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常用生信图表代码示例全部可COPY!

基迪奥生物  · 公众号  ·  · 2024-10-06 11:00

正文

入坑生信,不少科研人都需要自学R语言,以完成分析或下游绘图。直接啃厚厚的书本太过生涩,有没有更容易入门的学习方式呢?往期分享过不少绝绝子的R语言学习资源,如R Cheatsheets、The R Graph Gallery、ggplot2 extensions、Awesome ggplot2等,详情戳 《分享5个好用的R语言绘图学习资源》

对于代码而言,逐行运行跟练,是最快捷的掌握途径之一。今天继续为大家分享一个R语言绘图代码示例网站 R CHARTS

官网链接: https://r-charts.com/

网站的使用非常简单,进入首页,可看到将常用图表划分为8个类别,如分布、相关性、演化、空间、流动等:


以第一个 Distribution 为例,点击即可查看有哪些用于展示数据分布特征的图表,这里将 蜂群图、箱线图、小提琴图、密度图、散点图、哑铃图、直方图、山脊线图等划分到了这个类别中。


点击上方图表栏,可收缩仅展示目标图表类别。如我们只想查看山脊图,点击 R idgeline 即可,绘图代码又分为R基础绘图以及ggplot2绘图,也可以按需筛选。


点击即可进入代码示例页面,常用功能、参数注解可帮助我们快速get这个R包的最核心功能,代码也可一键复制,自己逐行运行巩固。


其它类目用法相同,如相关性类别中收录了相关性分析可视化相关的图表:


Part of a whole 类目则收录了韦恩图、条形图、树状图、饼图、华夫饼图、沃罗诺伊图等能够展示整个图表的一部分以部分或切片的形式汇总的数据类型。


除此以外,点击上方菜单栏的 BASE R 可以进入R中各大重点基础函数的学习:


点击 COLOR PALETTES 可直接查看来自16个常用配色R包中的497个调色板合集,连续型、离散型和动态型色板都可点击左方导航快速跳转。


学习资源千千万,行动起来最重要!好啦,今日分享毕!更多科研干货、绘图技能欢迎关注基迪奥生物副号SCIPainter!





基迪奥生物是定制化组学测序与生物信息分析服务领域的领先者,公司组学服务涉及单细胞组学、空间组学、翻译组、基因组等40条业务线,特别在多组学联合分析方面有丰富的项目经验和大量的客户文章案例,欢迎留言咨询!

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