国北卡罗来纳州立大学
谢德玉
教授团队发表了一篇题为“Docking characterization and in vitro inhibitory activity of flavan-3-ols and dimeric proanthocyanidins against the main protease activity of SARS-Cov-2”的研究论文。
该研究报道了利用新型冠状病毒的主蛋白酶（Mpro）来筛选植物黄烷-3-醇和原花青素。（-）-阿福豆素（AF）、（-）-表阿福豆素（EAF）、（+）-儿茶素（CA）、（-）-表儿茶素（EC）、（+）-没食子儿茶素（GC）、（-）-表没食子儿茶素（EGC）、（+）-儿茶素-3-O-没食子酸酯（CAG）、（-）-表儿茶素-3-O-没食子酸酯（ECG）、（-）-没食子儿茶素-3-O-没食子酸酯（GCG）、（-）-表没食子儿茶素-3-O-没食子酸酯（EGCG）、原矢车菊素A2（PA2）和原矢车菊素B2（PB2）十二种化合物被选择用来分子对接模拟实验。所得数据预测，12种代谢物均能够与Mpro结合。预测PA2和PB2的亲和力分值为-9.2，其次是ECG、GCG、EGCG和CAG，分值为-8.3至-8.7，然后是6个黄烷-3-醇糖苷配基，分值为-7.0至-7.7。分子对接特性预测，这些化合物通过不同的空间模式和形成1-4个氢键的方式与主蛋白酶结合口袋中的3或4个亚位（S1，S1'，S2和S4）相结合。对10种化合物进行体外分析结果表明，CAG、ECG、GCG、EGCG和PB2抑制Mpro活性，其IC50值分别为2.98±0.21、5.21±0.5、6.38±0.5、7.51±0.21和75.3±1.29 µM，而CA、EC、EGC、GC和PA2无抑制活性。为了进一步证实其抑制活性，利用来源于绿茶（GT）、两种圆叶葡萄（MG）、可可和黑巧克力（DC）的提取物进行抑制分析，这些提取物富含CAG、ECG、GAG、EGCG或/和PB2。结果表明，绿茶、两种圆叶葡萄、可可和黑巧克力提取物可抑制Mpro活性，其IC50值分别为2.84±0.25、29.54±0.41、29.93±0.83、153.3±47.3和256.39±66.3 µg/ml。
该研究结果表明，黄烷-3-醇的结构特征与亲和力分值密切相关，黄烷-3-醇的没食子酰化和寡聚类型对于抑制新型冠状病毒主蛋白酶的活性至关重要。
论文链接：
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2020.601316/abstract
