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我一个博士生天天看各种衰老的文献!看了这华中科技大学的14.6分钙离子失调相关细胞衰老,看完我觉得自己也快衰老了……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2025-01-19 08:20

主要观点总结

这篇文章探讨了蛋白的CMA降解导致钙离子失调进而引发细胞衰老的机理。具体地,文中以华中科技大学的博士生发表的文章为例,详细解释了CMA(分子伴侣介导的自噬)在IVDD(椎间盘退化)疾病中的作用。文章的关键点包括CMA降解途径、CMA与细胞衰老的关系、CMA与PLCG1蛋白的关系以及CMA在IVDD中的作用等。

关键观点总结

关键观点1: 蛋白的CMA降解导致钙离子失调。

CMA是一种蛋白质降解途径,LAMP2A和HspA8结合蛋白将蛋白拽进溶酶体进行消化降解。在IVDD进程中,CMA的失调参与介导了TNF诱导的细胞衰老。

关键观点2: CMA与细胞衰老的关系。

炎症因子触发的NPC(髓核细胞)衰老是IVDD的主要病因。TNF等炎症因子刺激NPC后,LAMP2A的表达明显降低,导致CMA水平降低,进而引发细胞衰老。

关键观点3: CMA与PLCG1蛋白的关系。

PLCG1是CMA的底物之一,通过CMA调控蛋白降解。PLCG1的累积会导致钙离子失调,进而引发细胞衰老。CMA的缺陷正是通过促使PLCG1累积,引发了TNF诱导的细胞衰老。

关键观点4: CMA在IVDD中的作用。

文章探讨了CMA在IVDD疾病中的重要作用,并通过对PLCG1的研究验证了这一作用机制。文章还指出了未来研究的方向,如找出被CMA降解的蛋白以及打破钙离子通道平衡的途径等。


正文

今天这篇文章讲的是蛋白的 CMA 降解导致钙离子失调,进而引发细胞衰老的事儿。这是华中科技大学协和医院的博士生发表在影响因子 14.6 分的《Autophagy》上的文章CMA,也就是分子伴侣介导的自噬,是 HspA8 和 LAMP2A 结合蛋白,进入溶酶体降解的过程,不熟悉的小伙伴可以去翻翻《信号通路是什么鬼?》系列里 CMA 的相关章节,回回炉。这类 CMA 相关的文章平时不多见,这篇算是挺好的了。

CMA 本质上就是一种蛋白质降解途径,LAMP2A 和 HspA8 先结合蛋白,然后把蛋白拽进溶酶体,一顿消化降解。这篇文章聚焦于 IVDD(椎间盘退化)疾病中的 CMA。在 IVDD 进程中,细胞衰老的标志,像 TP53、CDKN1A 和 CDKN2A 的表达都会蹭蹭往上涨(对细胞衰老一脸懵的同学,老规矩,《信号通路是什么鬼?》系列里细胞衰老的章节能帮你解惑,里面对细胞衰老以及 SASP,也就是细胞衰老分泌表型都有详细解释)。炎症因子触发的 NPC(髓核细胞)衰老,是 IVD 的主要病因。用 TNF 这样的炎症因子刺激 NPC 后,细胞内 LAMP2A 的表达明显降低,于是他们假设TNF诱导的细胞衰老,可能有CMA的失调参与介导

为了验证这个假设,他们用了 KFERQ - PA - mCherry - 1 这种荧光标记来分析 TNF 刺激后的 CMA 水平(要是看过《信号通路是什么鬼?》系列里 CMA 和自噬相关章节,理解这个实验原理就轻松多了。KFERQ 这个蛋白序列,是 HspA8 结合的氨基酸序列,HspA8 会和 LAMP2A 一起把 KFERQ - PA - mCherry - 1 送进溶酶体,而且 mCherry 的荧光在溶酶体酸性条件下还不会淬灭)。结果发现,TNF 刺激后 NPC 细胞的 CMA 变弱了,主要原因就是 LAMP2A 表达下降。而过表达 LAMP2A 后再看 TNF 对 NPC 细胞衰老的诱导,发现 CMA 增强了,能有效抑制 TNF 诱导的细胞衰老。


为了搞清楚 CMA 对 NPC 细胞到底有啥影响,他们用了 CMA 抑制剂,然后对 NPC 细胞进行二代测序。结果显示,CMA 被抑制后,钙离子通路在 NPC 细胞里显著富集,再分析钙离子浓度,看来钙离子通路很可能就是引发细胞衰老的关键。通过抑制钙离子通道(这就是柯霍氏法则的验证,抑制钙离子通路,看看 CMA 对 TNF 诱导的细胞衰老的影响是不是通过钙离子通路实现的,不了解柯霍氏法则的,可以瞅瞅《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》和《轻松的文献导读》),他们成功验证了这个假设。

新问题来了,CMA 过程中消化的到底是什么蛋白?又是通过啥途径打破钙离子通道平衡的?关键就在于找出被 CMA 降解的蛋白。他们分析了含有 KFERQ 序列的蛋白,还通过免疫共沉淀,研究能和 HspA8、LAMP2A 结合的蛋白,最后找到了 PLCG1 这个潜在的 CMA 靶标底物。PLCG1,也就是磷脂酶 Cγ1,能催化 IP3(肌醇 1,4,5 - 三磷酸)产生,还能激活 ER 中的 ITPR,导致细胞钙浓度上升。

接下来就得验证 PLCG1 是不是真受 CMA 调节。大家都知道,蛋白降解途径可不少,像自噬、UPS(泛素化 - 蛋白酶体系,这里面涉及 E2 和 E3 连接酶,给底物加上泛素化标记,再由蛋白酶水解,《信号通路是什么鬼?》系列里也有介绍)等。为了弄明白自噬或者 UPS 对 PLCG1 降解有没有影响,他们分别分析了 PLCG1 的泛素化情况,还用 3MA 抑制自噬体和溶酶体结合,阻止 PLCG1 的自噬降解。结果发现,这些操作对 PLCG1 表达水平都没啥影响。CMA 降解蛋白不走寻常路,既不需要自噬体和溶酶体结合,也不用泛素化标记,靠的是 LAMP2A 识别 PLCG1 蛋白上的 KFERQ 序列,直接把蛋白拉进溶酶体。结果表明,PLCG1 确实是通过 CMA 调控蛋白降解的。

为了进一步验证 PLCG1 是 CMA 的底物,他们用了更精准的方法,对 PLCG1 的 KFERQ 序列进行突变。突变后的 PLCG1 没法再和 HspA8、LAMP2A 结合,自然也就不受 CMA 调控降解了。

然后他们敲减 PLCG1,想看看 PLCG1 是不是 CMA 影响 TNF 诱导的细胞衰老过程中的关键一环(不过这个环节用敲减验证不太严谨,敲减后很难说就是 CMA 造成的 PLCG1 影响,可能会把问题复杂化。要是用 PLCG1 在 KFERQ 序列上的突变进一步验证,就能避免肯定后件的逻辑谬误,让整个验证更严谨。不明白肯定后件逻辑谬误的,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列)。研究发现,CMA 影响 PLCG1 表达后,PLCG1 累积会导致钙离子失调,进而引发细胞衰老。

CMA 的缺陷正是通过促使 PLCG1 累积,引发了 TNF 诱导的细胞衰老。

最后,他们总结出这样一个示意图,正常 NPC 细胞里,PLCG1 通过 CMA 调控降解,形成良性循环;TNF 诱导后,CMA 机制衰退,PLCG1 累积,导致钙离子浓度升高,引发 NPC 细胞衰老而 NPC 细胞衰老又是引发 IVDD 疾病的关键。


这篇文章整体做得相当不错,要是最后验证 PLCG1 的时候,能通过突变 PLCG1 的 KFERQ 序列来体现,就能把 CMA 和 PLCG1 的表达更直接地联系起来,比直接敲除 PLCG1 可强太多了。今天就聊到这儿,感兴趣的小伙伴可以去看看原文,祝大家看文献的时候思路清晰,一眼看透!

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