专栏名称: 智药邦
人工智能在药物研发领域的进展、探索与实践。
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获英伟达/三星投资,Generate创造出超100万种蛋白质,开发从头设计的生成式模型

智药邦  · 公众号  ·  · 2025-01-26 08:00

正文

蛋白质作为生命的“工作分子 ,其结构与功能研究需要耗费大量时间与资源,但 AI 技术的引入彻底改变了这一局面。通过深度学习模型,研究人员可以快速预测蛋白质的三维结构,还能设计功能性新型蛋白质,甚至揭示基因与疾病之间的隐藏关联。这一革命性突破,不仅吸引了全球资本的密切关注,也激发了众多初创企业在AI驱动的蛋白质科学领域展开竞争与合作。
在这场竞赛中,Generate: Biomedicines (以下简称:Generate)脱颖而出,成为AI蛋白质领域的佼佼者。这家成立于2018年的技术驱动型生物医药公司,其独特的可编程生物学平台,不仅将人工智能深度融入蛋白质工程,还帮助科学家针对传统难以成药的靶点设计出更高效的解决方案。
2024年12月18日,Generate再次引发行业瞩目,宣布获得来自三星科学生命基金的战略投资,尽管具体金额尚未披露,但其背后的意义不言而喻。值得一提的是,Generate 还入选了2024年度CNBC Disruptor 50的名单,成为AI蛋白质领域的一匹黑马。

Generate:Biomedicines 官网:

https://generatebiomedicines.com/

源于一份邮件,Generate公司诞生了

Generate由风投机构Flagship Pioneering孵化,总部位于美国马萨诸塞州。最初的两年间,Generate专注于可编程生物学的基础研究,其独特理念逐渐成型,并于2020年9月正式对外亮相

公司联合创始人Gevorg Grigoryan博士是一位专注于蛋白质结构与功能研究的计算生物学家。在创办Generate之前,他任职于达特茅斯学院,专注于蛋白质结构与功能的研究。
当时,他正在探索一个关于通过数据驱动方法设计治疗性蛋白质的创新理念,但对如何将这一科学构想转化为一家实际运作的企业感到困惑。为此,他翻出了自己在麻省理工学院攻读博士期间修读的创业课程的大纲,并决定给当时的授课导师Noubar Afeyan写一封邮件。彼时,Afeyan是Flagship Pioneering的联合创始人兼首席执行官,同时是全球生物科技创新领域的领军人物。

Generate联合创始人Gevorg Grigoryan博士
Grigoryan精心打磨了数小时的邮件,最终在凌晨发出。仅15分钟后,他便收到了Afeyan的回复。这次看似偶然的联系,为Generate的诞生奠定了基础。在 Afeyan 的指导下,Grigoryan的创意迅速得到支持,并吸引了更多科学家和投资者的加入。最终,Grigoryan、Afeyan和其他核心团队共同创立了Generate。
如今,Grigoryan担任公司的联合创始人兼首席技术官,另一位联合创始人则为Molly Gibson。值得一提的是,Molly也是Flagship Pioneering的创始合伙人。

Generate联合创始人Molly Gibson
自成立以来,Generate凭借其独特的技术平台和商业模式,深受资本市场青睐。

2020年9月,公司获得Flagship的5千万美元种子轮融资;2021年11月,完成3.7亿美元的B轮融资; 2023年9月,Generate再次完成超2.73亿美元的C轮融资 ,使累计投资额接近 7 亿美元。在此次融资中,英伟达、安进和未来资产等顶级机构纷纷加入,为Generate的项目发展提供了可靠的资金基础。

开发Chroma模型,设计具有治疗潜能的新型蛋白质分子

与传统制药公司不同, Generate的核心目标 不再是发现自然界中已经存在且具有治疗潜力的蛋白质,而 是专注于设计并生产自然界从未存在过的全新蛋白质 ,这些蛋白质具有潜在的治疗功能

为了实现这一目标,Generate构建了其专属的Generative平台。该平台采用“生成、构建、测量和学习 的循环模式,从靶标发现到治疗药物的设计,大幅提升了识别和验证的速度与效率。

Generative平台工作模式
在此平台上,Generate已成功创造超过一百万种自然界中未曾存在的蛋白质,并通过冷冻电镜和湿实验验证其功能。例如,Generate设计的绿色荧光蛋白 (GFP) 性能比以往提升了50倍。
这一研究方向在2023年11月迎来了重要突破,Generate在Nature上发表了一款名为Chroma的生成式AI模型。Chroma通过推断蛋白质序列、结构与功能之间的关系,为科学家提供了全新的设计工具。

实验显示,Chroma生成的蛋白质不仅具有良好的生物物理性质,还能通过体外与体内实验验证其治疗潜力,在临床前测试中表现出极高的稳定性和功能性。
更重要的是,为了加速生成式生物学的发展,Generate将Chroma模型开源。
Chroma模型开源地址:
https://github.com/generatebio/chroma

Generate认为,生成式生物学标志着药物开发由生成式AI驱动的根本性变革。这种方法突破了对自然界蛋白质的依赖,使科学家可以设计针对当下及未来治疗需求的全新分子,加速进入可编程药物时代,让药物研发变得更快、更便宜、更灵活,从而为全球患者带来更多希望。

与诺华/安进等顶级药企携手,搭建多个药物研发管线

除了在内部研发自己的产品之外,Generate并不囿于「闭门造车」,而是积极与全球领先药企以及生物技术巨头合作,以求共赢

2022年1月, Generate与安进达成了一项研究合作协议 ,针对5个临床靶点开发蛋白质疗法,作为研究合作的一部分,安进为此支付了5千万美元的前期资金,整个合作计划潜在交易总额高达19亿美元。此外,公司也在与 Roswell Park MD安德森癌症中心 等合作,以开发蛋白质和CAR-T疗法。
2024年9月, Generate宣布与诺华达成多靶点合作 ,共同开发横跨多疾病领域的蛋白质疗法。诺华向Generate支付了总计6,500万美元的预付款,其中1,500万美元用于购买 Generate 的股权。除了高达两位数的分级特许权使用费外,Generate还有资格获得诺华超过10亿美元的基于绩效的里程碑付款。

Generate搭建的管线

目前,Generate已搭建了丰富的管线,覆盖肿瘤、免疫相关疾病和传染病领域,其中2款候选药物已进入I期临床试验,包括针对哮喘的TSLP单抗GB-0895和用于Covid-19 PrEP的GB-0669。

写在最后







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