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师兄的晋升秘籍被我摸清了！中山大学BMJ单细胞测序天花板，临床医生可学的短平快套路，速学！

生信图书馆 · 公众号 · · 2025-02-22 19:00

正文

嗨喽~小伙伴们大家好！又到了馆长小课堂时间，单细胞测序在生物学领域是目前非常常见的一种分析手段，是在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观组等遗传信息进行高通量测序分析的一项新技术，结合生物信息学分析更能脱颖而出！

今天这篇由中山大学研究团队发表于 “BMJ journals” 期刊，核心内容关于胃癌腹膜转移（GCPM），探讨了肿瘤微环境中癌相关成纤维细胞（CAFs）和巨噬细胞的相互作用，以及它们如何影响免疫检查点阻断（ICB）治疗的效果。

Ps：无论你是刚刚踏入医学科研领域的新人，还是已经在科研中摸爬滚打多年的老手，SCI都是你无法回避的任务。与其在基础研究中苦苦挣扎，不如寻求一下我们得帮助！方案设计和生信分析馆长统统在行，快来滴滴我吧！

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l 题目：肿瘤微环境中的CAF-巨噬细胞串扰控制着胃癌腹膜转移对免疫检查点阻断的反应

l 杂志： BMJ journals

l 影响因子：IF=92

l 发表时间：2024年11月

请前往文末获取文献DOI哦~

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研究背景

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腹膜转移是最常见的胃癌转移方式，胃癌腹膜转移（GCPM）患者预后差，对常规治疗反应差。最近，免疫检查点阻断（ICB）在治疗GCPM方面显示出良好的疗效。最佳应答者的分层和阐明ICB治疗的耐药机制是高度重要的，并且仍然是主要的临床挑战。

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研究方法

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作者进行了一项II期试验，涉及使用ICB（sintilimab）联合化疗治疗GCPM的患者。收集了患者的原发肿瘤、GCPM和外周血样本，进行单细胞测序，以全面解释GCPM的肿瘤微环境及其对免疫治疗疗效的影响。

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主要结果

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1、单细胞RNA测序图谱揭示了GCPM中TME的组织特异性模式

图1 胃癌腹膜转移的研究设计及单细胞转录图谱

2、淋巴细胞的转录多样性将NKT细胞与 GCPM患者的免疫治疗反应联系起来

图2 淋巴细胞的风景

3、骨髓细胞的单细胞轨迹表明TRM是GCPM中TAM的主要来源

图3 骨髓细胞的景观和细胞轨迹

4、SPP1+ TAM与GCPM免疫治疗耐药相关

图4 肿瘤相关巨噬细胞与免疫治疗效果的关系

5、基质细胞的转录多样性确定THBS2+mCAFs是GCPM的肿瘤启动子

图5 基质细胞景观及基质细胞与免疫治疗效果的关系

6、THBS2+mCAFs和SPP1+ TAM的骨髓间质生态位通过C3- C3AR1轴介导FCPM的免疫治疗耐药

图6 成纤维细胞和巨噬细胞的相互作用主导了胃癌腹膜转移的免疫治疗反应

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文章小结

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