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如何扔一个“关键词”进去,出来一个课题?

科研者之家  · 公众号  ·  · 2024-07-25 21:34

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查文献 始终是科研人员头痛的一件事儿,一大堆英文文献,你可能看的泪流满面抓耳挠腮。


某一天,导师扔给你一个研究对象,比如 三阴性乳腺癌


1.问你已知相关的 信号通路 基因 ,有哪些?


2.这些基因和信号通路各自在最近几年的 研究热度 都如何?


3.然后据此设计个课题


你会怎么办?查文献?太慢!问师姐?人家要约会啊。


别急,这个时候你需要一个叫 “课题思路助手” 的检索神器。


第一步: 扔进你的关键词,中英文均可,比如就lu 三阴性乳腺癌



一键查询,系统告诉从文献中查出与三阴性乳腺癌相关的基因有 366个 ,信号通路 29个



词云更直观的显示,相关基因中 BRCA1和EGFR 比较相关,信号通路和 自噬,铁死亡 等相关。 其实这个时候你已经对这个疾病的研究方向有一定印象了。


咦,BRCA1可以理解,毕竟当年安吉丽娜朱莉切双乳就是因为BRCA1突变。但EGFR不是通常和肺癌有关么,带着这个疑问我们继续往下:


点击基因的词云,进入到具体详情,结果页标注了每个基因的结果数。最高影响因子28.25,总影响因子达到192.53,左侧可以对 年份 文本类型,影响因子 进行筛选。



选择刚才疑问的EGFR,点进去可以看到具体文献里的内容,浏览一下,可以得出结论,原来 EGFR 因其可通过JAK/STAT3信号通路 促进三阴性乳腺癌,所以可以成为潜在的治疗靶点。 点击 语料来源 即可到文献原文,点击 期刊名 即可查看期刊具体详情。


通过时间轴的角度分析年度基因数目的变化,来鸟瞰其基因研究热度



从热图中可以观察 某个基因 在不同年份的热度,比如 BRCA1和EGFR,STAT3 都是近几年比较热的基因。


通过以上简单的分析,相信对三阴性乳腺癌的 基因 及其研究趋势,热点都有大致了解。



接下来看下和三阴性乳腺癌相关的信号通路,我们可以看到相关有 铁死亡,焦亡,Wnt通路,mTOR通路,MAPK通路 等点击右边的通路详情和参考文献可以直接连接到 KEGG数据库 的相关页面,非常方便。



比如点Wnt通路,进去后就可以看到具体文献内容。


总之,通过这个工具,我们可以高效率对某一个关键词,它可以是基因,可以是信号通路,也可以是某一个表型或病种,通过海量文献找到与其相关的基因和信号通路, 或高效了解某一个陌生领域,或找基因、信号通路之间的相互关系。 只要抓住基因和信号通路两条线,那课题就思路就不是难事。


比如我们通过检索发现, A功能可以由x基因高表达促进,同时A功能又可以由y通路的激活促进,那x和y大概率就是协同的,于是我们的课题就可以是x基因高表达激活y通路来促进A功能


摘要部分大致是这样的:

近年来,关于促进A功能的机制仍然不清,已知y通路是其关键通路,而x之前被发现可以促进A功能,但x是否通过y来促进及其具体促进机制尚不清楚,在这里,我们.....


Enjoy it!


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