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中国学者一作兼通讯Cell论文:破解细菌新型免疫防御武器,专克超级病毒

精准药物  · 公众号  ·  · 2025-03-30 15:16

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撰文丨王聪

编辑丨王多鱼

排版丨水成文


在微观世界的生存博弈中, 噬菌体 (专门感染细菌的病毒) 与宿主 (细菌) 的对抗堪称进化史上的经典战争。 近年来发现的 ϕKZ 类巨型噬菌体 (基因组超过20万碱基对) ,更是将这场病毒-细菌“军备竞赛”推向新的维度:

核级防御:这类噬菌体感染后会构建类似细胞核的蛋白质结构,将自身基因组严密保护;

早期安全屋:在感染初期形成脂质囊泡,保护病毒基因进行早期转录;

多重免疫逃逸:对传统的 CRISPR 系统等防御机制几乎完全免疫。


面对这种“铜墙铁壁”般的防御体系, 宿主细菌究竟是如何对抗这种超级入侵者的?让科学家们困惑多年。


2025 年 3 月 19 日, 加州大学旧金山分校 Joseph Bondy-Denomy 副教授、北京化工大学 冯越 教授团队合作, 在国际顶尖学术期刊 Cell 上发表了题为: Jumbo phage killer immune system targets early infection of nucleus-forming phages 的研究论文。论文第一作者兼共同通讯作者 李玉萍 博士现为瑞士巴塞尔大学终身教轨助理教授。


该研究发现了细菌中首个针对 巨型噬菌体 (j umbo phage) 的防御系统—— jumbo phage killer (简称为 Juk ,并揭示了其工作机制,为细菌抗巨型噬菌体系统研究提供了新方向。


李玉萍 博士

李玉萍 博士,2011年本科毕业于华中科技大学,2019年博士毕业于斯坦福大学,此后在加州大学旧金山分校进行博士后研究工作,2024年10月加入瑞士巴塞尔大学,任终身教轨助理教授。 李玉萍博士获 得了 瑞士国家科学基金(SNSF)资助,用于探索噬菌体-细菌互作,以开发下一代噬菌体疗法。


Juk 系统:细菌的精准防御系统


研究团队通过对铜绿假单胞菌 PA 14 菌株的基因筛查,意外发现了两个关键基因—— jukA jukB 。这套系统展现出令人惊叹的防御特性:

  • 精准识别:只攻击 ϕKZ 家族噬菌体,对 25 种其他噬菌体“视而不见”;

  • 非自杀防御:清除入侵噬菌体后,细菌能继续正常分裂 (与传统自杀式防御截然不同)

  • 高效拦截:在感染后 5 分钟内即可瓦解噬菌体的防御体系。


实验数据显示,装备 Juk 系统的细菌在遭遇噬菌体攻击时,防御成功率提升超过百万倍。


Juk 如何实现精准打击?


通过荧光标记和超高分辨率成像,研究团队揭开了 Juk 系统的分子机制:


1、雷达锁定:JukA 蛋白如同预警雷达,通过识别噬菌体早期分泌的 gp241 蛋白,准确定位感染部位;

2、导弹部署:JukB 效应蛋白被招募至感染位点,组装成四聚体“穿甲弹”;

3、精确打击:JukB 在噬菌体的脂质囊泡上打孔,暴露其遗传物质给宿主核酸酶;

4、清除残骸:被破坏的噬菌体基因组在 15 分钟内被降解殆尽。



有趣的是,gp241 蛋白自带“定位器”——其跨膜结构域帮助 Juk 系统精准锁定感染部位,而可溶性结构域则作为激活信号。


跨物种的防御网络:Juk系统的进化智慧


对 5300 多个微生物基因组的分析显示,Juk 系统展现出惊人的进化适应性:


模块化设计:核心传感器 JukA 可搭配不同效应器 (磷脂酶、核酸酶等) ,形成多样化防御组合;

广泛分布:在变形菌门、蓝细菌等 21% 的已测序细菌中存在;

协同防御:常与其他免疫系统 (如限制修饰系统) 形成防御矩阵。


例如在荧光假单胞菌中,JukA 与磷脂酶融合形成“二合一”武器,通过分解噬菌体囊泡膜脂质实现防御。


新型抗菌疗法的曙光


这项突破不仅改写了对宿主-噬菌体互作的认知,更为解决抗生素耐药危机提供新思路:


1、精准抗菌:利用 Juk 系统的特异性,开发针对耐药菌的噬菌体疗法;

2、智能工程:将 Juk 元件植入益生菌,构建“活体抗菌剂”;

3、分子蓝图:JukB 的孔道形成机制为新型抗菌肽设计提供模板。


将 Juk 系统与现有抗菌策略结合,未来或可打造针对超级细菌的“定向精准打击系统”,为解决当前的抗生素耐药危机带来新思路。


李玉萍 博士为论文第一作者(现为瑞士巴塞尔大学助理教授),北京化工大学硕士研究生 关琳琳 论文第二作者,北京化工大学 冯越 教授、加州大学旧金山分校 Joseph Bondy-Denomy 教授及 李玉萍 博士为论文共同通讯作者。


论文链接
https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(25)00258-2







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