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Illumina开始“反击”

生命科学产业观察  · 公众号  ·  · 2025-01-15 16:39

正文

有观点,有态度

这是生命科学产业观察公众号的第1243-3期文章


来源:循因缉药

无缘60万例样本,Illumina哭晕了


我们刚刚提到UKB-PPP选择了Olink+Ultima作为蛋白组学+测序的供应商,Illumina成为了最大的输家。


但是,Illumina并未坐以待毙。


事情很快走到了第二赛季,还是加强版。


那么,发生了什么?Illumina值得如此“兴师动众”吗?


下面,咱们就来聊一聊争夺蛋白组学(非质谱)话语权的第二赛季。


#01

疾速反击



就在UKB宣布其UKB-PPP项目(The UK Biobank Pharma Proteomics Project) 仅仅过去3天,Illumina就宣布反击


2025年1月13日星期一,Illumina宣布与UKB和生物医药合作者们启动50,000(5万)例蛋白组学试点项目。


如果考虑到UKB-PPP项目的宣布是1月10日,也就是周五,那么这也仅仅过去1个工作日,可谓进展神速。



这不禁让我想起一位故人...虽然强敌环伺,Illumina还是有底蕴的。


本项目,参与者除了Illumina以外还包括deCODE Genetics、Standard BioTools、Tecan、GSK、JnJ和Novartis。


这里可以看到,药企的参与率并不高。


恐怕其中一个重要的原因就是为了提高效率,减少联盟沟通协调的时间所做出的妥协。


因此,在文中Illumina也留了一个口子:“ Illumina anticipates that additional companies will join the consortium.”


那么,钱是这些药企出么?样本又来自哪里?



非也。


这5万例样本中前3万例样本资金将全部来自Illumina、deCODE Genetics和Standard BioTools。


Tecan出自动化仪器,并不出钱(不知道耗材收不收钱)。


并且,这部分数据在2025年下半年完成后将立即分享给科研研究者(另外2万联盟内成员优先)。


“没有给我项目不要紧,我自己出钱还不行吗?”


Illumina为啥这么着急着反击呢?还自己贴钱?


#02

“打擂台”



如果仔细看就会发现,本次UKB提供的5万例样本同样来自UKB-PPP项目!


这很明显 Illumina是想用自家的产品与Olink+Ultima打擂台


Illumina出测序仪、出试剂,Tecan出自动化、deCODE出管理协调和分析。



你别说,我脑子里只浮现出这4个字:合纵连横!


呃,等等,为啥Standard BioTools已经“嫁女”了也要出血?


一个可能是面对Olink的攻势,除了Illumina要证明自己的蛋白组学产品行以外,Standard BioTools也急需在同样的样品上打败(至少打平)Olink。


就算当年SomaLogic和Illumina的合作条款没有规定SomaScan要超越Olink,从未来竞争角度来考虑Standard BioTools这血也得出。


哦,对了,Illumina版本的SomaScan叫“Illumina Protein Prep(IPP,我随便缩写的)”。


看来Illumina对Prep这个词是真的很爱。


本次将使用Illumina Protein Pre+NovaSeq X Plus+DRAGEN Protein Quantification组成的Illumina“全家桶”,与Olink+Ultima进行全面对抗。


#03

“阳谋”


其实Illumian这招挺厉害的。


首先,时间上Illumina可能占优。


14家联盟出钱、协调都需要时间,而Illumina的联盟资金根本不是问题,而且参与者更少协调成本更低。


第二,争取科研圈好感。


3万例数据率先公开肯定能博得科研圈好感,激起科研圈使用IPP的兴趣。


众所周知,复读机是人类的本质,科研圈也一样。


第三,新技术beta测试。


虽然能检测6000种人类蛋白的IPP已经给合作伙伴早期测试了,然而IPP正式版本包括9000种蛋白检测能力显然也需要一个合适的展示舞台。


即便是只用6000的panel,也依然比Olink Explore HT的5000+多出20%。


你想想,如果科学家们被养刁了胃口,那以后会选谁呢?


当然,仅仅是针对Olink+Ulitma的反击还不够。


#04

“FPGA苦弱,GPU飞升”



众所周知,Illumina的DRAGEN平台用的FPGA(field-programmable gate array,现场可编程逻辑门阵列)方案。



该系统收购自Edico Genome,用于基因组分析显然没有任何问题。


只是,Illumina自己都可能没有想到,我们正在疾速进入A.I.时代。


Illumina自家的SpliceAI, PrimateAI-3D显然不太可能继续使用FGPA方案。


不说别的,你那玩意个客户,客户都不能玩黑神话...(划掉)


而A.I.目前的主流依然是GPU方案。



您猜怎么着?终于基因组学的巨头Illumina找上了皮衣男的Nvidia。


2025年1月13日,Illumina宣布与Nvidia达成合作协议,共同推动多组学、临床研究、A.I.应用和药物研发。



消息一出,Illumina开盘即暴涨超12%,随后收盘涨5.51%。


“FPGA苦弱,GPU飞升”啊。








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