今天要给你们这些新入学的孩子们好好科普一下啥是circRNA。
circRNA是啥？就是环状RNA，是不是觉得很厉害，觉得最近才发现这玩意呢？其实也不是，早在1969年，就发现有这样的RNA了。那时候有个叫Diener的人，用电镜发现了马铃薯纺锤块茎病(potato spindle tuber disease)的病株上，有形成闭合环状的RNA。
这个时候发现的，其实就是所谓的类病毒（Viroids），一些没有蛋白外壳，但是能致病的东西。
当然，这和我们现在说的circRNA还是有一定区别的。我们现在研究的circRNA是可变剪接的结果。首先，我们要知道，mRNA形成的过程中，先要剪掉内含子，然后再把外显子接到一起：
当然，这种剪接的过程中，“接”这步是会出现变化的，那就会形成很多剪接异构体：
有时候是DNA模板本身某个外显子加倍，会导致接出来的mRNA变成这样，中间有重复外显子：
有时候是两条RNA在混剪的时候发生了鬼畜：
这种剪接的异构，特别是像上图这样Exon2的头，会接到Exon3的尾上去的这种现象，很容易导致形成了这样的首尾相连：
也就是Exon2的5'端接到了Exon3的3'端上去:
于是，就产生了这样三种情况，环状的，正常的，有重复外显子的：
那要怎么样检测这三种RNA呢？下面是测序的方法告诉我们的：
RNAseq测序的话，会得到很多个Reads，也就是片段化的序列，这些序列会通过和整个基因组的比对，bia回原位，但是如果是环状的话，就会导致这个Reads的两头，bia到不同方向的位置上，虚线表示他们的连接。这样bia错的序列，就会被注释上是circRNA。
普通的检测，就是通过PCR。蓝儿，普通的引物进行circRNA的检测的话，和mRNA没啥区别。所有circRNA的引物是反向设计的，就像下面这样：
