专栏名称: 基因检测与解读
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病例分享-小心限制性胎盘嵌合导致的假阳性陷阱

基因检测与解读  · 公众号  ·  · 2024-11-25 07:00

正文

限制性胎盘的单基因拷贝数变异 (CNV) 虽然很少被发现,但可能具有临床意义。我们描述了一名孕妇,由于胎儿颈项透明层增加而被转诊进行绒毛取样。通过染色体微阵列在男性胎儿约 23-30% 胎盘细胞中发现了影响外显子 56 57 的杜氏肌营养不良症 (DMD) 基因的基因内缺失,并使用多重连接依赖性探针扩增 (MLPA) 证实。快速非整倍体检测显示结果正常,在母亲中未检测到缺失。随后对羊膜细胞的分析, DMD 基因结果正常,证实了为限制性胎盘嵌合。因此,本报告强调了在绒毛膜绒毛上检测到单基因 CNV 嵌合体后进行羊膜穿刺术的重要性,以排除限制性胎盘嵌合 (CPM) 。据我们所知,本报告仅标志着第二次记录在案的涉及基因内 DMD 缺失的 CPM 情况。

引言

在约 2% 的妊娠中观察到限制性胎盘嵌合 (CPM ),其特征是在胚胎外附件内存在遗传异常,但在胎儿组织中不存在。 CPM 主要与有丝分裂细胞分裂期间 ( 即合子后事件 ) 或减数分裂时(即合子前事件)以及随后的有丝分裂挽救期间发生的染色体不分离有关。根据最近的研究,染色体微阵列( CMA )在产前的广泛采用与传统核型分析相结合,逐渐将最初报道的绒毛膜嵌合体患病率提高到 4.1% 。因此,现在建议在检测到绒毛膜嵌合体后进行后续羊膜穿刺术,以排除真正的胎儿嵌合体。 CPM 涉及数字和结构染色体变异,然而,全染色体非整倍体仍然是最常见的发现,其次是超过 10Mb 的大拷贝数变异 (CNV) 。迄今为止,在绒毛膜嵌合体中仅报道了少量的亚显微染色体重排 ( 即低于 10Mb 的微缺失和微重复 ) ,包括 8 CPM ,包括 X 染色体的亚显微 CNV

Winerdal 及其同事在 2020 年报道了第一个也是唯一一个 CPM 对杜氏肌营养不良症( DMD MIM300377) 基因微缺失的描述,他们描述了男性胎儿 DMD 外显子 61 62 的嵌合基因内缺失。杜氏肌营养不良症 (DMD MIM310200) 是一种严重的、不断发展的、最终致命的 X 连锁隐性肌病,由 DMD 致病性变异引起,导致抗肌萎缩蛋白表达完全丧失。贝氏肌营养不良症 (BMD MIM300376) 是一种较轻的形式,由于 DMD 致病性变异导致抗肌萎缩蛋白表达改变但残留。据估计, DMD 的患病率为 1/20,000 ,使其成为最常见的肌病,也是人类最常见的遗传疾病之一。 2/3 DMD 是由位于外显子 3-9 45-55 的两个热点内的基因内缺失引起的,而 1/3 DMD 致病性变异是新发的。因此,相对于妊娠的继续,确定 DMD 基因内缺失的绒毛膜嵌合体具有重要的临床意义。据我们所知,本临床报告仅代表了第二次记录在案的涉及 DMD 基因的 CPM 情况。

临床报告

一名 28 岁孕妇 (G1P1) ,没有任何医学背景或家族史,由于孤立性胎儿颈部透明层增加 ( 大于第 99 个百分位 ) ,在胎龄 13 岁时被转诊至妇产科进行绒毛取样 (CVS) 。使用对 13 18 21 X Y 染色体具有特异性的 QF-PCR 进行快速非整倍体检测,核型正常,并确认胎儿染色体性别为男性。 CMA 偶然发现了 DMD 外显子 56 57 的半合子微缺失, [GRCh38]Xp21.2(31506767_31554324)x0, 即约 23% 的胎盘细胞( Log2 比率 =–0.371 ( 1A ,左图 ) 。未检测到其他 CNV 。多重连接依赖性探针扩增 (MLPA) 结果显示外显子 56 57 的基因内缺失的比率分别为 0.73 0.72 ,因此使用该技术估计嵌合体水平约为 30%( 1A ,右图 ) 。在母体血液 MLPA 检测 DMD 基因获得正常结果后 ( 数据未显示 ) ,建议对 16 胎龄孕妇进行羊膜穿刺术。随后对从未培养的羊膜细胞中提取的 DNA 进行的 CMA MLPA 未检测到 DMD 基因内缺失。这一结果证实了这种限制性胎盘嵌合 ( 1B) 。因此,停止了产前遗传分析。此后,妊娠继续正常进行。孕中期和孕晚期超声显示胎儿生长和羊水量正常,无明显形态学异常。随后,一名健康的富营养男性新生儿在胎龄 40 岁时分娩,在产房进行初步检查时表现出无明显特征。

1

讨论

报告 DMD 基因内缺失的 CPM 的存在对于参与妊娠管理的家庭和医生都很重要。鉴于无创产前检测 (NIPT) 的广泛使用,这变得更加必要, NIPT 目前适用于具有 21 三体高风险的妊娠,并允许检测主要非整倍体和大染色体重排。因此,这种进步需要了解与 CPM 相关的复发性 CNV 情况,以便明智地确定必须为孕妇提供羊膜穿刺术以排除假阳性 NIPT 结果的情况。

羊膜腔穿刺术是一种成熟且通常可靠的检测胎儿嵌合染色体重排 ( 包括单基因 CNV) 的程序。然而,值得注意的是,对羊水进行的遗传分析的敏感性取决于许多因素,包括所采用技术的分辨率、胎儿嵌合体的程度以及胎儿受影响组织的组织学类型。在胎儿胎盘嵌合体的情况下,绒毛和胎儿组织之间可能会出现嵌合体水平的差异。在随后对羊水进行的遗传分析中,这些变异可能会产生假阴性和假阳性结果,特别是由于 CMA MLPA 的嵌合检测阈值估计为约 20-25% 。因此,嵌合体水平的这种差异代表了解释遗传结果的重要限制,应传达给相关夫妇。

从分子生物学的角度来看,涉及 DMD 基因外显子 56 57 的基因内缺失,目前在 UMD-DMD 数据库 (http://www.umd.be/DMD/W_DMD/index.html) Treat-NMD DMD 数据库 (https://www.treat-nmd.org/what-we-do/coredatasets/dmd/) 中均未记录。根据摩纳哥规则,由于保留了开放阅读框,这种缺失预计会产生 BMD 表型。 DMD 基因呈现出高度复杂的结构,有七种选择驱动三种全长 Dp427 亚型和四种较短亚型 ( Dp260 Dp140 Dp116 Dp71) 表达的启动子。我们记录的缺失位于 Dp116 的转录因子结合位点内, Dp116 是一种由对应于外显子 56-79 的转录本编码的亚型。同样, Winerdal 及其同事最近描述的外显子 61 62 的基因内 DMD 缺失也位于 Dp71 特异性的转录因子结合位点内。这些观察结果表明 DMD 基因的这些内含子区域存在潜在的脆弱性。然而,虽然内含子不稳定性是







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