The Plant Cell In a Nutshells: Casting a network to capture vascular development
文:Margot E. Smit, Siobhan M. Brady, and J. Peter Etchells,
译:Wei Hu, TPC Assistant Features Editor
Smit et al. 近期在The Plant Cell发表了题为A PXY-Mediated Transcriptional Network Integrates Signaling Mechanisms to Control Vascular Development in Arabidopsis的论文,发现了一个控制拟南芥维管束发育的一个前馈回路。
研究背景:维管束组织在植物体内转运水,盐分和光合产物。木质部从根部向上运输水和盐分,韧皮部则在整株植物中分配水和糖分 。随着植物的生长,部分地由于木质维管束组织的扩张,茎会长厚。位于木质部和韧皮部之间的干细胞分裂并发育成木质部和韧皮部。这些细胞分裂增加了维管束组织的大小,并为植物提供了结构支持。基于维管束组织的重要性,干细胞的分裂和命运必须加以严格调控。控制维管束干细胞的细胞分裂速率或其木质部/韧皮部命运的好几种蛋白已被发现。
核心问题:PXY控制维管束干细胞的分裂速率,它也在将木质部和韧皮部组织到两个分离域的过程中起作用。但我们不知道PXY是如何控制这两个独立的过程。我们的目标是鉴定出有助于解释PXY角色的遗传互作。
研究发现:我们研究了拟南芥维管束基因的转录调控。通过使用增强的酵母单杂交分析法,我们鉴定了DNA结合蛋白与 DNA调控序列之间的相互作用。从690种相互作用中我们构建了一个潜在的转录调控网络。此网络包含一个有趣的受控于PXY的前馈回路。在我们的网络中,LBD4受到WOX14和TMO6的双重调节,但WOX14也调节TMO6。结果,WOX14以两种方式影响LBD4:直接和间接地通过TMO6。我们研究了这些成分之间的遗传互作,发现PXY调节此前馈回路的组分来控制维管束干细胞的分裂。此外,PXY对LBD4的调控也标识了在干细胞和韧皮部细胞之间的边界。因此,我们确定了PXY用来调节维管束干细胞分裂速率和命运分离的遗传机制。
研究展望:面临的挑战是要了解网络交互在发育过程中如何以细胞类型特异的方式进行改变,以及鉴定出那些在进化中被修改的交互。木材是重要的生物材料和碳池。我们所解析的网络为旨在改良植物以最大化木材形成的实验提供了基础。
论文链接:
https://doi.org/ 1 0.1105/tpc.19.00562
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