宏基因组Binning分析用它就能搞定！

在之前的宏基因组Binning分析的推送中，最常提到3类问题：1）如何研究目标菌群在群落中的功能；2）如何挖掘执行特定功能或携带某些特定基因的菌群；3）如何研究潜在的未知微生物。

往期回顾：

其实MAG分析就像做一顿饭…

研究微生物群落功能哪家强？MAG分析来帮忙！

一组数据发两篇文章的分析思路

然而 挖掘Binning数据需要大量探索和不断试错调整 ，面对这么多细菌MAG，刚入门不太熟悉分析的“小白”更是无从下手。不过没关系！Omicsmart带着新分析平台走来了！还在为找不到目标MAG而担忧吗？还在为不知道如何挖掘特定功能的MAG而焦虑吗？还在为不知道如何通过分析新类群多发一篇文章而苦恼吗？ 今天开始Omicsmart宏基因组Binning分析平台帮你搞定！ 下面一起来看看如何用Omicsmart解决Binning分析的问题吧~

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研究目标菌群的生态功能

通常挖掘目标菌群往往是在群落中丰度较高或在特定分组中富集的微生物，Binning分析平台可以通过物种分布分析多角度展示微生物群落分布情况，快速挑选目标微生物进行后续分析。

图1 物种分析发现Actinomycetota与Planctomycetota在特定分组显著富集

图2 筛选Actinomycetota与Planctomycetota的MAG重新分析

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分析功能菌群的分布特征

关注目标菌群的功能对于微生物研究也是十分重要的，Binning分析平台提供菌群功能分析的多种展示方式，帮助您快速了解目标菌群功能构成，尤其是对于研究抗性基因的分布评估抗性基因潜在的转移能力方面的研究十分有帮助。

图3 Pseudomonadota的基因组数量最多

图4 在Pseudomonadota的不同分类水平查看携带的主要抗性基因ARO组成

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探索潜在新微生物类群

在16S或标准宏基因组分析过程中，对于Unclassified的物种很难进行系统的研究，Binning分析平台可以保留特定分类水平的未知MAG进行研究，观察这些未知MAG的功能组成。

图5 筛选出属水平为Unclassified的Pseudomonadota基因组进行查看并用于后续分析

Binning分析平台已经正式上线Omicsmart啦！多维度筛选目标MAG为宏基因组Binning研究菌株基因组保驾护航！新平台还有更多功能等你解锁，有相关研究需求的小伙伴可以联系我们哟，让好的研究从今天开始！

基迪奥宏基因组Binning分析流程

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