专栏名称: 生信媛

生信媛，从1人分享，到8人同行。坚持分享生信入门方法与课程，持续记录生信相关的分析pipeline, python和R在生物信息学中的利用。内容涵盖服务器使用、基因组转录组分析以及群体遗传。

生信练习题：如何根据FASTA的ID拆分数据

生信媛 · 公众号 · 生物 · 2020-03-31 13:57

正文

给定一个FASTA文件，他以多行形式存放数据，如下所示

请根据每个序列的ID中的染色体编号拆分数据，例如上面两个数据，需要新建两个文件，分别是chr7和chr8，将这两条序列分别输出到这两个文件中。

不限制语言，测试数据可以从网盘中下载。

链接：https://share.weiyun.com/5ecURT0 密码：pzsiab

我调用kseq.h文件，编写了一个程序，代码如下

运行速度如下

推荐文章

狮子座网 · 鼻.炎能根治？教你一个小技巧！

8 年前

教育百师通 · 男子打人致死却被免于刑罚，网友说判得漂亮！什么情况？

8 年前

大爱狗狗控 · 这只阿拉斯加每天都去偷邻居家的狗宝宝，而背后的原因却让人感动

7 年前

MBA商道思维 · 【原创】北方的天气

7 年前

火石创造 · 一家上市一家并购，研发助推器的CRO行业进入并购整合新常态

7 年前