7500万美元！明星风投公司Flagship又有大动作，数万新型蛋白质已被发现...

Flagship是美国风投界的“神话”，其以超高的投资成功率和特殊的投资模式而备受关注。目前已经培育孵化超过100家生命科技公司，其中超过20家成功上市，另有30余家通过收购/并购形式继续发展。

2020年，在由Bay Bridge Bio进行的最佳顶级生物科技风险投资基金评选中，Flagship Pioneering以接近30亿美元的投资回报成绩位居“以IPO退出获利最多的风险投资公司”榜首的位置，领先第二名超过40%。其最成功的案例莫过于“生物科技IPO之王”——Moderna的孵化与上市。

Flagship能成为最成功的投资公司之一，恰恰是因为其并非“纯粹”的投资公司，而是将学术界、产业界、资本三方连接起来，将自己变成了一家“完全整合的生命科学创新企业”。

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斥资7500万美元孵化新公司

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什么是蛋白质宝库？

蛋白质是构建细胞的结构成分，还是构成细胞内干物质的主要成分。此外，蛋白质还参与几乎所有的细胞功能。 蛋白质由20多种不同的氨基酸构成 。 在每种类型的蛋白质中，氨基酸具有特定的顺序，被称为氨基酸序列。

每个蛋白质通常只形成一种稳定构象。 蛋白质一旦进化到稳定构象并带有有用特性时，它的结构可以随着时间推移而稍作修饰并使之具有新的功能 。 已有研究显示，人类DNA序列中 只有大约2%为蛋白编码序列，然而大约80%的DNA序列被转录成RNA 。 这些序列的功能仍然未能被完全揭示。

1972年，日本遗传学家大野乾提出了 “垃圾”DNA （“junk”DNA）概念，用来描述基因组中不能够编码蛋白质的DNA序列。21世纪初期，完成的人类基因组“天书”解读发现人类编码蛋白的基因总数不超过25000，这些DNA只占基因组的1%～1.5%，再除去3%左右的调控元件DNA，剩余的95%以上的DNA序列是没有任何功能的“垃圾”DNA。

科学家发现， 一部分“垃圾DNA”中含有能够调节基因的DNA ，可以决定何时及如何激活或关停基因。它们还可以作为转录因子与DNA结合的场所，对转录过程进行调节。

在科学家将蛋白质编码基因的估计数量削减到大约20500个的15年后， Flagship Pioneering 新成立的ProFound Therapeutics公司表示，可能还有数万个。 这个新的存储库是通过对参与翻译的潜在蛋白质的研究发现的。新蛋白质的发现有效地使已知储存库增加了一倍以上，并为潜在的治疗靶点开辟了新的探索领域。

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关于蛋白质的教条规则指什么？

解析一个蛋白质的结构通常从它的氨基酸序列入手 ，这可以通过多种方法来完成。许多年来，蛋白质测序可以通过直接分析纯化的蛋白质中的氨基酸来完成；第一个测序完成的蛋白质是胰岛素，它的序列于1955年公布。

如今， 通过测定编码蛋白质的基因序列，我们能够很容易地间接确定蛋白质的序列 。 一旦确定编码某种蛋白质的DNA序列，就可以利用遗传密码将其翻译为氨基酸序列。迄今，研究人员已经用这种方法确定了数百万种蛋白质的氨基酸序列。

Kahvejian说，“这是 从一个基因中获得一个转录本对应的一个蛋白质 这一教条的扩展 。 在某些方面，这是对我们已知教条的改变，我们只有2万个蛋白质编码基因和它们的变体。我们确实认为这是一个意义深远的工作领域，但不一定是我们的专属领域，而是整个社会都会感兴趣并从中受益的领域。”

Kahvejian说，“这主要是人们用来筛选基因组来预测哪些可能是蛋白质编码基因，哪些不是蛋白质编码基因的规则。我们认为，这些规则一开始就太过束缚，也有点太过刻板。”

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新的蛋白质是如何发现的？

目前，科学家们用两种主要的方法来确定蛋白质精确的三维构象。 一种是通过X射线晶体学，另一种是通过核磁共振（NMR）光谱学 。 目前我们已经获得超过20000个蛋白的三维结构。这些结构被存档在大型的公共数据库中，供大家使用。

世纪之交的人类基因组计划（Human Genome Project）揭示了2万个蛋白质编码基因，几年后， 人们发现基因之间的区域可能在产生RNA方面发挥积极作用 。

国际著名的三大蛋白质数据库有UniProt数据库、The Human Protein Atlas数据库、PhosphoSitePlus数据库。